医学文献检索整理

1、医学文献检索整理、 P110 1、情报：是针对一定对象的需要而传递的有参考价值的新信息和新 知识。情报的三大特点：知识性、传递性、效用性。2、信息 Information ：是事物存在和运动状态及其特性的反映。 四大种类：自然信息、生物信息、机器信息、社会信息3、文献 document/literature ：记录着知识的载体。凡属人类的知 识用文字、图象、符号、声频、视频等手段记录在各种形式的载体上 供交流传播的都统称为文献。4、信息素养( Information Literacy )：是人们能够判断确定何时需 要信息、 并能够对信息进行检索、 评价和有效利用的能力。 信息素养 包括信息意识

2、、信息技能和信息伦理三方面。二、 信息能力：是指能够有效地获取、加工和利用信息的能力，包 括操纵信息工具的能力、检索获取信息的能力、加工提炼信息的 能力、整合创建信息的能力、交流传播信息的能力等。6、 医学文献的类型按内容性质分类：( 1)一次文献 (primary sources)又称原始文献。如：期刊论文、科技报告、会议文献、学位论文、专利说明书( 2)二次文献 (secondary sources) 即检索工具。如：目录、索引、 文摘等( 3)三次文献 (tertiarysources) 是根据二次文献提供的线索，选用大量一次文献的内容， 根据一定的需要和目的， 进行系统整理、 概 括论

3、述、分析综合而编写成的文献。如：综述、教科书、词典、百科 全书、手册、指南、年鉴、进展等( 4)零次文献 (non-printed sources) 即非出版型文献。如：原始 素材、手稿、信函、实验记录、统计数字以及各种口头交流的信息、 经验等二、 期刊影响因子：指期刊近两年的平均被利用率。计算公式为： IF=(C 2+C3)/(A 2+A3). 其中： A2=去年出版的文献数， A3=前年出版的 文献数； C2=去年出版的文献在今年被引用的次数， C3=前年出版的 文章在今年被引用的次数。期刊的 IF 越高，其刊载的文献被引用率越高，说明这些文献报 道的研究成果作用和影响力就越大， 一定程度

4、上反映该刊物的学术水 平就越高。因此，我国有关部门将其作为评估期刊质量、论文水平、 研究业绩等的指标。8、 核心期刊 core journal: 是指学科的主要期刊， 具有数量少(一般占期刊总数的 5%），信息量大（占期刊信息量的 50%以上）的特 点。9、 信息检索类型：（1）文献检索 （document retrieval） ：以文献 为检索对象（ 2）数据检索 （data retrieval）：以特定的数据为检索对象（3）事实检索 （fact retrieval）：以特定的事项为检索对象二、 文献检索原理 文献检索的全过程包括：文献的存储和检索两个过程。（1）存储过程：主要是对文献进行标

5、引，形成文献特征的标识，为 文献提供有规可循的检索途径的过程。（2）检索过程：就是根据用户的需求，确定提问概念（主题检索概 念），然后选用一定的检索语言，将此提问概念转换成检索语言特征 标识，按此到检索系统中去查得文献线索， 最后对所查得的文献线索 进行逐篇筛选， 阅读相关的电子版全文， 或通过有关联合目录， 查到 收藏原文的单位，即可有目的地去申请借阅和复制。11、检索语言： 指在文献的存贮和检索过程中共同使用的语言。 有分类、主题、代码检索语言三大类型12、文献检索的步骤（一）分析研究课题并明确检索要求（二）根据检索要求确定检索工具（三）选择检索方法常用法：顺查、倒查、抽查追溯法：利用已有

6、文献（最好是综述文献）后面所附的参考文献进行追溯查找分段法 交替使用常用法与追溯法。浏览法（四）确定检索途径和检索标识（五）通过文献线索来获取原始文献13、查全率与查准率是衡量检索效果最重要且最常用的指标。（1）查全率是指系统在进行某一检索时，检索出的相关文献与系统 文献库的相关文献总量之比率；（2）查准率是指系统在进行某一检索时，检索出的相关文献量与检 索出的文献总量之比率。查准率（P） = a/（a+b） *100%查全率?= a/（a+c） *100%相关文献非相关文献总计被检出文件a（ 命中 ）b（ 误检）a+b未检出文件c（ 漏检 ）d（正确拒绝）c+d总计a+cb+da+b+c+d

