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文档简介
1、翻译和翻译后水平的调节第1页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二mRNA的寿命与蛋白质的合成mRNA的寿命决定其指导翻译蛋白质的时间,半衰期的长短主要决定于其选择性降解的速度,不同mRNA的结构,特别是3端非翻译区的序列决定其寿命。不同基因的mRNA寿命差别很大,珠蛋白mRNA的半衰期约为17h,而有些生长因子不超过30 min。第2页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二 很多蛋白质的合成与激素的作用有关。在某些情况下,激素并不能增加mRNA的转录,而在翻译水平上起调节作用。如:催乳素可延长酪蛋白mRNA的寿命达25倍,其他激素也能相应提高某些特定mRN
2、A的稳定性。激素对RNA稳定的影响第3页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二 转铁蛋白( transferrin ) mRNA的3端和转铁蛋白受体(transferrin receptor, TFR)mRNA的5端有非常相似的铁反应元件(iron response element, IRE ),该区域可形成多个复杂的茎环结构,其中部分茎环与铁反应有关。细胞中这两种蛋白质的浓度受到铁离子浓度的调节,可能主要与其基因转录后的翻译调节有关,因为通过抑菌素抑制转录过程并不能阻断其对铁的反应。蛋白质的最终浓度可能与细胞中该编码蛋白质mRNA的半衰期有关,其半衰期的长度则是受铁浓度的调
3、控的.(见下图)第4页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二转铁蛋白及转铁蛋白受体mRNA稳定性的铁依赖性调节(自Lodish , 2000)第5页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二Poly(A)对翻译的调控: 在小鼠的未成熟卵母细胞质中可以翻译的mRNA具有较长的poly(A), 减数成熟分裂后poly(A)降解,翻译终止。 在减数成熟分裂前不表达的mRNA的poly(A)较短(15-90A), 但其3UTR具有胞质多聚腺苷酸化信号序列(CPEs)(UUUUAU in mice and frogs)。减数成熟分裂后这些 mRNA迅速加上一个长的poly
4、A,开始翻译。第6页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二mRNA的结构和翻译效率 所有真核生物mRNA 5端都有帽子结构,早在1976年Shtkin就根据体外翻译实验结果指出,5端帽子有增强翻译效率的作用。此后众多研究证实,大多数mRNA的翻译依赖于帽子结构。 除了帽子外,真核生物mRNA的3端大都有polyA尾巴,在许多体内实验和高活性的体外翻译体系中都观察到,mRNA polyA结构与翻译效率有直接的关系,带polyA的mRNA比无polyA尾巴的相应mRNA的翻译效率高得多。5端帽子和3端polyA能够协同地调节mRNA的翻译效率。第7页,共19页,2022年,5月2
5、0日,20点59分,星期二翻译后水平的调控许多蛋白质的合成完成后就具有生物功能,但更多的蛋白质则必须经过适当的加工修饰才有活性,有些蛋白质的活性在与其他蛋白质的作用后往往发生明显的变化。第8页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二翻译后水平的调控一条长链被剪切并除去部分而激活, 胰岛素;除去某些保护/抑制性片段而激活,Dorsal;特定的亚细胞定位,膜蛋白、核蛋白等;与其它蛋白质一起装配成为功能单位,血红蛋白;与某些离子结合而激活,钙调蛋白; 通过蛋白质修饰(磷酸化、乙酰化)而激活,鱼精蛋白、晶体蛋白。第9页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二 第五节 表
