AB液质操作规程完整

1、第一部分开关机AA、开机1打开UPS电源，打开氮气发生器（气瓶）,确认Curtaingas的输入压力为0.4MPa,gas1/2为0.7MPa,exhuast为0.4MPa。打开机械泵电源开关（5500系列直接打开质谱主机电源，仪器自动启动机械泵）等机械泵工作至少30min打开质谱主机电源开关过夜抽真空BB、关机1?停止输液：关停针泵或液相泵，或断开输液管线（一般质谱主机Standby后液相系统也自动待机，输液泵自动关停，但建议操作人员再次确认，必须保证没有任何液体再泵入质谱）2?使仪器待机，并灭活配置2?关闭质谱仪主机电源开关（5500系列只需按下电源开关旁的VENT按键排放真空）3?B械泵

2、继续工作至少30min4?关闭机械泵上的电源开关（5500系列会自动关停机械泵，待机械泵停止后即可关闭5500系列主机上的电源开关）5?关闭气体发生器或气瓶第二部分调谐1、PPG就是正离子校正液，PPG3000负离子调谐液，本台仪器只用两瓶校正液，正离子一瓶，负离子一瓶。洗液一瓶50%的甲醴水。调谐前先用洗液洗针两次。吸校正液的时候慢慢吸，避免吸入气泡，吸好以后将针泵卡住。再将高度调到5,将管路重新连接。不再连接六通阀，由质谱直接进样，且将针泵的速度调到10PL/m。2、调谐液弄好后在仪器面板工具栏上：TOOH项目一创建项目。此项目为一个文件夹，文件夹里面包括所有此次采集的信息，方法、序列等，

3、且所有采集的项目都固定在一个文件夹下面：D:/AnalystData/Project。新建项目的时候，弹出窗口中有个AddAll,可以创建孙文件夹。3、联机：软件打开后在左上方硬件配置（单机选中，双击打开）-只需选中仪器MBactiveprofile。图标变为绿色，表示联机成功。调谐只需要选中质谱。仪器的实时状态可以点击右下方的图标，质谱和液相都是单独观察，质谱要注意真空度，为0.5.4、调谐一手动调谐一项目（文件夹）选中下拉菜单中的Installation20161102（为系统默认的调谐文件夹）,先Q仔startsyringpump（打开针泵）一start（质谱），开始采集以后观察基线是否

4、平衡，若等两分钟还未平衡好，则手动将针泵往上抬。5、平衡好后（基线平稳则为平衡好），重新进样，重新点击startsyringpumpoResolution（分辨率）一advaneed（高级选项）（看到结果后调节质量轴和分辨率做准备，只能先打开这个，再打开谱图）一实时质谱图右键一openfile随便点一个框一软件上方的从谱图校正-PPG.POS正离子）-start曲现三行：（1、质量轴。2、分辨率。3、两次调谐的差异）一若质量轴有差异一右上角一yes若分辨率飞离出虚线一offset（偏大调大，偏小调小）输入校正的数值，再重新进样，如此反复，直到点落在虚线以内，实线代表最合适。&校正好后仪

5、器会自动保存，直接关掉窗口即可。负离子调谐和正离子调谐步骤一样，只是在选择方法的时候要注意选择负离子模式。还有看结果时要选择PPG3000此为负离子调谐液。调谐因针泵流速很小，10PL/ml,所以不需要设定离子源温度及辅助气，直接设定喷雾器流速为50,就可以将样品雾化，气帘气也不需要设置，因为没有多余的溶剂需要吹走。1. 第三部分：方法优化在Analyst软件Tools菜单中选择ProjectCreateProject在Projectname项输入新建的Project名称。注意，不要点选窗口中的其他按钮！点击OK,确认新建Projecto在Analyst软件界面下，双击导航栏内Hardware

6、Configuration。在弹出窗口中选择MassOnly，点击ActivateProfile，激活MassOnly（只联接质谱主机）。2. 在导航栏内单击TuneandCalibrate进入调谐模式。点击上方工具条中的T钮。此时，应注意到主机有才卜”声音，表明进入调谐状态。此时右下角质谱状态显示绿色。双击ManualTuning,进入质谱参数设置及运彳亍窗口。4使用1mL玻璃进样针吸取适当标准溶液，置于进样针座上。点击MSMethod下拉菜单，选择SyringePumpMethod,设定针泵流速FlowRate为10PL/mirt点击StartSyringePump按钮开针泵进样。5. 返

