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文档简介
1、肿瘤登记软件使用介绍主要内容全国肿瘤登记中心推荐使用国际癌症研究中心(IARC)/国际癌症登记协会(IACR)编制的两款软件:肿瘤登记软件CanReg4:用于登记资料的收集与简单分析肿瘤登记工具软件IARCcrgTools:用于编码的转换与数据审核软件的获得两个软件均可从如下网址下载: 肿瘤登记软件CanReg4使用需要授权,国际肿瘤登记协会(IARC)会员可以免费使用肿瘤登记工具软件(IARC/IACR Cancer Registries Tools)可以免费使用CanReg概述CanReg是由国际癌症研究中心描述流行病学室开发的肿瘤登记软件,目前第4版,即将推出第5版 CanReg4是由
2、Andy Cooke、Max Parkin、Jacques Ferlay等人开发的1. CanReg特点CanReg用于基于人群肿瘤登记的软件CanReg3最早在1996年发布,是DOS下使用的;CanReg4运行于Windows操作系统下目前全世界已经有100多个肿瘤登记处在使用CanReg软件CanReg特点CanReg4的解剖学部位及形态学编码使用国际疾病分类肿瘤学专辑第三版(ICD-O-3)CanReg 4的数据录入模块中的检查程序,可以很方便的检查出不合格的、罕见的,以及重卡和多原发肿瘤病例记录简单易用的分析选项,包括按年的频数分析表、发病频数和发病率表等CanReg特点CanReg
3、4可扩充登记项目和数据质量检查项目CanReg4目前已有:英语、法语、西班牙语、意大利语,阿拉伯语、泰国语和简体中文版等版本。各语言版本之间,可以方便地进行转换2. CanReg4主要模块数据录入数据分析数据管理 数据录入浏览/编辑记录字典导入数据分析频数分布(按年)发病率表导出/报告频数/表格Epi-Info 6数据管理查看工作文件备份名字/性别检查 (中文版不适用)重卡搜寻用户/密码选项CanReg4的安装一、软件的获得与使用授权使用CanReg4必须得到授权,需要有由IACR/IARC统一定义的、带有三位字符编码的系统备份文件,且每个登记处使用唯一的编码一、软件的获得与使用授权肿瘤登记处
4、为国际肿瘤登记协会(IACR)成为会员,才可以获得免费CanReg4使用的授权全国肿瘤登记中心负责定义中国肿瘤登记处三位编码,并授权使用CanReg4全国肿瘤登记中心以团体会员的形式,加入了IACR,因此各登记处可以得到授权使用CanReg4 使用现有系统登录用户名ANDY 密码 cookeCanReg4的功能介绍登陆CanReg4用户名: andy密码: cooke数据录入模块浏览/编辑记录字典导入浏览与编辑记录CanReg4 的这个页面用于浏览和编辑数据库记录浏览记录:可利用筛选、排序和范围等工具,对已有记录进行查看。编辑记录:可建立新记录,或对原有记录进行编辑、修改。使用筛选工具利用筛选
5、可以找出所需要的记录:性别=1(男性)年龄=60性别=2 和年龄=60Sex=2 and Age 值 - 键入 60 完成利用快速筛选例如:选择60岁以上的女性,先点击.筛选工具右侧的“笑脸”按钮,然后选取排序CanReg4一共有7条索引: Registry No. : 登记号 / Update date : 更新日期 / Multiple Primary : 多原发肿瘤 / 发病日期 / Incidence date : 发病日期 / ICD-10 : ICD-10 / 性别 / Names : 姓名 / Pinyin : 姓名拼音 / 使用排序/范围先将记录根据选定索引进行排序然后为已排序
6、变量指定开始和结束范围例如: 按发病日期排序, 仅显示1991年和1992的记录: 索引 =发病日期(Incidence Date) 开始 =1991 结束 =19929999导航按钮下页上页第一个记录最后一个记录显示变量点击变量“单选按钮”可以选择显示如下变量: 全部变量(All variables) 指定(强制性)变量(Mandatory variables)登记处定义为必须填写的项目 关键变量(Key variables)姓名,年龄,发病日期,肿瘤部位等不可空缺的项目7. 编辑记录使用右侧3个按钮可以编辑记录:建立新记录: 使用这个选项可建立一个新的空白记录表,当保存这个记录的时候,会自
7、动赋予一个登记号编辑表中记录: 这个选项可编辑在数据表中的被蓝色条标记的当前记录编辑记录号: 在按这个按钮之前,先填写你想编辑的记录的登记号。如果记录已经存在,将打开这个记录进行编辑;如果不存在,则打开一个空白记录且将登记号赋予这个空白记录使用这个选项可重新设置登记号。8. 刷新表格如果数据库中的记录数改变了,使用这个按钮可以刷新显示的列表新录入的数据不会马上显示,刷新之后会显示编辑页面组成“系统变量”面板数据录入“多原发肿瘤”面板 数据录入表数据录入表由4部分组成:病人信息肿瘤信息医院信息随访信息变量名称对于每个变量,有三个变量名:中文变量名 Long Variable names短的变量名
