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文档简介
1、分子名词解释1. abundance of mRNA mRNA 丰度:每个细胞的平 均 mRNA 分子数。2. abundant mRNA 高丰度 mRNA :由少量不同种 类 mRNA 组成,每一种在细胞中出现大量拷贝。3. activator 激活因子:能激活基因表达的蛋白质,通 常是作用于启动子从而激活 RNA 聚合酶。在真核生 物细胞,它所结合的启动子序列称为应答元件。4. antisense strand ( Template strand ) 反义链 (模板链):转录过程中,根据碱基互补配对原则指 导 mRNA 合成的模板 DNA 单链。 antitermination 抗终止:转
2、录控制的一种机制, 它能防止在特定的终 止点终止,使 RNA 聚合酶能通读终止点后面的基因。5. autosplicing ( self-splicing ) 自我剪接:具有自 我催化能力 ,将自身的某些部位切除的现象称为自我 剪接。在酵母和真菌的线粒体 mRNA 和 tRNA 前体 加工、叶绿体的 tRNA 和 rRNA 前体加工、 某些细菌 病毒的 mRNA 前体加工中都发现了自我剪接现象。6. alternative splicing 可变剪接:大多数真核基因 转录产生的 mRNA 前体是按一种方式剪接产生出一 种 mRNA ,因而只产生一种蛋白质。 但有些基因产生的 mRNA 前体可按
3、不同的方式剪接,产生出两种或 更多种 mRNA ,即可变剪接。7. basal factor 基本转录因子: RNA 聚合酶在所有的 启动子上形成起始复合物所需要的一种转录因子,这 些因子称为 TFX,其中 X 是数字。8. cistron 顺反子:能够编码有功能 RNA 的 DNA 片 断,其编码的一部分 RNA 能够编码多肽链。9. coding strand ( Sense strand )编码链(有义链): 转录过程中,与 mRNA 有相同序列的 DNA 单链,它 与代表遗传密码的蛋白质序列相关。10. cis-acting site 顺式作用位点:只影响处于同一 D NA 或 RNA
4、 分子上的活性的序列,此性质通常暗示该位 点不编码蛋白质。11. cis-acting element :真核生物启动子和增强子等 是由若干 DNA 序列元件组成的,由于它们常与特定的功 能基因连锁在一起,因此被称为顺式作用元件。这些 DN A 序列组成基因转录的调控区,影响基因的表达。12. corepressor 辅阻遏物:辅阻遏物是在可阻遏系统 中产生阻遏作用的小分子物质, 多数情况是与特异的阻遏 物蛋白结合后, 参与其本身生物合成或有关代谢酶形成的 一种特异的阻遏物质。如:大肠杆菌的色氨酸合成系统的 酶系统是一种抑制性酶, 这时的辅阻遏物就是其最终产物 色氨酸本身。 色氨酸与对色氨酸操
5、纵子特异的阻遏物蛋白 结合后,就成为有活性的阻遏物,与色氨酸操纵子的操纵 基因结合后,可阻止 mRNA 的转录,因而抑制了该酶系 统的合成。13. core promoter 核心启动子:能够使 RNA 聚合酶 起始转录的最短序列, 通常比一个带有额外元件的启动子 要短得多。对于 RNA 聚合酶来说,核心启动子是能够 与基本转录装置结合,包括 InR 和 TATA 盒两个元件的 序列,通常在 40bp 左右。14. coactivator 辅激活因子、 辅激活蛋白: 激活因子与 基本转录因子相互作用所必需的一类因子,它不与 DNA 结合,却是转录的必要条件。 DNA polymerase DN
6、A 聚合酶:在 DNA 模板指导下合成子代 DNA 链的酶,主 要在修复或复制时发挥作用。15. Chromatin remodeling 染色体重塑: 通过耗能的 核小体置换或重建活动,改变染色质结构,同时伴随着某 些基因转录的激活。16. C-value :C 值是一种生物的单倍体基因组的 DNAC-value paradox C 值矛盾: 物种的 C 值与其编码潜能 之间缺乏对应关系。在某些物种中表现出 DNA 与进化程 度正相关,而在某些物种中则无此规律甚至截然相反。17. chromosome walking (染色体步移 ) :连续分离 携带重叠 DNA 序列的克隆, 使染色体大部
