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文档简介
关于人类细胞质的提取等第1页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三Contents1.人类细胞质RNA的提取2.RT-PCR的原理、方法3.琼脂凝胶电泳结果分析及应用第2页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三人类细胞质RNA的提取
真核细胞质总RNA主要由rRNA(80-85%)、tRNA和核内小分子RNA(10-15%)、mRNA(1-5%)组成,其rRNA、tRNA和mRNA位于细胞质中。
第3页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三
人类细胞质RNA的提取·分析不同发育时期基因的表达状况·获得新基因AIMS·研究基因的拼接·分析相应的蛋白产物第4页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三
人类细胞质RNA的提取原理:RNA的不稳定性
由于核糖残基的2’和3’位置带有羟基,RNA易于被RNA酶切割水解
RNA酶含量丰富,加热后仍能够正确折叠恢复活性,不易失活。所以需要RNA酶抑制剂来抑制RNA酶的活性,从而达到成功提取RNA。第5页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三人类细胞质RNA的提取常用RNA酶抑制剂:
焦碳酸二乙酯(DEPC):是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。它通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。
异硫氰酸胍:目前被认为是最有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活。它既可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离出来,又对RNA酶有强烈的变性作用。
氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。
RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。第6页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三人类细胞质RNA的提取
RNA提取的一般步骤:破碎组织→分离RNA→沉淀RNA→洗涤RNA→融解RNA→保存RNA
破碎组织和灭活RNA酶可以同步进行可以用盐酸胍、硫氰酸胍、蛋白酶K等破碎组织加入β-巯基乙醇可以抑制RNA酶活性
分离RNA一般用酚、氯仿等有机溶剂,加入少量异戊醇,经过此步,离心,RNA一般分布于上层,与蛋白层分开
沉淀RNA一般用乙醇、3MNaAc(pH=5.2)或异丙醇。
第7页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三人类细胞质RNA的提取④洗涤RNA使用70%乙醇洗涤,有时,为避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗涤之后可以晾干或者烤干乙醇,但是不能过于干燥,否则不易溶解⑤融解RNA一般使用TE(三羟甲基氨基甲烷和EDTA配置而成)⑥保存RNA应该尽量低温。为了防止痕量RNase(核糖核酸酶)的污染,从富含RNase的样品(如胰脏、肝脏)中分离到的RNA需要贮存在甲醛中以保存高质量的RNA,对于长期贮存也应该如此第8页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三
RT-PCR
的原理及方法
RT-PCR:逆转录PCR,或者称反转录PCR(reversetranscription-PCR,RT-PCR),是聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。第9页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三
RT-PCR
的原理及方法
背景
基因的表达
*不同细胞或组织表达不同的基因基因组DNA(genomicDNA)信使RNA(messengerRNA,mRNA)蛋白质产物第10页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三RT-PCR
的原理及方法目的通过反转录(reversetranscription,RT)和聚合酶链反应(polymerasechainreaction,PCR)的方法,检测目的基因在特定组织或细胞中、mRNA水平的表达丰度第11页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三RT-PCR
的原理及方法原理及方法mRNA
(messengerRNA)cDNA(complementaryDNA)
PCR产物RT(反转录)
PCR(聚合酶链反应)第12页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三RT-PCR
的原理及方法第13页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三Diagram第14页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三琼脂糖凝胶电泳
琼脂糖凝胶电泳主要是应用琼脂糖凝胶作为支持物的电泳法,借助琼脂糖凝胶的分子筛作用,核酸片段因其分子量或者分子形状的不同,电泳速度有差异而分离,这种技术是基因操作中常用的一种方法。与其他支持物电泳最主要区别是:它兼有“分子筛”和“电泳”的双重作用。第15页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三琼脂糖凝胶电泳TEXTTEXTTEXTTEXT原理RNA电泳可以在变性及非变性两种条件下进行。非变性电泳使用1.0%--1.4%的凝胶,不同的RNA条带也能分开,但无法判断其分子量。只有在完全变性的条件下,RNA的泳动率才与分子量的对数呈线性关系。因此要测定RNA分子量时,一定要用变性凝胶。在需快速检测所提总RNA样品完整性时,配制普通的1%琼脂糖凝胶即可第16页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三琼脂糖凝胶电泳PCR产物在琼脂糖凝胶上的电泳检测
在基因组DNA的提取中,用蒸馏水溶解提取出的DNA,在1.0%的琼脂糖胶进行电泳,以Marker(分子质量标准)作为参照,用≤5V/cm的电泳30-60分钟,最后采用EB溶液进行染色后在凝胶成像系统中进行观察拍照。第17页,讲稿共20页,2023年5月2日,星期三琼脂糖凝胶电泳
应用(广泛应用与分子生物学、遗传学和生物化学)分离提取大分子DNA可区分相差100bp的DNA片段测定糖化血红蛋白PCR扩增产物的检测免疫扩散法利用琼脂糖凝胶作为扩散介质,使抗原与抗体在琼脂糖凝胶中自由扩散而相遇,从而形成抗原抗体复合物第18页,讲稿共20页,2023年5月2日,星
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