7、查全率与查准率之间存在着矛盾的互逆关系。 在同一个系统中， 查全率提高，查准率就会降低；而查准率提高，查全率必然减低。一般 来说，查全率控制在 60%7，0 查准率控制在 40%50%是较好的检索正确运用逻辑组配运算符： “与”（缩检）提高查准率“或”（扩检）提高查全率 “非”（缩检）提高查准率（慎用） 二、数据库1、中国生物医学文献光盘数据库 （ CBM）使用的是 Mesh词表 常用字段： AB 中文摘要（详见 P1516）AD著者地址AU著者CT特征词MH主题词PY出版年PT文献类型TA期刊名称TI中文题目2、中文全文型检索工具包括：中国医院知识仓库( CHKD)、万方全文 期刊数据库、维

8、普期刊数据库3、中国医院知识仓库( CHKD)分为：CHKD期刊论文库、 CHKD博硕士 论文库、会议论文库和 CHKD报纸库共四个全文库。4、 IM月刊本主要有以下三部分组成：主题索引、著者索引及综 述文献主题索引(不知道的 IM是神马的童鞋请参见 P44) *MEDLAR(S Medical Literature Analysis and Retrieval System)系统，及医学文献分析和检索系统5、Medline 光盘数据库是当前国际上最有权威的生物医学文献数据 库，其中包括三中重要索引，即医学索引 (Index Medicus)、牙 科文献索引( Index to Dental

9、Literature)和国际护理索引( International Nursing Index)6、Medline 常用字段：TI 篇名或题名(详情参见 P5354)AU 著者姓名AD 通讯地址SO 来源PY 出版年份LA 语种CP 出版国家AB 文摘MeSH医 学主题词MJME主 要概念医学主题词PT 出版类型TG 特征词SB 子文档7、Medline 中的检索技能（详见 P5455）（1）and（逻辑乘，与 A and B表示文献中同时包含检索词 A 和 B 的文件为命中文献）缩小检索范围（2）or （逻辑和，或 A or B 表示包含检索词 A 的文献或者 包含检索词 B 的文献为命中文

10、献）扩大检索范围（3）not（ 逻辑反，非 A not B 表示包含检索词 A 但同时不包 含检索词 B 的文献是命中文献 ）（4）with （同字段缩小检索 A with B 表示检索词 A和 B不 但要同时出现在一条记录中， 还要同时出现在一个字段里的文献为命 中文献）（5）near（相邻检索 A near B 表示检索词 A和检索词 B同 时出现在一个句子中，并且相邻，在 near 后加一个数字表示邻近程 度，并且不论语序， 但所加单词不得等于大于这个数字， 检索所得的文献为命中文献）8、医学主题词表（MeSH）有字顺表和树状结构两个主要部分9、MeSH词表共有 82 个副主题词 *分析

11、这个副主题词只用于对空气、水或其他环境载体进行的化学分 析，不包括对组织、肿瘤、体液、有机体和植物进行的化学分析。血 液、脑脊髓液、 尿的分析用 “血液”“脑脊髓液”“尿”这些副主题词， 不能用分析。*治疗的副主题词：饮食治疗、药物治疗、放射治疗、治疗10、Pubmed拥有“自动词汇匹配技术” ，转换、匹配次序为： MeSH 转换、期刊转换、短语等转换表、作者索引11、Medline （OVID）数据库检索系统中： （详见 P99100）（1）在检索词的字根或词组后面加上字符“ $”与“：”能提供无 限制串字的功能，如 diagno$ 找出的是 diagnosis 、 diagnosis 、

12、diagnostic 、 diagnosticate 等等（2）有限制字尾串字功能的字符为“ $n”（n 为阿拉伯数字），可 用在著者、篇名及摘要检索，如输入 diagno$3 ，找出的是 diagnose 、 diagnosis ，但不会找出 diagnostic 、 diagnosticate（$3 表示串 03 个字母 ）（3）位置操作数（ adj 、adjn ）a、adj 代表此字中间除了停用字（貌似就是一个空格。 。）之 外，不会介入任何字，并且以用户输入的顺序来检索文献， 如输入“ blood pressure ”不会找出“ pressure blood ”（注 意：当键入两个或两