7、 分被覆盖。步 移通常用于获得某个感兴趣的位点。18. deoxyribonuclease脱氧核糖核酸酶 ( DNAase ):攻击 DNA 化学键的酶,可以切开单链或双链。19. exonucleases 核酸外切酶:每次可从核酸链一头切 割一个核苷酸的酶,特异性针对 DNA 或 RNA 的 5'或 3' 端。20. endonucleases 核酸内切酶:切割核酸链内的化学 键,特异性针对 RNA 或单链、双链 DNA 。21. exon 外显子:断裂基因中能够流传到成熟 RNA 中 的任意片段。22. enhancer 增强子:(位于离转录起始点较远的位置 上,具有参与、
8、激活和增强转录起始功能的序列元件。) 是一个顺式作用元件, 能够提高一些真核生物启动子的利 用率,并能够在启动子任意方向和任意位置(上游或者下 游)起作用。23. enhanceosome 增强体:转录因子与增强子相互作 用形成的复合物。24. gene 基因:能够编码有功能 RNA 的 DNA 片断, 其编码的一部分 RNA 能够编码多肽链。25. gain-of-function mutation 功能获得突变:获得 新活性的突变,显性表达。26. gratuitous inducer 安慰性诱导物:能高效诱导酶 的合成,但又不被所诱导的酶分解的分子。27. GT-AG 规则( GT-AG
9、 rule ):内含子 5'端起始的 两个碱基为 GT,3'端最后两个碱基为 AG,由于这四个碱 基的高度保守性和广泛性,因此称为 GT-AG 规则。28. Hotspot 热点:基因组中突变和重组频率偏高的位 点。29. housekeeping genes ( constitutive gene ) 管家基因(组成型基因):是维持细胞最低限度功能所必 不可少的基因,如编码组蛋白基因、 编码核糖体蛋白基因、 线粒体蛋白基因、糖酵解酶的基因等。这类基因在所有类 型的细胞中都进行表达, 因为这些基因的产物对于维持细 胞的基本结构和代谢功能是必不可少的。30. hnRNP : hn
10、RNA 的核糖体蛋白质形式,在此 hnR NA 与蛋白质形成复合物。 由于前体 mRNA 只有完成加工 成熟后才能运到细胞核外, 因此 hnRNP 只在核内发现过。31. *hnRNA ( heterogeneous nuclear RNA ) 核内 不均一 RNA 、不均一核 RNA :在真核生物中,最初转录 生成的 RNA 称为不均一核 RNA,hnRNA 是 mRNA 的未 成熟前体。32. intron ( Intervening sequence ) 内含子(插入 序列):断裂基因中,能被转录但在形成成熟 mRNA 时 会被剪除的序列。33. inducer 诱导物:通过与调控蛋白结
11、合激活基因转录 的小分子物质。34. Inr ( initiator ) 起始子: pol II 启动子中位于 -3 位到 +5 位的短保守序列 Py2CAPy5 。35. loss-of-function mutation 功能缺失突变:使基 因失活的突变,可隐性遗传。36. luxury gene 奢侈基因:即组织特异性表达的基因。 这类基因与各类细胞的特殊性有直接的关系, 是在各种组 织中进行不同的选择性表达的基因。如表皮的角蛋白基 因、肌肉细胞的肌动蛋白基因和肌球蛋白基因、红细胞的 血红蛋白基因等。37. micro DNA 微卫星 DNA : 重复序列单位长度小于 10bp 的序列。
12、38. minisatellite DNA 小卫星 DNA :重复序列单位长 度在 10-100bp 之间的序列。39. open reading frame ( ORF) 开放读码框:由编 码氨基酸的三联体组成的连续 DNA 序列,多数能翻译成 蛋白质,由起始密码子开始,终止与终止密码子。40. operator 操纵基因、操作子: DNA 分子上阻遏蛋 白的结合位点,用以阻止相邻的启动子上转录的起始。41. operon 操纵子:指包含结构基因、 操纵基因以及调 节基因的一些相邻基因组成的 DNA 片段,其中结构基因 的表达受到操纵基因的调控。42. primary transcript
13、初始转录物:与一个转录单位 相对应的未修饰 RNA 转录产物。43. positive control 正调控:一个基因只有在某一事 件发生时才能被激活开始表达。44. promoter 启动子: DNA 分子上结合 RNA 聚合酶 并形成转录起始复合物的区域, 通常位于基因的 5'上游区 域。在多数情况下还包含促进转录起始的调节蛋白的结合 位点。45. RNA polymerases RNA 聚合酶:以一条 DNA 为 模板,催化对应的 RNA 合成的聚合酶。46. Reverse transcriptase 反转录酶:以单链 RNA 为模板,催化对应的双链 DNA 合成的酶。47.
