PubMed使用详解

1、Dept. of Medical Information2022-5-91PubMed数据库2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 2 NCBI(美国生物技术信息中心）网址网址: :http:/NCBINCBI是美国国立卫生研究院是美国国立卫生研究院(NIH)(NIH)下属的一个机构。下属的一个机构。NCBINCBI创建了生物医学领域中最著名的信息检索系创建了生物医学领域中最著名的信息检索系统。统。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedic

2、al Information 3NCBI生物医学检索系统(Entrez)PubmedPubmed：生物医学文献数据库；生物医学文献数据库；NucleotideNucleotide：核苷酸序列数据库；核苷酸序列数据库；ProteinProtein：蛋白质序列数据库；蛋白质序列数据库；GenomeGenome：完整的基因组汇编；完整的基因组汇编；StructureStructure：大分子三维结构；大分子三维结构；PMCPMC：数字化生物医学期刊存储与检索系统数字化生物医学期刊存储与检索系统TaxonomyTaxonomy：分类学数据库；分类学数据库；OMNIOMNI；孟德尔人类遗传学数据库；孟德

3、尔人类遗传学数据库；BooksBooks：生物医学网络版图书。生物医学网络版图书。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 4NCBI生物医学检索系统(Entrez)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 5 NCBI网站 ()2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 6PubMed主页2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 71. Pubmed简介NCBI

4、NCBI于于9797年年5 5月推出，月推出，InternetInternet用户免费检索。用户免费检索。检索全世界生物医学检索全世界生物医学期刊论文期刊论文的重要工具；的重要工具；学科覆盖范围：学科覆盖范围： 临床医学、基础医学、护理学、牙科学、兽医临床医学、基础医学、护理学、牙科学、兽医学、药理学、环境和公共卫生学、药理学、环境和公共卫生。收录文献的时间范围：收录文献的时间范围： 1948-1948- Update everyday (Tuesday - Saturday) Update everyday (Tuesday - Saturday)2022-5-95/9/2022Dept.

5、ofMedical Information 81. Pubmed简介摘要型摘要型(Abstract)(Abstract)的数据库的数据库, , 提供提供文献的线索；文献的线索；部分文献（约部分文献（约5%5%）提供免费全文）提供免费全文( (链接网上免费资链接网上免费资源或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全文数据源或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全文数据库中的全文。库中的全文。 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 91. Pubmed简介来源期刊来源期刊 50005000多种多种 English English 约约4800 4800 （约

6、占（约占85%)85%) Chinese Chinese French French Japanese Japanese Italy Italy Germany Germany期刊论文发表期刊论文发表时所用的语言时所用的语言2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 10PubMed中的非英文文献中的非英文文献2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 11PubMed主页基本检索 主题词检索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 123、PubMed检索基本

7、检索 简单检索 高级检索主题词检索智能检索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 133.1 PubMed基本检索简单检索检索词的输入形式：（1）单词、短语、缩写 如，interleukin；stomach cancer；AIDS（2）著者姓名：如，Smith W （3）期刊相关信息：刊名全称、缩写、ISSN 如，Cancer Research、JAMA5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 143.1 PubMed基本检索检索规则逻辑运算 and(空格)、or、not词语检索

8、“single cell”；“liver cancer”截词检索 bacter*， disease? bacter disease bacteria diseases bacterium作者检索 smith ja; jones k julia s wong; wong julia s(2002年始） 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 15例: 肝癌的化学疗法2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 16例: 肝癌的化学疗法2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Infor

9、mation 173.1 PubMed基本检索高级检索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 183.1 PubMed基本检索高级检索字段限定检索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 19 PubMed检索字段 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 203.1 PubMed基本检索 Limits功能1)字段限定检索2)限定文献类型、语种、出版日期、年龄、性别、研究对象等2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Informat

10、ion 21Limits功能 （限定检索）2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 22字段限定2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 23 Limits：限定文献类型、语种、出版日期、年龄、性别、研究对象等2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 243.1 PubMed基本检索检索历史2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 25查看检索历史，进行逻辑运算2022-5-95/9/2022Dept. ofMe

11、dical Information 263.1 PubMed基本检索实例1 1、哮喘治疗、哮喘治疗( (限定题目字段限定题目字段) )的英文综述文献的英文综述文献2 2、近五年来中国研究者发表的有关、近五年来中国研究者发表的有关AidsAids病研究的文病研究的文献献2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 273.2 PubMed主题词检索(MeSH）2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 28什么是主题词(MeSH词)?主题词是经人工主题词是经人工规范化处理规范化处理的最能表达文章主题概的最能表达

12、文章主题概念的语词。所谓规范化处理，就是在文献存储时，念的语词。所谓规范化处理，就是在文献存储时，对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的对文献中的同义词、近义词、多义词等加以严格的控制和规范，使得同一主题概念的文献相对集中在控制和规范，使得同一主题概念的文献相对集中在一个主题词下。一个主题词下。 主题词主题词 关键词关键词 NeoplasmsNeoplasms neoplasm neoplasm、tumorstumors、tumortumor、cancercancer AspirinAspirin aspirinaspirin、acetylsalicylic acidacetylsali