8、 Short Variable names英文变量名 English Variable names例如:出生日期 Birthda Birth Date病人信息变量11个肿瘤信息变量11个the International Classification of Childhood Cancer (ICCC). 国际儿童肿瘤分类医院信息变量4个 随访信息变量6个新病例控制变量8个数据录入 点“建立新记录”在数据录入过程中使用下列方法移动光标: - 向上或向下键可移动到下一个或上一个变量; - 回车键可到下个变量; - PgDown, PgUp 键可移动到下一个,上一个组; - Home, End 键
9、可移动到第一个, 最后一个变量。 - 键入 “?” 可看见字典弹出。使用鼠标,可以直接点击想编辑的变量,并可在弹出的字典框中去选择正确的编码。数据录入或修改后,必须完成以下步骤: 录入检查 当数据录入完成后执行各种的一致性检查。重卡检查 搜寻任何的可能属于同一个病例的记录。记录状态 改变记录状态是确认、挂起、或删除。保存/退出如果更改过记录内容,将出现一个红色的星号在”保存”按钮旁边 。 如果不保存,修改无效 。“系统变量”面板 检查状态:是否做过,结果是什么。 重卡检查:是否做过,结果是什么。 记录状态:在成功的完成“检查” 和 “重卡搜寻” 程序以前,所有新的记录都被设置成 “未确定的”。
10、只有被“确认”的病例记录才可用于本软件的分析。 保存/退出:保存或不保存退出。 更新日期:方框显示的是这条记录最后的编辑日期检查内容编辑检查地方检查(Local Checks)各登记处自定义项目的检查强制性变量检查(Mandatory Variables)登记处规定必须填写的变量检查名和性别(中文版不适用)交叉检查(Cross-Checks)检查项目发病日期检查出生日期检查年龄检查死亡日期检查性别检查部位检查形态学检查行为检查分期检查诊断级别检查发病日期/出生日期年龄 = 发病 - 出生发病日期/死亡日期部位/形态形态/行为性别/部位性别/形态年龄/部位年龄/形态年龄/部位/形态部位/行为重卡
11、检查搜寻可能属于同一个病例的记录,既查重在查重过程中使用如下有关的变量:日期出生、居住地址、身份证号码、姓名、拼音等,每个变量的权重不同如果没有发现匹配的记录,系统将会出一个提示信息。IARC有关多原发肿瘤的定义识别存在着两个或两个以上的原发肿瘤不取决于时间。一个原发肿瘤是一个起源于一个原发部位或组织的肿瘤。因此既不是扩散也不是复发和转移。某一发生在一个或多个器官或组织(由ICD-O解剖学所限定的)肿瘤,除组织学不同外应认识是单一肿瘤。字典CanReg4允许登记处编辑字典内容,并可添加或删除代码;编辑字典代码注意事项及步骤:确定没有用户在使用输出字典到文本文件根据需要对文本文件进行编辑输入文本
12、文件到字典CanReg4中文版共有字典18个1.Record status记录状态10. Grade 分级2.Check status检查状态11. Tribe 民族3.Person search人工搜索12. Marital status婚姻状况4.Topography解剖学部位13. Status最后接触状态5.Morphology形态14. Cause Death死亡原因6.Behaviour行为15. Address地址代码7.Sex 性别16. Doctors医师8.Basis Diagnosis 诊断依据17. Place of Death死亡地点9.Hospital医院18. O
13、ccupation职业CanReg4中文版共有字典18个1.Record status记录状态10. Grade 分级2.Check status检查状态11. Tribe 民族3.Person search人工搜索12. Marital status婚姻状况4.Topography解剖学部位13. Status最后接触状态5.Morphology形态14. Cause Death死亡原因6.Behaviour行为15. Address地址代码7.Sex 性别16. Doctors医师8.Basis Diagnosis 诊断依据17. Place of Death死亡地点9.Hospital医
14、院18. Occupation职业新病例控制部分字典3个1.Record status记录状态10. Grade 分级2.Check status检查状态11. Tribe 民族3.Person search人工搜索12. Marital status婚姻状况4.Topography解剖学部位13. Status最后接触状态5.Morphology形态14. Cause Death死亡原因6.Behaviour行为15. Address地址代码7.Sex 性别16. Doctors医师8.Basis Diagnosis 诊断依据17. Place of Death死亡地点9.Hospital医
15、院18. Occupation职业病人信息部分字典5个Sex 性别Tribe 民族Marital status婚姻状况Occupation职业Address 地址代码肿瘤信息部分字典5个1.Record status记录状态10. Grade 分级2.Check status检查状态11. Tribe 民族3.Person search人工搜索12. Marital status婚姻状况4.Topography解剖学部位13. Status最后接触状态5.Morphology形态14. Cause Death死亡原因6.Behaviour行为15. Address地址代码7.Sex 性别16.
