生物医学数据库检索方法与技巧讲义整理课件

北京大学医学图书馆信息咨询部liucy@PubMed生物医学数据库检索方法与技巧PubMed生物医学数据库检索方法与技巧1主要内容PubMed概况

PubMed数据来源PubMed检索机制PubMed检索运算符PubMed检索方法结果的显示、打印、保存其他辅助功能主要内容PubMed概况21.PubMed概况创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国生物技术信息中心(NCBI)1997年6月开始向全球开放特色：具有收录范围广、内容全、检索途径多、检索体系完备等特点，部分文献还可在网上直接免费获得全文。1.PubMed概况创建机构：美国国家医学图书馆下设的美国32.PubMed数据来源MEDLINE：

[pubmed-indexedformedline]InProcessCitations：每天收录，尚未经规范处理的数据。[pubmed-inprocess]Publisher-SuppliedCitations：由出版商提供的电子文献，每条记录标有[PubMed-assuppliedbyPublisher]。2.PubMed数据来源MEDLINE：43.PubMed检索机制自动转换匹配功能(AutomaticTermMapping)3.PubMed检索机制自动转换匹配功能5对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配和转换，再进行检索。词表匹配转换顺序是：MeSH表期刊刊名表短语表作者索引如果在以上4个表中都找不到相匹配的词，PubMed将把短语分开，以单词为单位，分别重复以上的过程，检索时各个词之间是AND逻辑关系。如果仍找不到相匹配的词，则用单个词在所有字段查找，各个词之间也是AND逻辑关系。3.1自动转换匹配功能对于输入的检索词，PubMed先按一定的词表顺序进行对照匹配6人重组三叶因子（humanrecombinanttrefoilfactor）

("humans"[MeSHTerms]OR"humans"[AllFields]OR"human"[AllFields])

ANDrecombinant[AllFields]

AND("trefoilfactor"[SupplementaryConcept]OR"trefoilfactor"[AllFields])人重组三叶因子（humanrecombinanttref74.PubMed检索运算符逻辑运算符4.PubMed检索运算符逻辑运算符8逻辑运算符①逻辑“与”运算AND：

检索式写成AandB，表示文献中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。

AIDSandtherapy②逻辑“或”运算OR：

检索式写成AorB，表示包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。

AIDSorAcquiredImmunodeficiencySyndrome③逻辑“非”运算NOT：

检索式写成AnotB，表示包含检索词A同时不包含检索词B的文献为命中文献。

HepatitisnotAnimal逻辑运算符①逻辑“与”运算AND：9IP地址：PubMed网址PubMed网址10基本检索高级检索主题检索临床咨询基本检索高级检索主题检索临床咨询115.PubMed检索方法5.1基本检索5.2高级检索5.3主题检索5.4临床咨询5.PubMed检索方法5.1基本检索125.1基本检索默认检索字段为主题、作者、期刊5.1基本检索默认检索字段为主题、作者、期刊13关键词、词(词组)或短语：⑴输入任意关键词：livercancer、Lungcancer；⑵带有双引号”

”作为短语检索：”cancertherapy”；⑶带有连接号”-”作为一个词组检索：interleukin-6。限制检索字段：如livercancer[ti]作者：SmithJ、仅知道作者姓，则必须加上字段标识，如：Smith[au]2002年以后的文献若文中有作者全称可用全称检索如：JoshuaLederberg5.1基本检索关键词、词(词组)或短语：5.1基本检索14期刊刊名：⑴可用期刊全称：GENETHERAPY[TA]；

⑵可用期刊简称：JAMA[TA]；(TheJournaloftheAmericanMedicalAssociation)

复杂表达式：livercancerANDtherapy带有摘要文献的检索：livercancerANDhasabstract5.1基本检索期刊刊名：5.1基本检索15分析该检索课题，包含两个方面：肝癌：livercancer；酒精：alcohol两个主题之间的逻辑关系是AND，即livercancerANDalcohol

基本检索举例：肝癌和酒精的关系分析该检索课题，包含两个方面：基本检索举例：肝癌和酒精的关16基本检索举例：肝癌和酒精的关系输入：livercancerANDalcohol基本检索举例：肝癌和酒精的关系输入：livercancer17“肝癌和酒精的关系”的基本检索结果“肝癌和酒精的关系”的基本检索结果185.2高级检索高级检索5.2高级检索高级检索195.2高级检索5.2高级检索20分析该检索课题，包含两个方面：作者为：马大龙（madl）；作者单位为：北京大学（pekinguniversity）。

高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献分析该检索课题，包含两个方面：高级检索举例：北京大学医学部21高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献输入：madl输入：pekinguniversity高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献输入：ma22高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献高级检索举例：北京大学医学部马大龙教授发表的文献235.3主题检索根据medline数据主题标引的规范性，利用主题词进行的研究，对提高查全率、查准率会有相当的帮助。点击MeSHDatabase打开主题检索界面5.3主题检索根据medline数据主题标引的规范性，利用24高级检索主题检索基本检索高级检索主题检索基本检索255.3主题检索5.3主题检索26主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献分析该检索课题，有2个概念：长春新碱（Vincristine）、白血病（leukemia）：对长春新碱来说是利用其治疗疾病，故其应组配副主题词“治疗应用（therapeuticuse）”；对白血病来说是利用药物来治疗，故其应组配副主题词“药物疗法（drugtherapy）”。同时这两个概念之间是AND的关系。主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血27主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血28主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血29主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用副主题词主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血30主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血31主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第1步：检索长春新碱/治疗应用主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血32主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第2步：检索白血病/药物疗法主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血33主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第2步：检索白血病/药物疗法主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血34主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第2步：检索白血病/药物疗法主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血35主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献第2步：检索白血病/药物疗法主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血36主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血病（leukemia）的文献主题检索举例：