14、 Ribonucleases 核糖核酸酶( RNAase ):剪切 R NA 的酶,对单链或双链 RNA 特异性作用,可以是核酸 内切酶或核酸外切酶。48. reading frame 读框:阅读一条核苷酸的三种可能 形式之一。读框把核酸序列分成一系列连续的三联体,由 于起始位置不同,可能有三种不同的阅读结果。49. Restriction fragment length polymorphism (RFLP ) 限制性片段长度多态性:限制性内切核酸酶所 能识别的位点上的遗传性差异 (如靶位点上的碱基改变造 成的差异),这些差异使得相关限制性核酸内切酶切割核 酸产生不同长度的片段。 RFLP
15、可用于遗传作图,将基因 组与常见的遗传标记联系起来。50. ribosome-binding site 核糖体结合位点:细菌 m RNA 上含起始密码子的序列,在蛋白质合成的起始阶段, 它能与核糖体 30S 亚基相结合。51. readthrough 通读:由于模板的突变或辅助因子的 帮助, RNA 聚合酶或核糖体能忽略终止信号,而继续转 录或翻译。52. regulator gene 调控基因:能够编码一些调控因子 的基因,这些调控因子能够控制其它基因的表达。53. repressor 阻遏蛋白、 阻抑物:阻遏蛋白是基于某种 调节基因所制成的一种控制蛋白质, 在原核生物中具有抑 制特定基因(
16、群)产生特征蛋白质的作用。它能识别并结 合特定的操纵基因, 阻碍 RNA 聚合酶与启动序列的结合, 或使 RNA 聚合酶不能沿 DNA 向前移动,阻遏转录,介 导负性调节。54. response element 应答元件:能与某个(类)专 一蛋白因子结合,从而控制基因特异表达的 DNA 上游序 列。55. RNA splicing RNA 剪接: RNA 中内含子被切除的 过程,使得外显子能被连接成完整的 mRNA 。56. scarce mRNA ( complex mRNA ) 稀有 mRNA : 有大量的不同 mRNA 成分组成,每一个 mRNA 在细胞中 只有很少的拷贝,这说明了细胞
17、中 RNA 的序列复杂度。57. satellite DNA 卫星 DNA :由一个短的基本重复序 列单位组成的许多连续重复序列(相同或相似)组成。58. Shine-Dalgarno sequence SD 序列:在细菌 mR NA 起始密码子 AUG 上游 10bp 左右处,有一段富含嘌 呤的碱基序列,能与细菌 16S rRNA 的 3'端识别,帮助 从起始 AUG 处开始翻译,它是 1974 年由 J.Shine 和 L.Dalgarno 发现的,故此而命名。59. signal sequence 信号序列:蛋白质上的一段短区 域(信号肽),它负责将该蛋白质引导至内质网上进行共
18、翻译转运。60. Single-strand assimilation ( Single-strand u ptake ) 单链同化: 指 RecA 蛋白质引起 DNA 单链替换 双螺旋中其同源链的能力,即能使单链同化进双链。61. splice site 剪接位点:外显子 内含子交界处周 围的序列。62. spliceosome 剪接体:剪接所需的 snRNP 和其它 蛋白质因子所形成的复合体。63. small nuclear RNA (snRNA ) 细胞核小 RNA : 细胞核中的小分子 RNA ,一些 snRNA 参与了剪接或其他 RNA 的加工过程。64. Southern blo
19、t :指将变性 DNA 从琼脂糖凝胶转移 到硝酸纤维膜从而与 互补核算杂交的过程。65. transcript 转录物、转录本: 从 DNA 链上拷贝下来 的 RNA 产物,它可能需要进一步加工才能形成成熟 RNA 。66. transcriptome 转录组:一个细胞、组织、生物体 的全部 RNA 的集合。67. transcription 转录:以 DNA 为模板合成 RNA 的 过程。68. translation 翻译:以 mRNA 为模板合成多肽链的 过程。69. transcription unit 转录单位:指 RNA 聚合酶认识 的起始位点和终止位点之间的距离, 可能包括不止一
20、个基 因。70. trans-acting product 反式作用产物 (反式作用因 子 trans-acting factor ):能够直接或间接地识别或结 合在各类顺式作用元件核心序列上, 参与调控靶基因转录 效率的蛋白质。71. TATA box :在真核生物 RNA 聚合酶转录起始位 点上游大约 25bp 处的富含 AT 的保守区,其功能涉及 R NA 聚合酶转录的正确起始。72. trans-splicing 反式剪接:反式剪接指的是两条不 同的 mRNA 的外显子连接到一起。与正常的顺式剪接不 同,这里的两段外显子是来自不同的 RNA 的,但却可能 来自同一基因。 “经典 ”反式