16、 Doctors医师8.Basis Diagnosis 诊断依据17. Place of Death死亡地点9.Hospital医院18. Occupation职业医院信息部分字典2个Hospital 医院Doctors 医师随访信息部分字典3个Status 最后接触状态Cause Death死亡原因Place of Death死亡地点 软件安装完毕后需要根据实际情况修改字典修改字典修改字典点击 数据录入 点击 字典修改字典点击 :输出字典到文本文件找到 #9 - Hospital#15 - Addcode#16 - Doctors修改这三个地方的字典 修改字典 #9 - Hospital 报
17、告医院#15 - Addcode 地区代码#16 - Doctors 报告医师根据实际情况修改这三个地方的字典 注意:其他字典内容请勿修改修改字典#15 - Addcode地区代码增加“区”代码和“街道”的代码。请注意,区的代码4位,街道的代码6位,且区的前四位代码和街道的前四位代码应该相同,否则区和街道不能对应。相应的,区可以改为”县”,街道可以改为乡镇的代码,这样方便农村登记地修改完毕之后请点击输入来自文本的字典否则修改的字典不保存修改字典点击OK 后关闭字典即修改成功修改字典#15 - Addcode 地区代码在字典中定义之后,录入软件中用到地区代码的地方,需要定义“区”代码和“街道”的
18、代码,且区代码的4位数和街道代码应该对应 修改字典#9 - Hospital#16 - ICD-O-2 = ICD-O-3Check审核:一是检查变量是否完整并在编码范围内的有效性检查;二是对不同变量之间是否合乎逻辑的一致性进行检查;Check 程序变量的一致性审核Age/Incidence and birth dates 年龄/出生日期与发病日期Age/Site/Histology (ICD-O-3) 年龄/部位/组织学Site/Histology (ICD-O-3) 部位/组织学Sex/Site 性别/部位Check 程序变量的一致性审核Sex/Histology (ICD-O-3) 性别
19、/组织学Behaviour/Site (ICD-O-3) 行为/部位Behaviour/Histology (ICD-O-3) 行为/组织学Grade/Histology (ICD-O-3) 分级/组织学Basis of diagnosis/Histology (ICD-O-3) 诊断依据/组织学变量的一致性审核发病/出生日期: 发病日期 出生日期年龄/发病/出生日期:年龄=发病日期-出生日期 在Excel中用公式:=DATEDIF(出生日期,发病日期,“Y”) 计算年龄一致性审核:年龄/部位/组织学在一般情况下,某些肿瘤的部位和形态学,在某些特定年龄中是非常罕见的年龄在15岁以下的不太可能出
20、现的肿瘤: 肿瘤诊断不太可能出现的年龄 Hodgkin lymphoma(霍其金淋巴瘤) 0-2 Neuroblastoma(神经细胞瘤) 10-14 Retinoblastoma(视网膜母细胞瘤) 6-14 Wilms tumour(维尔姆斯瘤) 9-14 Renal carcinoma(肾癌) 0-8 Hepatoblastoma(肝母细胞瘤) 6-14 一致性审核:部位/组织学部位/组织学通过两种方式进行审核:一是通过审核某些形态学编码仅用于特定部位的肿瘤编码,如:8170/3 肝细胞癌(C22.0),8586/3 胸腺癌(C37.9)二是通过审核“不常见的”或“不可能的”部位与形态学编
21、码组合一致性审核:性别/部位男性,不应出现如下部位的肿瘤:C51._(外阴), C52._(阴道), C53._(宫颈), C54._(宫体), C55._(子宫), C56._(卵巢), C57._(其它和未特指的女性生殖器官), C58._(胎盘) 女性,不应出现如下部位的肿瘤:C60._(阴茎), C61._(前列腺), C62._(睾丸), C63._( 其它和未特指的男性生殖器官),Check 程序变量的有效性审核日期变量:格式 2000-01-12 或2007/01/09发病年龄:必须是数字格式,不大于105岁;如果出生日期和发病日期完整,年龄可以通过计算获得;如果出生日期不详,则
22、年龄字段必须是空白或是999(年龄不详)性别:必须是有效编码,如1、2或9(不详)Check 程序变量的有效性审核解剖学部位编码:必须是有效的ICD-O-3编码, 如气管编码为C33, 或C33.9, 不能编码为C33.0、C33.8 形态学编码:必须是有效的ICD-O-3编码,如没有8006/3这个编码 行为编码:必须是0, 1, 2, 3 (或特殊编码 6 或 9) 分级编码:必须是有效的ICD-O-3编码 IARC/IACR Cancer Registries Tools 使用对数据格式的要求数据库文件必须以文本格式存放, 变量以间固定格式分隔每一病例用一行,要求必须包括以下变量:(1)
