几种分子遗传标记技术

1、会计学1几种分子遗传标记技术几种分子遗传标记技术动物遗传标记课程作业分子遗传标记概述分子遗传标记概述1主要分子标记技术主要分子标记技术4分子遗传标记优越分子遗传标记优越性性2分子遗传标记分类分子遗传标记分类3几种分子标记的比几种分子标记的比较较5第1页/共36页动物遗传标记课程作业第2页/共36页动物遗传标记课程作业分子遗传标记的优越分子遗传标记的优越性性第3页/共36页动物遗传标记课程作业Southern杂交为核心的分子标记，如杂交为核心的分子标记，如RFLPDNA芯片技术为基础分子标记，如芯片技术为基础分子标记，如SNPPCR技术为基础的分子标记，如技术为基础的分子标记，如RAPDPCR与

2、酶切技术结合的分子标记，如与酶切技术结合的分子标记，如AFLP分子分子 标记标记第4页/共36页动物遗传标记课程作业1、RFLP （Restriction Fragment Length Polymorphism） 限制性片段长度多态性限制性片段长度多态性第5页/共36页动物遗传标记课程作业第6页/共36页样品纯度要求较高，样品用量大；多态信息含量低；步骤繁琐、工作量大、成本较高。动物遗传标记课程作业较高的可靠性；标记数目是无限的；标记为共显性；标记之间无干扰；不受年龄性别以及外界环境的影响。u RFLP的缺点的缺点第7页/共36页 分子水平上选择目的性状 进行品种或品系遗传纯度的测定 改良回

3、交育种技术 生物进化和分类 疾病诊断方面的应用 特别适应于构建遗传连锁图动物遗传标记课程作业第8页/共36页:u原理：原理：基因组DNA经两种两种限制性内切酶酶切，形成分子量大小不等的随机酶切片段，将特定的人工合成的短的双链接头连在这些片段的两端，形成一个带接头的特异片段，用含有选择性碱基的引物对摸板DNA进行扩增。扩增产物经放射性同位素标记、聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，然后根据凝胶上扩增产物的多态性来检出多态性。动物遗传标记课程作业第9页/共36页动物遗传标记课程作业第10页/共36页动物遗传标记课程作业多态性丰富且清晰可辨，一次AFLP分析可检测到100150个标记；被认为是指纹图谱技术中多态

4、性最丰富的一项技术；可靠性好，重复性高；DNA需要量少；引物在不同物种间是通用的；AFLP分析的扩增片段较短（30-700bp)，分辨率高。u AFLP的缺点的缺点对DNA模板质量要求高，对其浓度变化不敏感；显性标记，只能表明目的条带的有无，不能区分纯合子和杂合子；操作复杂，耗时，成本高。第11页/共36页动物遗传标记课程作业遗传图谱的构建；基因标记及定位；种及种下阶元的分类鉴定；遗传距离及杂种优势的利用；遗传多样性和系统进化的研究。第12页/共36页u原理：原理：单链DNA分子内的相互作用力使其呈现 复杂的空间折叠构象，当有一个碱基发生改变时，其空间构象发生变化，这些空间构象存在差异的单链D

5、NA分子在凝胶中受排阻大小不同。因此，通过电泳可以将构象上有差异的分子分离开，形成了单链构象多态性。动物遗传标记课程作业第13页/共36页动物遗传标记课程作业第14页/共36页动物遗传标记课程作业u SSCP的优点的优点 操作简便，实验步骤少，周期短； 具有高的灵敏性，仅单个碱基差异亦可检测出来，拓展了检测范围； 能得到更多的图谱信息，更详细的分型结果。u SSCP的缺的缺点点 只能作为突变检测方法，要确定突变的位置和类型，还需进一步测序； 受外界影响较大，电泳条件要求较严格； 易造成漏检。第15页/共36页动物遗传标记课程作业 基因点突变的监测 大量样本的筛选 cDNA的筛查 检测人类遗传性

6、疾病 病毒的分型和分类 保种和育种第16页/共36页动物遗传标记课程作业第17页/共36页动物遗传标记课程作业第18页/共36页动物遗传标记课程作业u RAPD的缺点的缺点 重复性差，易受到各种因素的影响； 标记呈显隐性遗传。第19页/共36页动物遗传标记课程作业l小卫星（小卫星（Minisatellite DNA)l微卫星（微卫星（Microsatellite DNA）第20页/共36页动物遗传标记课程作业第21页/共36页动物遗传标记课程作业第22页/共36页动物遗传标记课程作业 数量多且均匀分布在基因组中； 具有丰富的多态性； 等显性遗传，因此检测可以显示纯合子和杂合子； 检测容易、重复

7、性较好、省时，适合于进行自动化分析。u 微卫星微卫星DNA的优的优点点u 微卫星微卫星DNA的缺点的缺点 相对的物种专一性； 开发困难，费用较高，耗时长； 实际分析时一般每次只分析单个位点； 不同引物退火温度不同，需要探索。第23页/共36页个体及亲缘关系鉴定种群(品种、品系)内遗传纯度和彼此之间遗传距离构建遗传连锁图谱定位功能基因及QTL杂交优势预测群体遗传结构分析及遗传关系的分析在标记辅助选择和标记辅助导入等方面的研究监测育种和遗传操作效应亲子鉴定、胚胎移植、混合受精、亲缘关系分析动物遗传标记课程作业u微卫星微卫星DNA的应用的应用第24页/共36页动物遗传标记课程作业第25页/共36页动

8、物遗传标记课程作业第26页/共36页动物遗传标记课程作业第27页/共36页动物遗传标记课程作业项目项目RFLPRAPD微卫星微卫星小卫星小卫星AFLP遗传特性遗传特性共显性共显性显隐性显隐性共显性共显性共显性共显性显隐性显隐性多态水平多态水平低低中等中等高高高高高高检测基础检测基础分子杂交分子杂交随机随机PCR专一专一PCR分子杂交分子杂交专一专一PCR技术难度技术难度难难易易易易难难易易费用费用中等中等低低高高中等中等高高几种几种DNA分子标记的比较分子标记的比较第28页/共36页谢谢！谢谢！第29页/共36页样品纯度要求较高，样品用量大；多态信息含量低；步骤繁琐、工作量大、成本较高。动物遗

9、传标记课程作业较高的可靠性；标记数目是无限的；标记为共显性；标记之间无干扰；不受年龄性别以及外界环境的影响。u RFLP的缺点的缺点第30页/共36页动物遗传标记课程作业多态性丰富且清晰可辨，一次AFLP分析可检测到100150个标记；被认为是指纹图谱技术中多态性最丰富的一项技术；可靠性好，重复性高；DNA需要量少；引物在不同物种间是通用的；AFLP分析的扩增片段较短（30-700bp)，分辨率高。u AFLP的缺点的缺点对DNA模板质量要求高，对其浓度变化不敏感；显性标记，只能表明目的条带的有无，不能区分纯合子和杂合子；操作复杂，耗时，成本高。第31页/共36页动物遗传标记课程作业遗传图谱的构建；基因标记及定位；种及种下阶元的分类鉴定；遗传距离及杂种优势的利用；遗传多样性和系统进化的研究。第32页/共36页动物遗传标记课程作业第33