7、回MSMethod，选择扫描模式ScanType为Q1MS,设定扫描速度ScanRate为10Da/s,设定扫描范围StartStop设定为50化合物分子量。DP预输入60。点击start开始采集数据。运行稳定后，注意观察是否有预期的母离子出现，并控制其响应值在约E4以下。点击stop,选择第一个峰（后面是同位素峰）的平稳段，双击，选中母离子。点击右键，选择DeletePane设定Scantype为产物离子扫描ProductIon（Ms2）,扫描速度200Da/s,选择扫描正/负离子，输入母离子（productof）,设定扫描范围startstop为50MW+20，遗盖可能的子离子质量范围，点

8、击compoud标签，设定（DP）60,（CE）5。6. 点击start,开始采集数据，注意观察是否有预期的母离子出现。手动调节CE,以5eV为步长，逐渐增加。每次增加后稍作等待，直至目标化合物的子离子清晰看见。选择平稳的一段，双击，选择子离子。7. 选择ScanType为MRM。设定参数表格中的Q1对应的母离子，Q3对应的子离子,time（ms）为50,ID值设为名称1（定量），名称2（定性）。11点击EditRamp,在Parameter下选择CollisionEnergy，点击OK。点击start开始采集数据，记录每个MRM通道的最佳CE电压。在MRM参数设定表中，右键点击。选择Coll

9、isionEnergyCE，调出表格中的CE列，输入每个MRM通道的最佳CE电压值，精确到个位数。重复以上步骤，在Parameter项下选择DeclusteringPotential,优化并保存DP。完成后选择菜单File/Save保存采样方法，文件名.dam。第四部分：方法建立一、LCMS方法的建立：1、连接仪器：打开HPLC质谱电源，将HPLC系统接上柱子，将6号出口管线与离子源连好。调离子源喷雾针位置到2mm处，双击HardwareConfigure,在硬件配置菜单下单击LCMS（液相与质谱联用），单击Activateprofile激活仪器，会听到笛的一声，说明仪器已经连接上。2、确认液

10、质同步：选择项目（之前优化方法的时候已经建立的项目）；双击Buildacquisitionmethod新建方法，弹出新建方法模板。在模板左侧点击acquisitionmethod，模板右边显示对应的参数，确认synchronizationmode选择LCSync,表示液质同步。3、设置MRM参数：点击方法模板左侧的MRM，在模板右侧ScanType下选择MRM;在polarity下选择化合物极性：Positive正离子）、Negative（负离子）；Duration为15min（与液相分离相同的时间）；表格中Q1:母离子分子量,Q3（Da）:子离子分子量,Time（mse?:50,ID栏：化合

11、物名称（离子对名称后空格加1为定量，空格加2为定性），在表格中右键分别单击DP、CE,点击工具栏的OPEN打开之前优化的方法参数，调出DP,CE值，选中整行,Ctrl+c（复制）参数，关闭窗口，再Ctrl+v（粘贴）参数）；最后点击Editparameter设置离子源参数：Source/Gas项用以下推荐值：CUR35,IS:5500（正离子）或-4500（负离子）,TEM600,GS160,GS270,点击OK。4、设置液相参数：点击模板左边的shimadzuLCsystem在右边的pumps栏下，设置stoptime（运彳亍时间）为15min,flow流速为1mL/min,A为水相设为95

12、%,B为有机相设为5%（设置时改B,A自动），泵最大压力为50;点击timeprogram设置液相梯度：例咪口坐类梯度设置：Time(min)ABp95%5%55%95%105%95%10.195%5%1595%5%接着在右边的Autosampler栏下，设置清洗时间，在Rinsemode下选择Beforeandafter（前后都洗），并设置清洗时间为5s,清洗液用50%甲醴水。最后点击保存按钮，在保存窗口输入该方法的名称。二、建立批处理：1、双击Buildacquisitionbatch，在右边窗口set栏为批处理保存的文件夹命名以便识别，再点击addse，最后点击addsample再选择之