23、登记号; (2)性别;(3)年龄; (4)出生日期;(5)发病日期; (6)解剖学部位编码(ICD-O-3)(7)组织学编码(ICD-O-3); (8)肿瘤行为编码(ICD-O-3);(9)肿瘤分级编码(ICD-O-3); (10)诊断依据编码;数据格式 200701001 2 75 19321022 20070405 20070722 7 0 C20 C209 8010 39 C209 8010 39200701002 1 44 19630911 20070205 20070811 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200701003 1 68 19380
24、413 20070106 20070708 2 0 C34.9 C349 8000 39 C349 8000 39200701004 2 49 19590530 20071002 20080525 7 0 C66 C669 8010 39 C669 8010 39200701005 2 69 19380714 20070723 20080205 2 0 C20 C209 8000 39 C209 8000 39200701006 1 80 19261025 20070509 20080124 2 0 C34.0 C340 8000 39 C340 8000 39200701007 1 59 1
25、9431003 20070410 20070521 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200701008 2 78 19241125 20070122 20070805 2 0 C22.9 C220 8000 39 C220 8000 39200701009 1 83 19191119 20070506 20070807 2 0 C16.9 C169 8000 39 C169 8000 39200701010 1 72 19310209 20071005 20090818 7 0 C22.9 C220 8010 39 C220 8010 3920070101
26、9 2 84 19180511 20070225 20080208 7 0 C53.9 C539 8070 39 C539 8070 39200701020 1 74 19290116 20070819 20080419 7 0 C16.1 C161 8010 39 C161 8010 39File specification:1- 9 Year and ID11-11 Sex13-15 Age17-24 Date of birth26-33 Date of diagnosis35-42 Date of death44-44 Basis46-46 DCO48-52 ICD-1054-57 IC
27、D-O259-62 ICD-O2-morphology64-65 I CD-O2 Behavior and grade67-70 ICD-O372-75 ICD-O3-morphology77-78 ICD-O3 Behavior and grade使用crg Tools格式转换当审核格式使用txt格式时,可能出现这样提示使用crg Tools格式转换打开IARCcrgToolsToolsFile Transfer点击Input File栏下的Browse按钮,选取Input文件 在Output File栏中键入输出文件名下一步使用crg Tools格式转换选中全部变量完成使用crg Tools编码转换打开IARCcrgToolsConversionsICD-0-3-ICD10点击Input File栏下的Browse按钮,选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽)在Output File栏中键入输出文件名下一步使用crg Tools编码转换打开IARCcrgToolsConversionsICD-0-3-ICD10点击Input File栏下的Browse按钮,选取Input文件(以文本格式存放,固定列宽)在Output File栏中键入输出文件名下一步编码转换示例ICD-O-3到ICD10定义字段Registrat
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