版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
1、高温饲养条件下蛋鸡卵巢组织的差异mRNAs筛选分析p 打开文本图片集【摘要】:p 环境热应激是制约我国南方地区集约化家禽养殖业发展的一个重要因素,持续高温使蛋鸡出现产蛋率和蛋品质下降等问题,高温热应激是蛋鸡产业发展不能忽视的重要问题。该试验研究常温对照组和高温热应激组成年蛋鸡卵巢组织的差异mRNAs表达谱。60只26周龄成年蛋鸡随机分为常温对照组和高温热应激组,30 d后2组分别随机选用3只共6只采集卵巢組织制备HE染色组织切片并利用深度测序技术分析p mRNAs差异表达谱。相比对照组,高温组组织切片中卵泡的内容物增多,着色加深,卵泡壁增厚。测序数据统计分析p 发现,热应激处理后相比常温对照组
2、有146个mRNAs表达水平差异显著(P97(批号:BW20_10A)。1.2 仪器和试剂低温高速离心机(Sigma)、普通离心机(Sigma)、电子分析p 天平(Shimadzu)、电热鼓风干燥箱(广州吉迪)、I_53型倒置显微镜(Olympus)、切片机(Leica)、电动研磨棒(TianGen)。多聚甲醛、乙醇、异丙醇、氯仿等试剂均为国产分析p 纯产品。1.3 试验动物分组与样品采集挑选产蛋率、体重相近的26周龄蛋鸡60只,随机分为2组,对照组(CK)和热应激组(HC)各30只,采用三层阶梯式笼养,每笼2只。控制常温对照组温度为(25±1),湿度6575;高温组每天10:001
3、6:00控制温度为(32±1),其余时间温度与常温对照组相同。对照组和高温组饲喂实验室通用基础日粮6,定时投料,自由采食和饮水,每天18:00清粪,光照时间为16 h/d,光照强度为1015 l_,定期免疫。连续饲养30 d,每天18:30收集当天产鸡蛋,分别计算2组蛋鸡的平均产蛋率,30 d后2组分别随机选用蛋鸡3只,共6只,取卵巢组织于2 mL RNase-free离心管中置-80 保存备用。1.4 组织切片HE染色取样品切成大小约为0.5 cm×0.5 cm×0.5 cm的小组织块放于4PFA(多聚甲醛)固定液中固定(固定液的体积为组织块的1520倍),固定
4、24 h;再经脱水、透明、浸蜡、包埋、切片(5 m)、展片、烘干、水洗、HE染色,最后用中性树胶封片,贴上标签并编号,显微镜下观察并拍照。1.5 样品测序及数据分析p 样品送杭州联川生物有限公司测序分析p ,采用去除rRNA的建库方式进行测序分析p ,检测各样品中不同mRNAs的表达水平。首先利用Cutadapt7软件剔除测序数据中的测序载体、低质量和不能识别的碱基信号等干扰信息,获得可进一步分析p 的高质量原始测序数据。再用Bowtie28和Hat29将测序数据与鸡的基因组序列信息比对后装配出样品的转录组序列信息数据,最后利用StringTie10和Ballgown11软件计算所有mRNAs
5、的表达水平。差异mRNAs表达的数据筛选,首先利用StringTie10软件计算各mRNAs的FPKM值,再利用R软件包Ballgown11筛选差异mRNAs,筛选条件为log2(fold change)>1或者log2(fold change)<-1并且统计学差异显著(P<0.05)。2 结果与分析p 2.1 高温饲养条件对蛋鸡产蛋率和卵巢组织结构的影响连续饲养30 d,每天收集当天产鸡蛋,分别计算2组蛋鸡的平均产蛋率,对照组平均产蛋率为88.91,高温组平均产蛋率为81.34,2组数据比较差异显著(P<0.05),高温饲养条件下蛋鸡产蛋率显著下降。采集对照组和高温组
6、蛋鸡卵巢组织,制备石蜡切片进行HE染色后光学显微镜观察。在对照组卵巢切片中,卵泡内容物着色浅(图1A);而在高温组卵巢切片中,卵泡内容物着色点增多、着色加深,卵泡壁增厚明显,同样处理程序制备的切片中高温组的中小卵泡多呈不规则环形(图1B)。高温饲养条件下蛋鸡卵巢中卵泡组织结构出现异常。2.2 mRNAs差异表达谱分析p 由mRNAs在2組样品中的差异表达分析p 可知,在高温应激组中表达差异显著(P<0.05)的基因数目分别是77个上调表达、69个下调表达。对差异表达的mRNAs表达量分析p ,上调和下调的前20个基因如表1、2所示。2.3 差异表达mRNAs基因功能注释与分析p 对差异表
