NGS试验室建设标准与要求规范

1、NGS实验室建设标准与要求一、高通量测序（NGS实验室简介1.1 NG弦验室又叫高通量测序检测实验室。NGS!下一代测序技术（Next GeneratioSequenciNG高通量测序技术的简称。高通量测序技术是对传 统SANGE恻序（称为一代测序技术）革命性的改变，可同时对几十万到 几百万条核酸分子进行序列测定，同时高通量测序使得对一个物种的转 录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能，也称为深度测序（DEEP SEQUENCING1.2 由于NGSK术对所检测的核酸模板进行大量扩增， 容易出现实验室污染 导致检测结果准确性下降；另外 NGSJ术要求高、影响因素多，实验过 程处理不当易导致检测

2、结果准确性下降或检测失败。因此临床基因扩增检验实验室技术验收和规范化管理是 NGSK术本身需要,也是在临床上 顺利应用该技术前提。二、NGSS验室临床应用的基本条件2.1 必须拥有符合临检中心相关规定的标准 NGSS验室。2.2 检测设备必须符合标准NGSS验室设置要求：高通量测序仪及配套服务 器；高通量测序检测试剂盒；通用电脑；自动分析软件，实验室样本信 息管理系统等。2.3 检测人员必须通过专门的技能培训， 并获得省级以上卫生计生行政部门 颁发的临床基因扩增检验技术上岗证书。NGSS验室必须建立严格的实验室管理制度、建立标准化操作程序（SOP、建立系列质量管理文件 等，确保实验室日常运行符

3、合国家卫生部的要求，确保检测结果准确、 确保实验室卫生安全，确保实验室长期稳定运行。2.4 NGS临床应用必须在无菌无尘环境下进行操作。三、NGSS验室建设基本要求主体为彩钢板、铝合金型材。室内所有阴角、阳角均采用铝合金50内圆角铝，从而解决容易污染、积尘、不易清扫等问题。结构牢固，线条简明，美 观大方，密封性好。3.2 标准的各区分隔和气压调节将检测过程分成试剂准备、样本制备、PCFT增和高通量测序四个独立的实 验区。整个区域有一个整体缓冲走廊。每个独立实验区设置有缓冲区，同时各区通过气压调节，使整个检测实验过程中试剂和标本免受气溶胶的污染 并降低扩增产物对人员和环境的污染。可打开缓冲区和P

4、CR扩增区的排风扇往外排气，在实验区的外墙上和各扇 门上都安装有风量可调的回风口，空气通过回风口向室内换气。3.3 消毒在每个实验区和缓冲区顶部以及传送窗内部安装有紫外灯，供消毒用。在各 区还设置移动紫外线灯，对实验桌进行局部消毒。3.4 机械连锁不锈钢传递窗试剂和标本通过机械连锁不锈钢（不建议使用电子连锁方式）传递窗传递， 保证试剂和标本在传递过程中不受污染（人物分流）。3.5 地面地面建议使用PVCS材地面或自流坪地面，整体性好。便于进行清扫，耐腐 蚀。没有条件的也可采用水磨石地面，或大块的瓷砖（至少800MlVK 800MM接缝需要小于2mm3.6 照明灯具要选用净化灯具，能达到便于清洗

5、、不积尘的特点。NG砥验室应根据自己的检验项目、所采用的检测技术平台和工作量来决定 分区的多少及各区域的空间大小，至少具体需要多少个区，同样是“个体化” 的，以“工作有序、互不干扰、防止污染、报告及时”作为基本原则。四、各项目实验室建设标准产前筛查与产前诊断（全基因组低拷贝测序技术）1.实验室平面图测序区空气流向缓冲问专用走廊文库扩增标本与文与检测区库制各区试剂准备区空气流向标本与文库制备区文库扩地与检测区>才前析 < 所EM丽*雷Up员建味阳Q图1:产前筛查与诊断实验室平面图2.技术流程图满序区 ->岩卓寰晟功收图2:产前筛查与诊断技术流程图分区压力温度相对湿度照明专用走廊

6、0Pa20-25 C40%60%主实验室300LX,其余房间200300LX缓冲区+5Pa试剂准备室+15Pa标本与文库制备区+10Pa文库扩增与检测区-5Pa测序区-10Pa4 .分区功能4.1 试剂准备室主要功能：在NGS±程中使用到的试剂的配制、分装和保存。4.2 标本与文库制备区主要功能：血液处理、血浆制备、 DNM取、DNRt段化、DNA羊品的纯化、 DN顺度检测、末端修复、接头连接、构建样本的测序文库。4.3 文库扩增与检测区主要功能：文库构建后的PCFT增与纯化、文库浓度检测、文库的混合及混 合后的质检分析。4.4 测序区主要功能：测序模板制备（乳液 PC叫磁珠富集回收

7、）、上机测序、数据分 析、报告审核及发放。5 .仪器配置主要仪器设备：加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、 移液器、可移动紫外灯和超净工作台等。5.1 标本与文库制备区主要仪器设备：冷冻离心机、微量台式离心机、掌上三管离心机、涡旋震荡 器、垂直混合仪、移液器、可移动紫外灯、生物安全柜、冰箱、托盘天平、 Qubit 2.0核酸定量仪、电脑（可连接互联网）、条形码打印机、普通打印 机、扫描枪、磁力架等。5.2 文库扩增与检测区主要仪器设备：PCRK、QPC股、Qubit2.0核酸定量仪、可移动紫外灯、超 净工作台、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、 UPS冰箱、移液器、磁 力架等。

