昆明医科大学医学信息检索基础(2013最新版)重点课件

1、计算机信息检索基础知识 昆明医学院 文献检索教研室 胡 笳计算机信息检索的定义计算机信息检索是利用计算机对信息进行存储与检索。存储过程：大量的数据按一定的格式输入到计算机中，经过计算机的加工处理，以一定的结构有序地存储在计算机的存储介质上。查找过程：用户的需求输入到计算机中，由计算机对其进行处理，并与已存储在计算机中的信息进行查询与匹配，最后按要求的格式输出检索结果。计算机信息检索特点检索速度快，效益高；检索功能强，数量大；检索途径多，手段灵活；检索范围广；服务方式多。数据库检索结果匹配运算特征标识存储检索式检索情报提问规范化文献信息标引检索原理图计算机信息检索原理信息的检索过程信息的检索过程

2、：用户利用数据库获取所需信息的过程。在此过程，用户需将情报提问转化成计算机系统能识别的检索式，即规范化。计算机信息检索系统组成硬件：运算器、控制器、存储器、输入输出装置等软件：系统操作程序、数据库管理程序、联机控制程序、应用程序等。通讯线路：电话通讯网、数据通讯网、卫星通讯网等。检索终端：信息用户与检索系统主机进行人机对话，实现联机检索的设备。包括上网设备、调制解调器等。数据库：是计算机检索的对象。是由一个或数个文档构成，并能够满足某一特定目的或某一特定数据处理系统需要的一种数据集合。数据库(Database)一定专业范围内的信息记录及其索引的集合体,是计算机信息检索系统的重要组成部分,是信息

3、资源,是检索对象.事实数据库（Factual database）指包含大量数据、事实，直接提供原始资料的数据库又分为数值数据库（Numeric database）、指南数据库(directory database)、术语数据库（terminological database)等全文数据库（Full text database）收录有原始文献全文的数据库以期刊论文、会议论文、政府出版物、研究报告、法律条文和案例、商业信息为主例如：中国期刊全文数据库、维普中国科技期刊数据库 、EBSCO全文数据库和OVID全文数据库字段（Field)比记录更小的单位是字段，是组成记录的数据项目。例如在书目数据库M

4、edline中一条记录代表一篇文献，在这条记录中有题名（TI）、著者（AU）、来源（SO）、主题词（MH）等字段。【流水号】 2003238478【分类号】 R-332; R338; R363-332; R651.2; R651.3; R826.64; R826.640.22; R826.640 .23【标题】 移植神经干细胞促进脊髓全横断大鼠结构与功能修复的研究【著者】 郭家松; 曾园山; 李海标; 丁英; 吴立志; 陈穗君【著者单位】 广州第一军医大学分校 510315【文摘】目的:探讨移植神经干细胞对脊髓全横断性大鼠部分结构与功能修复的影响。方法 :在脊髓全横断处移植神经干细胞60d后，

5、结果:移植的神经干细胞能，结论:神经干细胞移植入损伤脊髓后能分化为神经元及神经胶质细胞,能减轻脊髓的继发性损伤,保护受损伤的神经元,促进运动功能的恢复。【基金】 国家重点基础研究发展规划项目 (G1999054009); 广东省中医药局科研基金 (58号101139)【出处】 解剖学报 2003.04.06; 34(2): 113-117【ISSN】 0529-1356【关键词】 大鼠; 分化; 脊髓损伤; 神经干细胞; 神经再生; 移植【主题词】 疾病模型, 动物; 脊髓损伤/*病理生理学; 脊髓损伤/*外科学; 脊髓损伤/病理学; 神经元/*移植; 神经再生【特征词】 大鼠; 动物常用生物

6、医学数据库 （一）英文数据库：1MEDLINE数据库：由美国国立医学图书馆建立的世界公认的、最具代表性和权威性的生物医学数据库。2EMBASE数据库：由荷兰爱尔泽维科学出版社（ESP）建立的世界著名的医药学文献数据库，其药学及药理学内容较MEDLINE丰富。3BIOLOGICAL ABSTRACTS（BA）数据库：由美国生物科学服务中心（BIOSIS）建立的世界著名的生命科学文献数据库。4CHEMICAL ABSTRACTS（CA）数据库：由美国化学学会（ACS）下属部门-化学文摘社（CAS）建立的世界公认的、最具代表性和权威性的化学文献数据库。5SCIENCE CITATION INDEX（

7、SCI）数据库：由美国科学情报研究所（ISI）建立的世界权威的科学引文数据库，用于查找文献被引用的情况，包括被引著者和被引著者的文献。 常用生物医学数据库（二）中文数据库1中国生物医学文献数据库（CBM）：由中国医学科学院医学信息研究所建立的综合性国内医学文献数据库。2中国期刊全文数据库(CNKI)：由清华大学建立的我国第一个连续出版的大规模集成化、多功能国内学术期刊全文型数据库，共有9个专集。3中国药学文摘数据库（CPA）：由国家食品药品监督管理局信息中心建立的大型国内药学文献数据库。计算机信息检索技术1.布尔逻辑检索2.截词检索3.位置运算检索4.词条检索5.限定检索布尔逻辑检索 在检索过