长春新碱（Vincristine）治疗白血375.4临床咨询和系统评价可以使用户方便快捷地检索到有关临床方面的文献，如临床疾病的诊断、治疗、病因和预后等；也可以用它来检索临床实践过程中遇到的一些具体问题，如系统性综述、元分析、临床试验、循证医学、实践指导以及有关遗传学方面的问题等。

5.4临床咨询和系统评价可以使用户方便快捷地检索到有关临床385.4临床咨询和系统评价临床咨询系统评价检索医学遗传学研究方面的文献5.4临床咨询和系统评价临床咨询系统评价检索医学遗传学研究39生物医学数据库检索方法与技巧讲义整理课件406.结果的显示、打印、保存显示保存、打印6.结果的显示、打印、保存显示416.1结果的显示显示格式：系统提供的显示格式很多，一般较常用的有以下4种：（1）Summary：为默认显示格式。显示的信息包括文献的标题、著者、出处、PMID、综述出版类型、非英文文献的原文语种等。（2）Abstract：显示信息除了文献标题、著者、出处等基本信息外，还包括摘要信息，以便用户了解文献详细内容。6.1结果的显示显示格式：系统提供的显示格式很多，一般较常42（3）MEDLINE：以MEDLINE数据库的记录格式来显示检索结果。字段内容主要包括PMID、题目、摘要、作者、作者地址、语种、出版类型、出处、MeSH、文献ID、出版状态等。6.1结果的显示（3）MEDLINE：以MEDLINE数据库的记录格式来显示436.1结果的显示6.1结果的显示44保存记录在“sendto”下拉菜单中选择“File”，可完成将记录保存为文件。选择“E-mail”，则可将结果发送至邮箱。在检索结果显示页面可将某一次检索的全部记录或标记记录保存；而“Clipboard”页面可用于保存一次或多次检索的结果记录。6.2检索结果的保存

保存记录6.2检索结果的保存456.2检索结果的保存

6.2检索结果的保存467其他辅助功能7.1检索策略的存储和调用7.2全文链接7.3相关文献链接7其他辅助功能7.1检索策略的存储和调用477.1检索策略的存储和调用使用MyNCBI(Cubby)首先要登记注册保存检索策略定期浏览新的检索结果7.1检索策略的存储和调用使用MyNCBI(Cubby)487.2全文链接-摘要格式显示

7.2全文链接-摘要格式显示

497.2全文链接-打开单篇详细页面

7.2全文链接-打开单篇详细页面

507.3相关文献链接7.3相关文献链接517.3相关文献链接7.3相关文献链接52检索练习眼结核（OcularTuberculosis）引起失明（Blindness）的文献年代限定1999－2008年检索有关“医院水净化（WaterPurification）管理”方面的综述文献检索练习眼结核（OcularTuberculosis）引53Questions?Thanks!电话：82801292-608liucy@Questions?54

1、想要体面生活，又觉得打拼辛苦；想要健康身体，又无法坚持运动。人最失败的，莫过于对自己不负责任，连答应自己的事都办不到，又何必抱怨这个世界都和你作对？人生的道理很简单，你想要什么，就去付出足够的努力。

2、时间是最公平的，活一天就拥有24小时，差别只是珍惜。你若不相信努力和时光，时光一定第一个辜负你。有梦想就立刻行动，因为现在过的每一天，都是余生中最年轻的一天。

3、无论正在经历什么，都请不要轻言放弃，因为从来没有一种坚持会被辜负。谁的人生不是荆棘前行，生活从来不会一蹴而就，也不会永远安稳，只要努力，就能做独一无二平凡可贵的自己。

4、努力本就是年轻人应有的状态，是件充实且美好的事，可一旦有了表演的成分，就会显得廉价，努力，不该是为了朋友圈多获得几个赞，不该是每次长篇赘述后的自我感动，它是一件平凡而自然而然的事，最佳的努力不过是：但行好事，莫问前程。愿努力，成就更好的你！

5、付出努力却没能实现的梦想，爱了很久却没能在一起的人，活得用力却平淡寂寞的青春，遗憾是每一次小的挫折，它磨去最初柔软的心智、让我们懂得累积时间的力量；那些孤独沉寂的时光，让我们学会守候内心的平和与坚定。那些脆弱的不完美，都会在努力和坚持下，改变模样。

6、人生中总会有一段艰难的路，需要自己独自走完，没人帮助，没人陪伴，不必畏惧，昂头走过去就是了，经历所有的挫折与磨难，你会发现，自己远比想象中要强大得多。多走弯路，才会找到捷径，经历也是人生，修炼一颗强大的内心，做更好的自己！

7、“一定要成功”这种内在的推动力是我们生命中最神奇最有趣的东西。一个人要做成大事，绝不能缺少这种力量，因为这种力量能够驱动人不停地提高自己的能力。一个人只有先在心里肯定自己，相信自己，才能成就自己！

8、人生的旅途中，最清晰的脚印，往往印在最泥泞的路上，所以，别畏惧暂时的困顿，即使无人鼓掌，也要全情投入，优雅坚持。真正改变命运的，并不是等来的机遇，而是我们的态度。

9、这世上没有所谓的天才，也没有不劳而获的回报，你所看到的每个光鲜人物，其背后都付出了令人震惊的努力。请相信，你的潜力还远远没有爆发出来，不要给自己的人生设限，你自以为的极限，只是别人的起点。写给渴望突破瓶颈、实现快速跨越的你。

10、生活中，有人给予帮助，那是幸运，没人给予帮助，那是命运。我们要学会在幸运青睐自己的时候学会感恩，在命运磨练自己的时候学会坚韧。这既是对自己的尊重，也是对自己的负责。