13、个以上的关键词，并且这些字中间以一 个空格隔开时，系统自动以 adj 的内定值来检索）b、adjn（n 为数字，可以是 199） ：在检索词中间加入 adjn ， n 表示字和字之间可以间隔几个字，并且字之间并没有特定 顺序。12、荷兰医学文摘简称 EM，报道学科范围包括生物医学、药理 学、公共卫生、职业卫生、工业医学、社会医学、环境卫生、法医学 等。但不收牙科学、护理学及兽医方面的文献。 （估计是道多选题， 记住不收什么就好）13、EM树状词表是一套既有上下位词呈分成等级的数状结构，又有 相互参照的字顺索引的规范化词表，约有 37000 个药物和医学词汇， 用于主题索引14、EMBASE中截

14、止词（ *）表示如 child* 有 child, children, childhood 等（详见 P118）15、美国生物医学文摘简称 BA有个姐妹刊生物学文摘 / 报告、 评论、会议（ Biological Abstracts/Reports, Reviews, Meetings ， 简称 BA/RRM）16、BA的辅助索引有：著者索引、物分类索引、生物种属索引、概 念索引、主题索引（详见 P128129）17、美国化学文摘简称 CA的索引体系分为：（老师说的时候只念 了期索引的分类）详见 P134136（1）期索引a、著者索引b、著者索引c、专利索引d、著作索引（这个是老师自己加出来的

15、，大家自己看着办。）（2）卷索引（3）累积索引（4）指导性索引（5）CAS来源索引（6）化学文摘选辑18、Webo f Knowledge 的核心内容：由 ISI 和 Derwent Information 建立的数据库（1）Web of Science（SCI 、 SSCI、A&HCI三大引文数据库 ）（2）Structure Search （化学反应 / 化合物数据库）（3）ISI Proceedings （ ISTP、ISSHP科学、社会科学与人文科 学会议录索引数据库）（4）Derwent Innovation Index（德温特世界专利创新索引数据库）（5）Current C

16、ontents Connect （现刊目次快讯数据库）19、ISI Web of Knowledge 支持 AND、OR、NOT和 SAME的逻辑组配， 其运算次序为： SAM、E NOT、AND、OR，括号内检索式作为一个单元优 先运行截词符“ * ”代表任何字符；“？”代表单个字符； “$”代表 01个字 符（详见 P161）20、Web of Science 检索方式：（ 1）General Search 普通检索（ 2）Cited Reference Search 引文检索（ 3）Advanced Search 高级检索（4）化学反应 /化合物检索（那老师加的，参见 18条的第（ 2）

17、条）21、JCR常用词语解释：*Impact Factor ：期刊影响因子是指该刊前两年发表的文献在当前年平均被引用次数*Immediacy Index ：及时指数是指该刊当年发表的文献在当前年平均 被引用次数*Cited Half-life: 被引用半衰期是指从当前年算起该刊被引用次数 达到全部被引用次数的 50%所需时间*五年引用影响因子（这个是老师加的，据说上课讲过，鉴于我没有 PPT各位自行补充）22、西文全文型检索工具有 Elsevier 全文电子期刊数据库、 Springer-LINK 电子期刊数据库、 EBSCO电子文献期刊数据库、 ProQuest Medical Librar

18、y 医学期刊全文数据库（以 Medline 做索 引，收录了 500 多种带有完整全文图像的重要的基础医学、 临床医学 及卫生健康方面的全文专业期刊） 、Blackwell 电子期刊数据库、 John Wiley 全文电子期刊数据库23、西文事实型检索工具有： Micromedex HealthCare Series 数据 库（由药物信息数据库、疾病信息数据库、毒理学信息数据库、补充 与替代医学数据库、 病患教育数据库组成） 那几个数据库的英语有兴 趣的同学自己参见 P208210三、 循证医学和搜索引擎1、循证医学（ Evidence-based Medicine ，EBM）从字面上讲是以证