13、前建立的LC-MS方法，在弹出的窗口内的number（进样样品数）处填入需要进样的样品个数，点击OK。2、在加入的样品列表内依次填写samplenam（样品名称）、viaposition（样品瓶的位置）、inj.volunme（进样体积：一般5微升或10微升）。3、在submit项下点击submit按钮以提交样品序列。4、点击工具条上左上角的viewqueue按钮，可查看已提交的样品。此时将仪器从校正状态退出，进入分析模式。确认泵已打开，首次进样液相先排气，再平衡仪器：先点击工具条上的equilibrate平衡按钮，在弹出的平衡窗口中输入平衡时间10min，点击ok。右下角图标会变黄，待平衡结

14、束后此处图标会变成绿色，此时即可点击startsample按钮采集样品信息，仪器会自动对已提交的全部样品进彳亍采集。第五部分数据处理双击打开Multiquilt,选择项目，点击File下的荧光棒型图标，点击sample,选择需要的标准品和样品数据，点击next,createnewmethod为方法命名，点击next，选择一个有代表性的样品（一般选择浓度较大的标品数据），设置分组（同一物质定量离子和定性离子设置为一组），并指定内标，next,对每个物质进行积分。1. 设置积分参数：a、CausianSmoth（平滑）：一般是0,如有毛刺可改成1或2;b、ExpecetedTime（保留时间）：一

15、般不动c、Expectedtime范围：一般30s,表示在保留时间甘s范围d、最小峰宽e、最小峰高f、背景噪音扣除：可调整目标峰基线以下被积分的面积，比例越高积分越往下，必要时调整。g、分峰因子：峰有分叉时设置，如有两个分叉，设置为2,峰分叉不能大于2h、单位：设置单位，勾选Applyunitstoall可将此单位用于所有化合物点击next,点击finish。在新跳出窗口内将标准品选定，输入浓度。查看各化合物积分是否正常，点击第三个图标查看标准曲线。报告打印：点击File,createreport,Reporttemplate（选择才艮告模板，一般用sample1和标线，内标报告只能用samp

16、le1,2,3），命名，选择存储报告位置，点ok。信噪比：选择项目，双击opendatefile，点击sample,选择低浓度样品，点击ok,点击XIC,选择定量离子，点击ok,选中峰，按住shift，选峰附近的一段时间，点Script，点击S-ToNScript,即可得到结果。第六部分：LC-MS离子阱原理及其应用原理：在进行多级质谱分析（MS-MS）时，首先限定目标质量的离子。通过调整交变电压，将大于以及小于目标质量的离子射出，从而使得仅有一个质量的离子存在于离子阱中并将其富集。目标质量的范围被称为IsolationWidth。之后通过向离子阱内注入气体（通常为氮气或氮气），与离子发生碰撞

17、使其被打成碎片。操作方法：首先在Analyst中打开一个成熟的MRM采样方法，然后右键单击AcquisitionMethod中的MRM,在弹出菜单中选择AddIDACriteriaLevel。在新增的IDA-FirstLevelCriteria页面中设置相关逻辑选项（其中四项尤为重要）1）Select“X”to“Y”mostintens，表ea在多个组分色谱共流出时,指定触发最强的若干个母离子，“1to2表示最强和次强的两个母离子，“1to3表示最强和次强和第三位三个母离子，以此类推。请注意，如果选择了“1to2或“1to3,则后续的EPI个数应调整为对应的两个或三个。（一般选择两个以下）2）

18、AfterDynamicBackgroundSubtractionofSurveyScan,表示执彳亍动态背景扣除，使得感兴趣的母离子都尽可能的获得触发EPI的机会。该选项尤为重要，为必选项。3）Excludeformertargetions在某些情况下，一次数据采集中，如果同一个MRM通道内可能有几个不同保留时间的色谱法出现，那么应选择Never,表示所有色谱法都依次触发执行EPI。4）Whichexceeds设定MRM信号强度阈值超过此阈值才会触发EPI。通常为500或1000.然后点选IncludeList激活强制触发的母离子。Mass（Da）列输入需要的母离子质量数，RT（min）列输入该母离子的保留时间，Width（sec）列输入开放的保留时间窗口。完成以上IDACriteria逻辑选项设定后，添加EPI方法。首先，在IDACriteria上点击右键，在弹出菜单中选择Addexperimento软件会添加一个新的experiment,并自动与上一个MRM保持一致。然后在ScanType处选择EnhancdeProduc