7、达mRNAs进行功能注释分析p 发现,在GO数据库中可以极显著(P<0.01)富集的功能群,分子功能群(molecular_function,MF)有8个,生物学过程群(biological_process,BP)有16个,细胞组分群(cellular_ponent,CC)有4个,相关的差异表达mRNAs有63个(表3)。在KEGG数据库中可以富集(P<0.05)的通路(表4)有维生素B6代谢、卵母细胞减数分裂、柠檬酸代谢(三羧酸循环)和细胞周期(编号分别是ko00750、ko04114、ko00020和ko04110),相关的差异表达mRNAs有11个。3 讨论3.1 高温饲养条
8、件影响蛋鸡的产蛋率和卵巢组织结构全球变暖是一种主要的压力环境状况,体温升高到生理恒温点以上(热应激),从而影响动物的繁殖效率,热应激对生殖功能的损伤涉及受精过程以及胚胎到胎儿发育的早晚期等阶段,这种情况对牲畜造成了巨大的经济损失12。试验中可见高温饲养条件下蛋鸡产蛋率显著下降。由于家禽具有羽毛丰厚、皮肤无汗腺、代谢旺盛、体温高等特点,其生产性能极易受到环境温度的影响,高温一直是影响家禽养殖的一个重要因素13。在高温组卵巢切片中可见卵泡内容物着色点增多,着色加深,卵泡壁增厚明显,同样处理程序制备的切片中高温组的中小卵泡多呈不规则环形。高温饲养条件下蛋鸡卵巢中卵泡组织结构出现异常,可见在高温应激组
9、中,原始卵泡的比例下降,这提示在热应激条件下饲养蛋鸡,影响卵巢功能,抑制卵泡发育。热应激影响蛋鸡的生长速度、产蛋量和生育力,环境温度过高是影响热带和亚热带国家家禽生产经济和生物效率的一个严重问题,随着全球气候变化,这一问题预计将变得更加突出,这些负面影响造成了巨大的经济损失14。3.2 高温饲养条件下蛋鸡卵巢组织差异mRNAs的通路分析p 差异mRNAs在KEGG数据库中可以富集(P<0.05)的通路有维生素B6代谢、卵母细胞减数分裂、柠檬酸代谢(三羧酸循环)和细胞周期。以上4个通路与卵子发生、卵泡发育均有密切关系。减数分裂过程需要与周期蛋白依赖激酶(CDKs)相关的特定周期蛋白参与,以
10、确保DNA复制的保真度,不同细胞周期蛋白在减数分裂中具有不同的特异性调控15。在卵母细胞减数分裂周期的不同阶段,有几种直接或间接诱导凋亡的分子16。热应激破坏牛卵母细胞的缝隙连接和卵丘功能,卵丘细胞与卵母细胞之间以及卵母细胞之间的密切联系对卵母细胞减数分裂的停止和恢复起着重要的调节作用,热应激影响卵丘细胞通讯和功能,进而影响卵母细胞减数分裂的进程17。卵母细胞与颗粒细胞之间的细胞间通讯对正常卵泡分化和卵母细胞发育至关重要,卵母细胞调节颗粒细胞内糖酵解和TCA循环的方式与颗粒细胞的数量和卵母细胞的生长发育阶段有关,卵母细胞通过调节编码糖酵解酶的基因表达水平来控制颗粒细胞的糖酵解,卵丘细胞与卵母细
11、胞之间的代谢协同性是颗粒细胞产生能量、卵母细胞与卵泡发育所必需的18。研究表明能量分子通过线粒体代谢产生足够的ATP与卵母细胞质量之间存在联系,其中脂肪酸一旦进入线粒体基质就被分解成乙酰辅酶a分子,乙酰辅酶a分子通过TCA循环和电子传递链进一步代谢产生ATP19。母体B族维生素水平可影响生育和妊娠的建立,并可以直接影响卵泡和卵母细胞的发育,研究发现在卵泡刺激素(FSH)作用下限制成年母羊日粮中维生素B12的供应影响卵泡的发育20。吡啶是维生素B6的催化活性形式,在多种细胞过程中起着至关重要的作用,吡哆醇提高了囊胚率和孵化率,体外受精过程中,吡哆醇通过增加胚胎总细胞数、降低CTSB mRNA表达
12、和凋亡率,也显著提高了胚胎的质量,可见体外受精过程中添加吡啶是提高牛卵母细胞发育能力和胚胎质量的有效手段21。可见,热应激有多种可能的作用机制,通过影响以上4种通路进而造成蛋鸡卵巢损伤、降低产蛋率。4 结论热应激造成蛋鸡卵巢损伤,常温组和高温组蛋鸡卵巢组织mRNAs表达谱组间差异表达的共有146个,差异mRNAs基因功能分析p 与热应激过程密切相关的调控通路有维生素B6代谢、卵母细胞减数分裂、柠檬酸代谢(三羧酸循环)和细胞周期共4个。该研究筛选的一批候选基因为进一步解析蛋鸡卵巢热应激的损伤机制提供了重要参考。【参考文献】:p 1 季建华,邓玲玲.20_年一季度我国蛋鸡市场分析p 及后市预测J.