21、剪接见于锥虫和线虫,蓝藻中 也见反式剪接。近期在人类身上也发现了反式剪接。73. Ti plasmid :它是土壤根瘤菌的附加体,它所带的 基因引起许多植物感染并发生冠瘿病。74. T-DNA :即土壤根瘤菌的 Ti 质粒片段,在感染时能 转到植物细胞核,它带有能转化植物细胞的基因。75. unequal crossing-over ( nonreciprocal recom bination ) 不等交换(非交互重组):发生在联会时略 有参差的两条染色体区段间的交换。 其结果使一条染色体 具有重复,而另一条染色体具有缺失。76. zoo blot 种属间印迹或 “动物园杂交 ”:用 Sout
22、her n 印迹法检测某一种属的 DNA 探针与来自多个种属基因 组 DNA 杂交的活性。? 1. (Northern blot )Northern 印迹杂交:这是一种将 RNA 从琼脂糖凝胶中转印到硝酸纤维素膜上的方法。 Northern 印迹杂交的 RNA 吸印与 Southern 印迹杂交 的 DNA 吸印方法类似, RNA 印迹技术正好与 DNA 相对 应,故被称为 Northern 印迹杂交。1. ( Southern blot )Southern 印迹杂交:是一种常用 的 DNA 定量的分子生物学方法。一般利用琼脂糖凝胶电 泳分离经限制性内切酶消化的 DNA 片段,将胶上的 DNA
23、 变性并在原位将单链 DNA 片段转移至尼龙膜或其他固相 支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构 的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而 检测特定 DNA 分子的含量。2. ( cis-acting element )顺式作用元件:存在于基因旁 侧序列中能影响基因表达的序列, 它们的作用是参与基因 表达的调控,本身不编码任何蛋白质 , 仅仅提供一个作用 位点 , 要与反式作用因子相互作用而起作用。2. ( trans-acting factor )反式作用因子: 是指能直接或 间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与 调控靶基因转录效率的蛋白质。3. ( VNT
24、R )可变数目串联重复多态性:可变数目串联 重复序列是重复单位为 924bp ,重复次数变化大, 呈高 度多态性的 DNA 序列,又称小卫星 DNA ,拷贝数 101000 不等。3. ( STR )短串联重复序列:又称微卫星 DNA ,是一类 简单的寡核苷酸串联重复序列,其重复单位为 26bp , 重复次数 1060 次左右, 其长度通常小于 150bp ,分布 在所有染色体中。4. ( viral oncogene )病毒癌基因:病毒(大多是逆转录 病毒)具有的一种可以使宿主细胞发生癌变的基因。源自 细胞中的正常基因。4. (cell-oncogene )细胞癌基因:存在于正常的细胞基因组
25、中,与病毒癌基因有同源序列,具有促进正常细胞生长、增殖、分化和发育等生理功能。在正常细胞内未激活 的细胞癌基因叫原癌基因,当其受到某些条件激活时,结 构和表达发生异常,能使细胞发生恶性转化。5. (ORF ) 开放阅读框:在 mRNA 的核苷酸序列中, 有一段序列是一个特定蛋白质多肽链的序列信息, 这一段 核苷酸序列从起始密码子开始,到终止密码子结束。 (UTR )非翻译区。是 mRNA 分子两端的非编码片段。6. ( enhancer )增强子:存在于基因组中的对基因表达 有调控作用的 DNA 调控元件。位置不定,结合转录因子 后,可增强基因表达。6. (silencer )沉默子:可降低基
26、因启动子转录活性的一段 DNA 顺式元件。与增强子作用相反。7. ( microsatellite DNA )微卫星 DNA :是一类简单的 寡核苷酸串联重复序列,其重复单位为 26bp ,重复次 数 1060 次左右, 其长度通常小于 150bp ,分布在所有 染色体中。7. ( Minisatellite DNA ) 小卫星 DNA :可变数目串联 重复序列是重复单位为 924bp ,重复次数变化大, 呈高 度多态性的 DNA 序列,拷贝数 101000 不等。8. (RFLP )限制性片段长度多态性:是指基因型之间限 制性片段长度的差异, 这种差异是由限制性酶切位点上碱 基的插入、缺失、