8、程中用于表达词于词之间的逻辑关系的算符就称为布尔逻辑运算符。分为三种逻辑关系：逻辑与、逻辑或、逻辑非；分别用AND、 OR、 NOT表示。 逻辑与ANDA AND B：检索词A和检索词B同时出现在一条记录中。其作用是缩小检索范围，提高查准率。例如查有关“妇女吸烟”的文献，检索式可写成： Women and smokingAB逻辑或 逻辑或（OR） A OR B：记录中出现检索词A或检索词B或两词同时出现在一条记录中。 其作用是扩大检索范围，提高查全率如查有关维生素C方面的文献，检索式可写成： Vitamin C or Ascorbic acidAB逻辑非NOTA NOT B：记录必须包含检索词

9、A但不包含检索词B。即在含有A检索词的文献中去除含有B检索词的文献。其作用是缩小检索范围，提高查准率。例如查找有关“非儿童白血病”的文献，检索式可写成： Leukemia not child*运算顺序布尔逻辑算符的运算次序：NOT AND OR( )号里的部分运算优先截词截词符无限截断：* 或 #有限截断：？如：child*,可查到child, children, childish, childhood等所有以child开头的单词。 按截断的位置不同又分为左截断、右截断和中间截断按截词的位置划分前截断：又称左截断，截词符在词的左边，例如：*magnetic中截断：截词符在词的中间，例如：org

10、ani?ation, 可以检索organisation organization后截断：是前方一致检索，又称右截断，截词符放在被截词的右边，是最常用的检索技术，例如：librar*位置运算检索 用邻近运算符连接两个检索词，表示要求两个检索词同时出现在同一记录中，两词的相互位置必须符合规定的相邻度才能被命中检出。 邻近运算符：in、with、near in：指定在某个字段进行检索； with：连接两个词检索，凡是在同一记录的同一字段中出现两个词； near：两个词在同一个句子中出现。字段限制限制符包括“ in, =, 、=、=1996(4)语种(限制性字段)的限制检索：la=french或fre

11、nch in la(5)作者的限制检索：AU=李玲，李玲/AU 限定字段检索举例(6)医学主题词的限制：epilepsy（癫痫） in mesh(7)出版类型(限制性字段)的限制检索：review in pt; pt=综述(8)期刊名称的限制：circulation in so; 限定字段检索举例22. 字段限制符名 称运算符逻辑关系举例精确检索= 唯一限定AU=洪涛模糊检索 in 包含限定洪涛 in AU字段限制检索效果对比禁用词表 在数据库中，系统对信息进行标引时，不能做标引词或检索词的语词 包括介词、冠词、代词、连接词、某些形容词或副词等 如a、and、for、in、she、should

12、、the、well、only检索步骤1.根据课题内容，选择合适数据库，并确定检索途径；2.分析课题内容，进行概念分析，提炼出主题概念，拟出检索词，转换成系统采用的检索标识，准备若干自由词备用；3. 编写检索提问表达式；4.进行检索，对检出文献进行相关性分析、评价；5.必要时对检索词或检索式进行修改，直至检出结果符合要求；6.查找原文。检索提问表达式检索提问表达式检索词运算符 检索词可以是包括各种描述文献内容和外表特征的标识 ，如：主题词、关键词、自由词、分类号（树状结构号）、特征词、代码、著者姓名、刊名、出版年等。 运算符：布尔逻辑运算符、字段限制符、位置限制符、截词（truncation）符

13、、短语检索符等。 检索实例例1 微量元素铜、铁与肝癌的关系。 (1)分析课题内容，选择相关数据库国内：CBMdisc);国外：Medline; 或PubMed采用主题途径检索(2)提炼主题概念：铜 (Copper)/全部副主题词；铁(Iron)/全部副主题词 肝癌的主题词为肝肿瘤(Liver Neoplasms )(3)列出检索表达式：(铜/全部副主题词 OR 铁/全部副主题词) AND 肝肿瘤/全部副主题词 例2. 检索昆明医学院李树清教授2000年以来发表的有关树鼩脑缺血的文献。 (1)国内：CBMdisc(1997-2012);国外：Medline(1997-2012);或PubMed(

14、1997-2012)(2)提取检索词：昆明医学院；李树清；2000；树鼩（Tupaiidae） ；脑缺血（Brain Ischemia）(3)确定检索途径： 树鼩、脑缺血 采用主题途径进行检索 昆明医学院为单位，采用作者地址（AD） 李树清为人名， 采用作者姓名（AU） 2000 采用出版年（PY）(4)检索式：树鼩/全部副主题词 AND 脑缺血/全部副主题词 AND AD昆明医学院 AND AU李树清 AND PY 2000 示例3：查找有关消化性溃疡的药物治疗方面的综述文献分析：消化性溃疡 （主题词）药物治疗 （副主题词） 综述 （文献类型）检索式：#1 MH“消化性溃疡/药物疗法”#2 综述 IN PT#3 #1 and #2或 MH“消化性溃疡/药物疗法” and 综 述 IN PT检索结果的反馈调整扩大检索范围的措施降低检索词的专指度，可从词表或检出文献中选择泛指词。调节检索式的网罗度，如删除某个不重要的检索词。进行族性检索，可用分类号或用OR连接一组同义词和近义词。取消某些限制过严的限制符。检索结果的反馈调整缩小检索范围的措施提高检索词的专指度。增加AND连接，进一步限定主题词。把检索词限定在主要字段，如标题字段、主题词字段等。缩短检索年限，或限定某些刊物。检索课题主题分析选择数据库确定检索词制定检索式计算机处理 数据库原文标引结