6、观遗传修饰与细胞分化 第10页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二表观遗传修饰定义:由于DNA的甲基化、组蛋白N端的修饰、变异体及微小RNA(miRNA)的作用等引起染色体的状态和构型发生,进而引起基因表达发生相应的改变。特点:这种变化并不包括DNA序列及信息的任何改变,是经典遗传学之上或之外的改变。第11页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二一、DNA的甲基化DNA甲基化的发生 小干扰RNA(siRNA)和长非编码RNA(lineRNA)可通过与基因的启动子序列结合,指导其发生特异性的甲基化,组合组蛋白的修饰而使染色质发生重塑而抑制其表达,但也有少数例
7、证表明有些 lincRNA(l例如HOTTIP)可能通过与其配体蛋白质结合定位在其靶基因区,导致组蛋白H3K4的三甲基化而激活该基因。 DNA的甲基化多发生在胞嗜陡的第5位碱基,在真核生物中十分普遍,也被认为是DNA的“第5种碱基” 。 DNA的甲基化经常出现在3类DNA序列( CpG,CHG,CHHo )中。前2种序列为对称甲基化位点,CHH是非对称甲基化位点,CpG经常位于基因启动子附近或者GC岛中 。 第12页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二哺乳动物中的三种甲基化酶 在哺乳动物中DNA的甲基化是由3种甲酶催化的(Dnmtl,Dnmt3 a和Dnmt3 b)。 Dn
8、mtl对DNA复制后甲基化模式的维持有重要作用,它可对半甲基化的新合成DNA链进行甲基化。Dnmt3 a和Dnmt3 b是与从头甲基化过程有关(de novo methylation ),在这个过程中需要建立新的甲基化模式。Dnmtl和Dnmt3 a均可与组蛋白脱乙酞酶(HDACs)互作,从而抑制基因的表达。 第13页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二基因表达的激活和抑制 激活:胶质纤维酸性蛋白(GFAP)基因启动子的START3结合位点CpG的脱甲基化可以激活该基因的表达。 抑制:(1)DNA的甲基化也可以通过几种甲基CpG结合蛋白 (MECPs)识别DNA甲基化模式而
9、抑制基因的表达 (2)另一种甲基CpG结合蛋白MBD2与多亚基的NuRD(它们含有依赖ATP的染色体重塑因子Mi-2和HDACs)形成复合物,抑制甲基化的启动子,使染色体发生高效的重塑。第14页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二从头甲基化过程 在动物受精后,不论是来源于父系基因组还是母系基因组均发生大规模的脱甲基化(印迹基因除外),然后再重建新的甲基化模式。 有一个模型可能揭示其机制:基因转录起始点结合RNA聚合酶B,募集SET蛋白使覆盖这个区域的核小体组蛋白H3 K4发生甲基化,H3 K4甲基可抑制Dnmt3 L的结合,使从头甲基化酶不能作用这个区域,因而整个基因组中除
10、了结合有RNA聚合酶11的CpG岛外,均可发生从头甲基化过程。 第15页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二二、组蛋白的修饰与细胞分化 组蛋白八聚体中的4种蛋白N端尾巴有许多氨基酸可被不同的酶所修饰,例如,甲基化(Me)、乙酞化(Ac)和脱乙酞化、磷酸化(P)、泛素化、ADP一核糖基化等,其中发生在精氨酸和赖氨酸的甲基化修饰比较复杂,有单甲基化、双甲基化(对称和不对称)及三甲基化。 组蛋白密码:这些修饰的种类、位置和组合共同决定着核小体的状态,进一步控制基因的转录或者抑制,被称做组蛋白密码(histone code)。 第16页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二组蛋白修饰的作用 (1) 组蛋白的修饰可以通过改变不同组蛋白之间及组蛋白与DNA之间的接触影响染色质的高级结构,组蛋白密码决定着染色质的环境,从而进一步调节核DNA的复制、转录、DNA修复及染色体凝聚。 (2)组蛋白H3K4,H3K36,H3K79的三甲基化可以导致染色体的开放构型产生常染色质,同时由组蛋白乙酞转移酶(HATs)催化的组蛋白高水平乙酞化也是保证常染色质的一个特征。第17页,共19页,2022年,5月20日,20点59分,星期二 不管是干细胞还是组织特异性细胞,特定的miRNA均可参与重要转录因子、细胞周
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