大白猪和二花脸猪妊娠后期胎盘转录谱比较及印记基因鉴定研究的开题报告

大白猪和二花脸猪妊娠后期胎盘转录谱比较及印记基因鉴定研究的开题报告开题报告一、研究背景和意义胎盘是母体和胎儿之间的重要交流器官，不仅可以提供营养、氧气和排泄代谢产物，还可以通过分泌多种激素和生长因子调节胎儿和母体的代谢和免疫状态。研究胎盘的转录谱可以揭示其在胎儿生长发育和母体适应妊娠过程中的分子调控机制。鉴定胎盘印记基因，即只在父或母亲的基因中表达的基因，可以帮助确定胎儿遗传信息的来源，监测母体和胎儿的健康状况。大白猪和二花脸猪是常见的养殖猪种，其产仔数量和品质对养殖业的发展至关重要。然而，这两个品种在妊娠过程中的胎盘转录谱和印记基因表达差异仍未被充分研究。本研究旨在借助高通量测序技术和生物信息学分析手段，比较大白猪和二花脸猪胎盘转录谱的差异，鉴定印记基因并分析其在猪妊娠适应性和遗传调控中的作用，为育种和猪健康管理提供科学依据。二、研究内容和方法1.研究内容(1)比较大白猪和二花脸猪妊娠后期胎盘转录谱差异；(2)鉴定大白猪和二花脸猪胎盘中的印记基因；(3)分析印记基因在猪妊娠和遗传调控中的作用。2.研究方法(1)实验动物和样本采集：选取12头大白猪和12头二花脸猪，分别从妊娠后期胎盘中提取RNA样本。(2)RNA测序和数据分析：采用IlluminaHiSeq平台进行RNA测序，利用STRING、GO和KEGG数据库进行转录谱分析。通过基因家族、调节因子和信号通路分析揭示差异表达基因的生物学功能。利用DIP-seq技术鉴定印记基因。(3)实时荧光定量PCR检测:利用实时荧光定量PCR技术对转录组分析结果进行验证。三、预期结果和创新性(1)比较大白猪和二花脸猪妊娠后期胎盘转录谱的差异，鉴定差异表达基因和相关信号通路，为猪生殖管理和育种提供科学依据。(2)鉴定大白猪和二花脸猪胎盘中的印记基因，探讨其在猪妊娠和遗传调控中的作用，为养殖业健康管理提供理论支持。(3)本研究采用高通量测序技术和生物信息学分析手段，为研究胎盘转录谱差异和印记基因鉴定提供了新思路和新方法，具有一定的创新性。四、研究进度本研究计划于2021年6月开始，数据分析和实验验证预计完成时间为2022年6月，论文撰写预计在2022年9月前完成。五、参考文献1.FowdenAL,ForheadAJ.Endocrineregulationoffeto-placentalgrowth.HormRes.2009;72(5):257-265.2.ChelbiST,VaimanD.Geneticandepigeneticfactorscontributetotheonsetofpreeclampsia.MolCellEndocrinol.2008;282(1-2):120-129.3.TunsterSJ,OddieTH,JohnRM.TheimprintedgeneGrb10isaregulatorofembryonicandplacentalgrowthinmice.BiolReprod.2011;84(1):122-130.4.WangL,Johnson-RestrepoB,ClarkL,etal.Identificationofaplacental-specificIGF-IIgeneanditspotentialroleinfetalgrowth.MolEndocrinol.1999;13(12):2079-2090.6.CuiSS,KongF,WangXY,etal.Identificationandcomparisonofimprinting-relateddifferentiallyexpressedgenes