13、中国禽业导刊,20_(21):24-25.2 范石军,韩友文,李德发,等.热应激对产蛋鸡自身及其后代机体组织的过氧化损伤以及抗氧化微营养素的调控效应J.中国兽医学报,20_21(2):195-199.3 LI J Y,GAO H,TIAN Z,et al.Effects of chronic heat stress on granulosa cell apoptosis and follicular atresia in mouse ovaryJ.J Anim Sci Biotechnol,20_,8(1):57-66.4 WANG Y R,CHEN K L,LI C M,et al.Heme
14、 o_ygenase 1 regulates apoptosis induced by heat stress in bovine ovarian granulosa cells via the ERK1/2 pathwayJ.J Cell Physiol,20_,234(4):3961-3972.5 楊晓岚,张敏红,冯京海,等.高温诱导蛋鸡氧化损伤及对卵泡发育的影响J.中国农业科学,20_,45(16):3391-3398.6 李光辉,钟秀伶,AAMIR NAWAB,等.姜黄素对罗曼蛋鸡血液和组织抗氧化性能的影响J.安徽农业科学,20_,46(21):96-99.7 MARTIN M.CUT
15、ADAPT removes adapter sequences from high throughput sequencing readsJ.Bioinforma action,201 17:10-12.8 LANGMEAD B,SALZBERG S L.Fast ged read alignment with Bowtie 2J.Nat Methods,20_,9(4):357-359.9 KIM D,PERTEA G,TRAPNELL C,et al.Hat2:Accurate alignment of transcriptomes in the presence of insertion
16、s,deletions and gene fusionsJ.Genome Biol,201 14(4):1-13.10 PERTEA M,PERTEA G M,ANTONESCU C M,et al.StringTie enables improved reconstruction of a transcriptome from RNA seq readsJ.Nat Biotechnol,20_,33(3):290-295.11 FRAZEE A C,PERTEA G,JAFFE A E,et al.Ballgown bridges the gap between transcriptome
17、assembly and e_pression analysisJ.Nat Biotechnol,20_,33(3):243-246.12 BONI R.Heat stress,a serious threat to reproductive function in animals and humansJ.Mol Reprod Dev,20_:1-1720_-02-05.htts:/onlinelibrary.wiley./doi/pdf/10.1002/mrd.23123.13 王澤明,董晓芳,佟建明.高温对蛋鸡的负面影响及其应对技术措施J.动物营养学报,201 25(5):932-942.
18、14 WOLC A,ARANGO J,SETTAR P,et al.Genome wide association study for heat stress induced mortality in a white egg layer lineJ.Poult Sci,20_,98(1):92-96.15 LI Y F,WANG L Y,ZHANG L L,et al.Cyclin B3 is required for metaphase to anaphase transition in oocyte meiosis IJ.J Cell Biol,20_,218(5):1553-1563.1
19、6 TIWARI M,PRASAD S,TRIPATHI A,et al.Apoptosis in mammalian oocytes:A reviewJ.Apoptosis,20_,20(8):9-1025.17 CEN K A,ABBOTT C R,RISPOLI L A,et al.Heat stress impairs gap junction munication and cumulus function of bovine oocytesJ.J Reprod Dev,20_,64(5):385-392.18 SUGIURA K,PENDOLA F L,EPPIG J J.Oocyte con
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 附件:1.1521项拟继续有效行业标准复审结论-表(征求意见稿)
- 石河子大学《药物波谱解析》2022-2023学年第一学期期末试卷
- 石河子大学《食品包装学》2022-2023学年第一学期期末试卷
- 石河子大学《计算机网络基础》2022-2023学年期末试卷
- 沈阳理工大学《弱信号检测技术》2021-2022学年第一学期期末试卷
- 沈阳理工大学《建筑节能》2023-2024学年第一学期期末试卷
- 沈阳理工大学《过程控制系统与仪表》2021-2022学年期末试卷
- 沈阳理工大学《电镀工艺》2022-2023学年期末试卷
- 沈阳理工大学《环境工程概论》2023-2024学年第一学期期末试卷
- 合同产值申报
- 建筑工程项目管理咨询招标(范本)
- 三位数除两位数的除法练习题
- 慢性胃炎的中医治疗培训课件
- Python程序设计课件第7章面向对象程序设计
- 最新爆破安全规程
- 主题班会课防盗
- 幼儿园课件《挠挠小怪物》
- 教师教案检查八大评分标准教案的评分标准
- 政府会计基础知识讲义
- 幼儿园整合式主题活动设计案例《温馨家园》
- 荒漠区生态治理(麦草沙障、植物固沙)施工方案
评论
0/150
提交评论