27、重排或点突变所引起的。用于分析相关 基因多态性的技术。即用同一种限制性内切酶,完全酶切 来源于同一物种不同个体的基因组 DNA ,从而获得长度 各异的 DNA 片段(酶切谱)。8. ( SNP )单核苷酸多态性: 不同物种、 个体基因组 DNA 序列同一位置上的单个核苷酸存在差别的现象。 有这种差 别的基因座、 DNA 序列等可作为基因组作图的标志。人 基因组上平均约每 1000 个核苷酸即可能出现 1 个单核苷 酸多态性的变化, 其中有些单核苷酸多态性可能与疾病有 关,但可能大多数与疾病无关。单核苷酸多态性是研究人 类家族和动植物品系遗传变异的重要依据。9. ( cloning vector
28、 )克隆载体:可携带插入的外源 DNA 片段并可转入受体细胞中大量扩增的 DNA 分子。该分子 中含有能够在受体细胞中自主复制的序列和筛选标记, 常 用于外源基因的克隆,如噬菌体或质粒。(expression vector )表达载体:能使插入基因进入宿 主细胞表达的克隆载体, 包括原核表达载体和真核表达载 体,可以是质粒、噬菌体或病毒等。典型的表达载体带有 能使基因表达的调控序列, 并在适当位置有可插入外源基 因的限制性内切酶位点。10. ( optional exon )外显子选择:是指在不同的剪接 方式中,某一个外显子(或几个外显子)可以在成熟的 mRNA 中保留,也可以通过剪接过程被去
29、掉。所以,至 少有两种剪接方式,一是外显子全部保留,二是删除一个或几个外显子。(optional intron )内含子选择:是指在不同的剪接方 式中,内含子可以被完全去掉,也可以有一个内含子被保 留在成熟的 mRNA 中。有两种剪接方式,一是内含子全 部删除,二是保留某一个内含子。11. ( promoter )启动子: DNA 分子上能与 RNA 聚合 酶结合并形成转录起始复合体的区域。在许多情况下,还 包括促进这一过程的调节蛋白的结合位点。( terminator )终止子:转录过程中能够终止 RNA 聚合 酶转录的 DNA 序列。使 RNA 合成终止。转录过程 产生 RNA 的一段可终
30、止转录的茎 -环结构序列; 位于模 板基因下游该结构所对应的 DNA 序列。在大肠杆菌中有 依赖于 或不依赖于 的两类终止子。12. ( leader sequence )前导序列: mRNA 5端的核苷 酸片段。位于翻译起始密码子 AUG 之前。在真核生物中 前导序列通常是不翻译的;在原核生物中,前导序列含有 的 SD 序列可与核糖体小亚基的 16S rRNA 相配对,置起 始密码子于核糖体上适当位置,以启动翻译过程。( SD sequence )SD 序列:信使核糖核酸( mRNA )翻 译起点上游与原核 16S 核糖体 RNA 或真核 18S rRNA 3端富含嘧啶的 7 核苷酸序列互补
31、的富含嘌呤的 3 7 个 核苷酸序列( AGGAGG ),是核糖体小亚基与 mRNA 结 合并形成正确的前起始复合体的一段序列。13. (gene )基因:编码蛋白质或 RNA 等具有特定功能 产物的遗传信息的基本单位,是染色体或基因组的一段 DNA 序列(对以 RNA 作为遗传信息载体的 RNA 病毒而 言则是 RNA 序列)。包括编码序列(外显子)、编码区 前后对于基因表达具有调控功能的序列和单个编码序列 间的间隔序列(内含子)。( pseudogene )假基因:基因组中存在的一段与正常基 因非常相似但不能表达的 DNA 序列。分为两大类:一类 保留了相应功能基因的间隔序列,另一类缺少间
32、隔序列, 称为加工过的假基因或返座假基因。14. (operon )操纵子:转录的功能单位。很多功能上相 关的基因前后相连成串, 由一个共同的控制区进行转录的 控制,包括结构基因以及调节基因的整个 DNA 序列。主 要见于原核生物的转录调控,如乳糖操纵子、色氨酸操纵 子等。(operator )操纵基因:与一个或者一组结构基因相邻近, 并且能够与一些特异的阻遏蛋白相互作用, 从而控制邻近 的结构基因表达的基因。15. ( gene rearrangement )基因重排:基因的可变区 通过基因的转座、 DNA 的断裂错接而使正常基因顺序发 生改变的现象。 尤指在 B 细胞分化过程中抗体基因的重排 及 T 细胞抗原受体基因的重排, 是基因差别表达的一种调 控方式。( gene replacement )基因置换
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