19、据为基础的医学、遵循证据的医学，也有的翻译成“证据医学” 三个重要因素：病人、医生和最佳证据2、证据类型：系统评价（SR）、Meta-分析、随机对照试验 （RCT）、 临床指南（详见 P226227）3、证据的来源（这部分和书上有些出入， 那老师重点只讲了这些， 大家自行看着办，最好还是看看书） ：期刊、数据库（除书上列举 的还有 Dynamed、Best Practice 、 Micromedex）、网络期刊、网 络资源4、医学专业搜索引擎：（1） 常用搜索引擎： Google、Yahoo（2） 常用医学搜索引擎： Medical Matrix 、Medical World Search、M

20、edsite 、 HealthWeb、 HealthAtoZ 、MedExplorer四、医学论文写作（没划，各位参见 PPT，后面综述写作肯定是不要 的下面那些是上届的学长学姐整理的，大家看看吧）医学写作： 是用文字记录医学科学的知识， 把医学实践中的诊疗积 累、科研成果、教学经验用文字记录下来。 。它既是传播医学信息的 工具， 也是交流经验、 成果的手段； 既是医学资料存储的一种书面形式，也是医学信息利用的一个主要的组成部分医学写作的意义：2.3.4.1. 增强信息意识 培养研究能力 训练表达技巧 提高业务水平第一节 医学论文的含义1、医学论文：是对医学领域的现象（问题）进行探讨、研究和描

21、述 科研成果的文献。 它是以一定的科学理论为指导， 进行医疗、 科研和 教学方面的工作实践、 并将实践中所得的第一手感性资料， 经过归纳、 分析等思维劳动、最后撰写而成的书面总结。范畴：医学科研2、医学论文： 主要表达方式：说明、议论三大要素：论点、论据、论证（最主要的是论点和论 据）第二节 医学论文写作的基本要求 基本要求有：科学性、创新性、实用性、规范性、可读性1. 科学性科学性是医学论文最重要的特征。 科学性主要体现在两方面： 科 学的态度科学的方法科学的态度就是在写作过程中要遵守实事求是的原则 科学的方法是指从论文的选题、设计、实践到撰稿及发表所采用 的方法是否符合科学的原理2. 创新

22、性创新性是衡量和评价论文质量的重要标准。 医学研究的创新性主要体现在以下方面：利用已有的理论和方法进行理论分析和实验研究得出新的结果；利用其他学科的理论和方法解决了医学中有意义的问题；采用了新的实验方法、测试手段、操作手段、操作程序，获得 了有意义的实验结果；经过实验研究或调查分析，发现了新现象和新问题；对于国外虽已解决但国内尚未解决的方法和技术等问题， 经过 独立研究、分析和实践， 填补了国内的空白。3. 实用性实用性是指医学论文的实用价值。主要体现在：对社会和人类有一定的引导和推广价值；能增长人们的医学知识；能解决预防和治疗疾病的实际问题。4. 规范性规范性是指医学论文要有统一的格式。 目

23、前国内外生物医学期刊大多采用的是“温哥华格式”5. 可读性可读性表现在选词造句、 章法结构、 图表绘制、 修词手段等应尽 可能达到完美，叙述应力求做到严谨、准确、朴实、简明。第三节 医学论文写作的三大要素1. 论点论点就是著者在论文中所提出的观点。立论一定要符合以下三点： 第一、必须是正确无误 第二、必须是明确清晰 第三、必须是行文简洁，高度概括2. 论据论据是论文中用来证实论点的材料和证据。 论据包括理论性论据和事实性论据。 论据必须具有真实性、充分性、代表性和重复性。3. 论证论证是著者组织和安排论据来论述论点的方法和过程。 论证过程是理论联系实际的过程， 是摆事实讲道理的过程， 是分析

24、问题、解决问题的过程。第四节 医学论文的类型一 . 按论文的专业性质分1. 基础医学研究论文 基础医学研究论文主要是对医学中一些基础理论问题进行分 析阐述，从而揭示其本质规律的论文 研究手段：以实验室研究为主 研究形式：临床实验、动物实验2. 应用医学研究论文 应用医学研究论文主要包括临床医学研究论文和预防医学研 究论文研究类型：以临床疾病研究为主 包括：病例报告、病例分析、病案讨论、体会交流、 总结报 新技术新方法报道二. 按论文的研究手段分1. 调查性研究论文 调查性研究论文是基础医学和预防医学中经常使用的文体， 体各种生理数据和正常参考值范围的确定都是通过大量调查获得的。 调查性研究论文