8、5.3 测序区主要仪器设备：高通量测序仪、PC电脑、打印机、UPS恒温金属浴、纯水 仪、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、超净工作台、可移动紫 外灯、磁力架、PCRK等。胚胎植入前遗传学诊断（全基因组低拷贝测序）1.实验室平面图电泳区文阵用渊区空气源向&空气薄向史戈商携片同m31履冲两"_为_&V r1ing一区空气流向史气前向试剂用缶区空T流向 A< 3 二3二 a an2.技术流程图电泳区MG A制备区隹*握怛步 能 皿疝酒菱站反加“JT 4 It ft *图4: PG酸术流程图授告发放溜序区事澧1:"3.技术参数分区压力温度相对湿度照明专

9、用走廊0Pa20-25 C40%60%主实验室300LX,其余房间200300LX缓冲区+5Pa试剂准备室+15PaWG制备室+10pa扩增一区-5pa标本检测区-10Pa测序区-15Pa电泳区0Pa4.分区功能4.1 试剂准备室主要功能：在NGS±程中使用到的试剂的配制、分装和保存。主要功能：基因组DN解放、全基因组DNAT增。4.3 电泳区主要功能：DNA电泳检测及结果反馈、DNA丁断等4.4 扩增一区主要功能：DNAt段的末端修复与纯化、接头连接与纯化、文库混合、缺口 平移。4.5 文库检测区主要功能：文库浓度质检分析。4.6 测序区主要功能：测序模板制备（乳液 PC叫磁珠富集

10、回收）、上机测序、数据分 析、报告审核及发放。5.仪器配置5.1 试剂准备区主要仪器设备：冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、 可移动紫外灯和超净工作台等。5.2 电泳区主要仪器设备：电泳仪、微波炉、凝胶成像仪、冰箱、掌式离心机、涡旋振 荡器、移液器、可移动紫外灯等。5.3 WG制备区主要仪器设备：PCF、超净工作台、冰箱、掌式离心机、涡旋振荡器、移 液器、可移动紫外灯等。主要仪器设备：PCRK、可移动紫外灯、超净工作台、冰箱、微量台式离心 机、涡旋振荡器、UPS移液器、磁力架等。5.5 文库检测区主要仪器设备：QPCFa、Qubit2.0核酸定量仪、可移动紫外灯、超净工作 台

11、、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、冰箱、移液器等。5.6 测序区主要仪器设备：高通量测序仪、PC电脑、打印机、UPS恒温金属浴、纯水 仪、冰箱、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、超净工作台、可移动紫 外灯、磁力架、PCF等。遗传病诊断十月中瘤诊断与治疗（杂交捕获测序技术+SANGEFRM序验证）1.实验室平面图图5：月中瘤诊断实验室平面图实验流程M，r曲及检Jfl*岫31trtHl +产本文U区标，库鲁Ort-Csptvred- Mw Meit救晦朴析(Cr6:月中瘤诊断技术流程图S.nger测序流程标本与文库制备区> -* _ , .步塔一区电泳区川仙 丽刻璃 一. 目的片桎MR反

12、度息先IT增二区分区压力温度相对湿度照明洁净走廊0Pa20-25 C40%60%主实验室1 300LX,其余房间200300LX缓冲区+5Pa试剂准备室+15Pa标本与文库制备区+10PaDNA丁断区+10Pa杂父捕获区（扩”区）-5Pa文库扩增区（扩增二区）-10Pa文库检测区-10Pa测序区-15Pa电泳区0 Pa4 .分区功能4.1 试剂准备区主要功能：在NGS±程中使用到的试剂的配制、分装和保存。4.2 标本与文库制备区主要功能：样本接收、样本前处理、全基因组 DNAI取以及各种样本DNM 者RNA勺提取、DNAt段化、DNA屯化、DNA&度测定、DNAt段的末端修复

13、 与纯化、接头连接与纯化。4.3 DNA丁断区主要功能：DNA打断（片段化）。4.4 电泳区主要功能：片段化DNAt泳检测及结果反馈。4.5 杂交捕获区（扩增一区）主要功能：目的DNAt段的杂交捕获与纯化，Sanger测序目的片段扩增与纯 化、Sanger测序PCFO准备。4.6 文库扩增区（扩增二区）主要功能：杂交捕获后扩增与纯化、文库浓度质检分析、及 Sanger测序的 PCFT增反应与纯化。4.7 测序区主要功能：测序模板制备（乳液PCRt磁珠富集回收）、上机测序、及Sanger 测序。5 .仪器配置5.1 试剂准备区主要仪器设备：加样器、冰箱、分析天平、微量台式离心机、涡旋振荡器、移液器、可移动紫外灯和超净工作台等。5.2 标本与文库制备区主要仪器设备：微量台式离心机、掌上三管离心机、恒温金属浴、移液器、可移动紫外灯、生物安全柜、冰箱、托盘天平、Qubit 2.0核酸定量仪、PCR仪、电脑（可连接互联网）、条形码打印机、普通打印机、扫描枪等。主要仪器设备：Covaris S220超声波打断仪、冰箱、掌式离心机、涡旋振荡 器、移液器、可移动紫外灯等。5.4 电泳区主要仪器设备：电泳仪、微波炉、凝胶成像仪、冰箱、掌式离心机、涡旋振 荡器、移液器、可移动紫外灯等。5.5 杂交捕获区（扩增一区）主要仪器设备：PCRK、可移动