13、cylic acid、 micristinmicristin、 solprinsolprin2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 29 Medical Subject Headings, MeSH字顺表字顺表(2(2万多个医学词汇万多个医学词汇) ) 如如: :aspirin,hepatitis,asthmaaspirin,hepatitis,asthma等等 树状结构表树状结构表（分类表）分类表） 1616大类大类副主题词表（副主题词表（8080多个副主题词）多个副主题词）2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Inf

14、ormation 30MeSH字顺表2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 31MeSH树状结构(Tree Structures)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 32MeSH副主题词表(Subheadings)Abnormalities、Administration & Dosage、Adverse Effects、Analysis、Anatomy & Histology、Biosynthesis、Blood、Complication、Congenital、Cytology、

15、DiagnosisDiagnosis use、Diet therapy、Drug therapy、Epidemiology、Etiology、Genetics、Immunology、Injuries、Metabolism、Microbiology、Mortality、Pathology、Psychology、Surgery、Therapeutic Use、Therapy.2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 33MeSH的标引和检索MeSH应用 PubMed（Medline） 中国生物医学文献数据库(CBMdisc) 医学搜索引擎标引人员根据文

16、章的内容，给出多个MeSH词，以确切描述一篇文章内容的重点。检索人员根据检索需求，选择相关MeSH词进行检索。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 34例:肝癌的手术治疗2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 35例:肝癌的手术治疗2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 362022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 372022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information

17、 382022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 39MeSH词检索的特点不必考虑自由词的各种变化形式，提高检索效不必考虑自由词的各种变化形式，提高检索效率。率。可以很容易地检索宽广的概念，提高查全率；可以很容易地检索宽广的概念，提高查全率；MeSHMeSH词一般都反映了记录较为重要的内容，具词一般都反映了记录较为重要的内容，具有较高的检准率；有较高的检准率；可以选用相关的副主题词进行组配，对检索进可以选用相关的副主题词进行组配，对检索进行限定。行限定。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 40举例:

18、消化系统疾病的CT诊断扩展主要主题2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 41 3.3 PubMed的智能检索2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 42词语自动匹配，优化检索策略自由词和MeSH词联合2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 43PubMed智能检索原理对于输入检索框中的非限定检索词，系统将依次到MeSH词转换表、刊名转换表、短语表以及作者索引表中进行词语匹配查找。检索词加入有些限定（如字段限止, 引号等），自动匹配检索功能关闭。 例：

19、 heart diseaseti“liver cancer”2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 44自动匹配检索功能关闭2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 454. PubMed检索结果处理Display(Display(显示显示) )Send to(Send to(输出输出) )2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 46Display(检索结果显示)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 47

20、Send to(检索结果输出)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 48Clipboard剪贴板可集中存放一次或多次检索结果当中的选定记录，方便用户集剪贴板可集中存放一次或多次检索结果当中的选定记录，方便用户集中打印、下载文献。剪贴板中可存的最多记录为中打印、下载文献。剪贴板中可存的最多记录为500500条，如果八小时内条，如果八小时内无作何操作，记录将自动消失。无作何操作，记录将自动消失。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 495. PubMed链接Related ArticlesFull

21、Text2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 50Related Articles(相关文献链接)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 51Full Text(全文链接)网上免费资源 或者自己的图书馆已经购买的电子期刊全文数据库中的全文 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 526. My NCBI(个性化功能) 2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 536. My NCBI(个性化功能)2022

22、-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 546. My NCBIMy Saved Data2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 556. My NCBI Save Search2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 566. My NCBI Save SearchEmail发送新文献跟踪专题最新文献2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 57通过My NCBI查看新文献2022-5-95/9/2022Dept.

23、 ofMedical Information 586. My NCBISearch Filters2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 596. My NCBISearch Filters2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 602022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 616. My NCBIPreferences2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 627. 其他辅助工具2022-5-95/9/2

24、022Dept. ofMedical Information 637.1 Journal Database可以从期刊的名称可以从期刊的名称( (全称或缩写全称或缩写) )、ISSNISSN号、刊名中的任意词来查找期刊信息。号、刊名中的任意词来查找期刊信息。2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 642022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 65专为临床医生设计的查找有关某一疾病的治疗、诊断、病因、预后等与临床密切相关问题的文献。7.2 Clinical Queries检索系统评价(循证医学证据)2022-5-95/9/2022Dept. ofMedical Information 667.3 Citation Matcher 引文匹配器引文匹配器可通过已知的刊名、日期、卷、引文匹配器可通过已知的刊名、日期、卷、期、论文首页码、作者名等任一项信息查找期、论文首页码、作者名等任一项信息查找论文的详细信息。论文的详细信息。 经常用于核对参考文献经常用于核对参考文献2022-5-95