25、可分为以下几种： 现况调查论文 回顾性调查论文 前瞻性调查论文 追踪性调查论文2. 观察性研究论文 观察性研究在临床医学研究中应用最广。特点：将研究对象加以部分控制和处理， 是医学科学认识的重 要源泉，也是检验医学理论的标准。3. 实验性研究论文 实验性研究广泛应用于临床实验和动物实验4. 总结经验性研究论文 研究者对某一问题的探讨和经验总结。 特点：事先没有周密的科研设计， 但对解决实际问题很有帮助。5. 整理资料性研究论文 知识再加工的文献，以综述、进展等形式为主。 特点：全方位、深层次、高品位三. 按论文的目的功用分1. 学术论文学术论文是论述创新性的成果、理论性的突破和技术方法的革 新

26、等。一般在学术刊物上发表或学术会议上交流。学术论文的篇幅远远小于学位论文，篇幅一般控制在 3000-4000 字。2. 学位论文 学位论文是为申请学位而馔写的用于答辩或评审的论文。 根据申 请学位的层次不同，学位论文可分为三种类型： 学士论文：本科生馔写，篇幅在 1 万字左右。 硕士论文：研究生馔写，篇幅在 1-5 万字。博士论文：博士生馔写，篇幅在 5 万字以上按论文的专业性质分医学论按论文的研究手段分按论文的目的功用分基础医学研究论文应用医学研究论文现况调查论文调查性研究论文 回顾性调查论文前瞻性调查论文追踪性调查论文观察性研究论文实验性研究论文 总结经验性研究论文 整理资料性研究论文 学

27、术论文 学位论文第五节 医学论文的写作格式一、医学学术论文1、前置部分：包括题目、著者、文摘及关键词1. 题目论文的题目应能够准确反映论文的主要内容和中心思想， 要求 以确切、简明、醒目的词语反映论文的主题及特定内容的逻辑组合。2. 著者著者通常包括著者姓名及工作单位，有个人与集体之分。3. 摘要摘要是对全文的提炼和压缩， 摘要可以根据原文内容压缩的程 度不同分为报道性摘要 （又称资料性摘要） 和指示性摘要 （又称简介 性摘要）。4. 关键词关键词是由全文提炼出来的单词和词组。 选用的关键词应该意 义明确，专指性强，能反映出论文中的对象、 方法和论述的主要问题。 一篇论文一般选用 3-10 个

28、关键词。2、正文部分：包括前言、材料和方法、结果、讨论、结论1. 前言前言写在正文部分的开端，前言应简明揭示论文研究的目的、背 景、范围、方法、意义等。写前言时应做到入题要快、重点要突出、 文字要精练，篇幅一般控制在 200 字左右。2. 材料和方法材料和方法是论文的主要内容 ,它包括仪器设备、 试剂药品、实验 对象、实验方法、实验程序等。 写这部分内容要求真实、 具体、可信。3. 结果结果的描写主要是摆事实，将实验室的数据、现象、结果等如实 反映，为论证提供依据，为结论打好基础。4. 讨论讨论是著者根据研究结果， 结合基础理论和前人的成果， 对该课题 作出解释和评论并提出独特的见解。 讨论要

29、有自己的见解， 分析要把 握主题，论证要有可靠的依据，评价要实事求是。5. 结论 结论是根据研究的结果和讨论所作出的论断。结论要求观点鲜明、 措辞严谨、评价恰当、文字精练。3、附属部分：包括致谢、参考文献、英文摘要1. 致谢 致谢，一般要自成一段，写在正文之后，参考文献之前。文字 要简明扼要，用词要礼貌，内容应具体。2. 参考文献 参考文献是医学论文中引用他人观点等而列出其文章的出处， 便于读者追踪查阅。列参考文献一般不超过 10 篇。参考文献的格式： 期刊著者:篇名.刊名.出版年;卷（期）: 页码 图书著者:书名. 版次.出版地:出版社,出版年: 页码3. 英文摘要 英文摘要附于文章最后，自成一段。其内容包括篇名、著者及 其工作单位、摘要内容等。撰写要求是：用词准确，造句简明，内容扼要，自成篇章。二、医学综述1、概念医学综述是查阅了医学某一专题在