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文档简介
目的基因的连接、转化目的基因的连接、转化1分类及原理分类:
根据限制性内切酶酶切后产生的末端的类型,分为非互补突出末端的连接、相同粘性末端的连接、平末端连接分类及原理分类:2DNA连接示意图DNA连接示意图3载体自连及去磷酸化载体自连及去磷酸化4常用碱性磷酸酶BAP(大肠杆菌)CIAP(小牛肠)分子量80,000温度60℃—65℃最适PH8.0热稳定性好,100℃暂时性失活,室温放置可恢复活性,苯酚完全失活分子量100,000温度37℃最适PH10.0附近(高底物浓度)PH8.0附近(低底物浓度)65℃30分钟处理99%的活性不可逆失活,随具体条件改变有变动,完全失活苯酚处理常用碱性磷酸酶BAP(大肠杆菌)CIAP(小牛肠)分子量85本实验连接材料及连接体系本实验连接材料及连接体系6连接示意图连接示意图7连接体系载体DNA17ng目的DNA50ng连接缓冲液(5×)1.2ul用蒸馏水稀释至6ul附注:目的DNA的总体积是3ul,如果不够总质量以总体积为准连接体系载体DNA81.载体和插入片段的摩尔浓度比载体:插入片段的摩尔数的变化范围可为8:1到1:16,但通常的变化范围是3:1到1:3。插入片段的长度和序列的变化会影响和同一载体的连接效果。每一个连接反应都需要作实验,来选择最佳的载体和插入片段的摩尔数比。在最小的反应体积中,通常一个连接反应用10-50ng的载体DNA。2.进行连接反应时的保温的时间和温度也需优化。一般而言,平末端连接在22℃保温4-16小时,粘性末端在22℃保温3小时,或16℃保温16小时。大多数连接反应用T4DNA连接酶,但大肠杆菌的DNA连接酶可用于粘性末端的连接,平末端连接时用此酶,活力较低。3.载体和插入片段的纯度应较高,融解的溶剂最好使用灭菌的双蒸水而不是TE,毕竟TE中含有离子,可能影响连接反应。1.载体和插入片段的摩尔浓度比载体:插入片段的摩尔数的变化9感受态细胞的制备Hanahan法是制备高效感受态细菌的标准方法。这种化学方法制备的感受态细菌的转化效率可达到109cfu/µgDNA。注:1.低温培养,18℃培养至OD600约为0.5;2.超净台无菌操作,低温操作;3.标准质粒的种类不同同种感受态的转化率不同,不同质粒形态转化率也不相同。感受态细胞的制备Hanahan法是制备高效感受态细菌的标准方10转化原理1.0℃的CaCl2低渗溶液中,使细胞膨胀,同时Ca2+使细胞膜磷脂层形成液晶结构,使得位于外膜与内膜间隙中的部分核酸酶离开所在区域,这就构成了大肠杆菌人工诱导的感受态;2.加入DNA,Ca2+又与DNA结合形成抗脱氧核糖核酸酶(DNase)的羟基-磷酸钙复合物,并粘附在细菌细胞膜的外表面上;3.经短暂的42℃热脉冲处理后,细菌细胞膜的液晶结构发生剧烈扰动,随之出现许多间隙,致使通透性增加,DNA分子便趁机进入细胞内。Mg2+的存在对DNA的稳定性起很大的作用,MgCl2与CaCl2又对大肠杆菌某些菌株感受态细胞的建立具有独特的协同效应。二甲基亚砜(DMSO)和二巯基苏糖醇(DTT)进一步诱导细胞产生高频感受态的程序,大大提高了大肠杆菌的转化效率。转化原理1.0℃的CaCl2低渗溶液中,使细胞膨胀,11转化示意图转化示意图12连接效率的计算连接效率=转化子数载体质量
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