whonet分析汇总

1、WHONE数据分析教程汇总1. 数据分析：简介2. 数据分析：分析类型及选项3. 数据分析：每个病人 1 份结果4. 数据分析：细菌5. 数据分析：菌株6. 数据分析：数据库文件数据分析：输出数据分析：简介本教程用于 WH0NET5的数据分析：简介1. WH0NE分析目前，可应用 WHONE进行的分析分为如下 7组:菌株列表和总结表耐药、中敏、敏感率和检测结果多文件敏感率和频率分布散点图耐药谱BacTrack -菌株提示语组提示语上述每一组分析将在下面相应章节中详细描述。2. 数据分析界面打开WHONE主界面，依次单击数据分析菜单及数据分析子菜单，则打开数据分析界面，如图:该界面可分为5部分:

2、口分析类型（详见数据分析：分析类型及选项）选项（详见数据分析：分析类型及选项）每个病人（详见数据分析：每个病人 1份结果）细菌（详见数据分析：细菌 ）菌株（详见数据分析：菌株 ）数据文件（详见数据分析：数据库文件 ）口输出到（目的地）（详见 数据分析：输出 ）3. 分析步骤一旦决定要输出分析结果时，则必须指明对上述各部分析要求。某些部分的默认设置可能会满足要求。 但是，仍建议检查所有设置。这将在下面各章节中，对分析步骤加以描述。单击“开始分析”按钮开始分析过程。若已选择输出到屏幕显示，则可能要打印或保存屏幕显示结果。 若要进行更多的输出或返回数据分析界面，则单击继续按钮。单击“停止分析”按钮，

3、可中断分析。完成全部所需分析后，单击“退出”按钮，返回WHONE主界面。4. 应用其它软件分析 WHONB数据文件WHONE数据保存于dBASE格式文件。与其它数据库结构相比，尽管 dBASE有许多缺点。但其优点为：与 目前应用的分析工具兼容性更强。因此，即使要求用 WHONE以外的软件分析 WHONE数据，也可有广泛 的选择。1. 分析选项界面打开数据分析界面，单击“分析类型”按钮，打开分析选择界面，如图:该界面分为3部分：分析类型报告格式抗生素选择的分析类型不同，报告格式及抗生素部分的选项也将随之发生变化。2. 选择分析类型单击所需分析类型。我们将在下面章节中，对这些分析进行详细描述。3.

4、 选择报告格式对每一分析类型，均可有不同的报告输出格式，例如，菌株列表与总结相对，列表与制图相对。单击所需报告输出格式。4. 选择抗生素可选择和/或修改用于下述分析的抗生素：耐药、中敏、敏感率和检测结果多文件敏感率和频率分布散点图耐药谱进行“耐药谱”分析时， WHONE应用实验室设置中定义的“抗生素谱”。单击“编辑抗生素谱”按钮，可编辑“抗生素谱”。这些修改仅为临时性，退出WHONE程序时，不会被保留。进行“耐药谱”分析时，还可选择性地说明应如何选择耐药谱：选择自动，WHONE将针对所测微生物，决定耐药谱，例如，假单胞菌属抗生素即为用于假单胞菌属分离菌株分析的抗生素。选择指南，你可自行选择耐药

5、谱。通常无此必要，但可用于创建用户自定义的耐药谱，如对“MRSA或“所有氨基糖苷类抗生素”。5. 退出分析选择界面完成选择后，单击确定按钮，返回数据分析界面。6. 附加分析选项每种分析类型均有数种附加选项。我们将在下面章，对此予以描述。在数据分析界面，单击“选择”按钮，打开分析选项界面，如图:单击所需选项。单击确定按钮，可返回数据分析界面。注意，目前还不能选择某些选项，在分析选项界面，这些无法选择的选项颜色比可选选项的颜色淡。本教程用于 WH0NET5的数据分析：每个病人1份结果1. 对重复分离菌株的耐药性估计问题自同一患者可重复分离出同一病原体这可对患者人群的耐药性总体估计产生显著偏倚。若重

6、复分离频 率低，则基于分离菌株的耐药性估计更加合理。但对于重复分离频率并不低的情况，则推荐尽力进行基 于患者的耐药率估计。2. WHONE处理重复分离菌株的方法WHONE可通过下述方法处理重复分离菌株：(a) 用菌株，此为默认方法。进行耐药性估计时所有分离菌株均为平等的单一菌株。计算耐药率的分 母为分离菌株数。(b) 用病人-只分析第一个菌株(第一菌株抗生素结果)，这是处理重复分离菌株的最简单的方法，只分析每一菌种的第一个分离菌株。这一方法尤具统计学相关性。可指导对第一次感染进行的经验治疗。(c) 用病人-每种抗生素的平均耐药结果。考虑所有分离菌株。对每一患者的每一抗生素进行单独分析。计算每一

7、患者的平均耐药结果。然后，计算所有病人的平均耐药率，即为群体平均耐药率。(d) 用病人-每种抗生素最耐药的结果，考虑所有分离菌株， 对每一病人的每一抗生素进行单独分析。计算耐药率时，只应用最耐药的结果。 这一方法可用于估计自临床标本中分离出耐药菌株的病人百分比。(注意，不要与病人耐药菌株携带率相混淆，后者通常要求使用特殊的采样方案。)(e) 用病人-每种抗生素最敏感的结果，考虑所有分离菌株。 对每一病人的每一抗生素进行单独分析。计算耐药率时，只应用最敏感的结果。(f) 用病人-每种抗生素解释一种结果，考虑所有分离菌株。对每一抗生素、每一病人分离出的任一菌株的解释(RIS)计数一次。这样，若自病

8、人分离出对某一抗生素耐药的任一菌株，即对该患者计数耐 药一次，若自同一病人分离出对某一抗生素敏感的任一菌株，即对该患者计数敏感一次。这一方法计算 的结果可能会导致(R+%l+%)S>100%超过100%勺数值即提示耐药结果混杂或不一致的病人百分比。 注意，使用方法(b) - (f)计算耐药率时的分母为病人例数。3. 估计方法不同，是否产生不同的估计结果?实际上，应用方法（b） - （f）得出的结果很相仿。若菌株重复分离率低，则应用方法（a）得出的结果也应相仿。4. 确定基于病人进行耐药性估计的范围方法（d）（分析最耐药的结果）及（e）（分析最敏感的结果）可用于确定基于病人进行耐药性估计的

9、范围。 若两种方法估计结果非常接近，则应接受应用这些方法处理重复分离菌株，估计耐药率。5. 对于不同的分析类型，应选择哪种方法？选择计算耐药率的分析类型时，可选用上述方法之一。但对于耐药、中敏、敏感率和检测结果、菌株行 列表和总结表、散点图及耐药谱，目前只可选用方法（a）及（c）。6. 指明所选用的方法在数据分析界面，单击“每个病人”按钮，打开每个病人一个菌株界面，如图:选择欲选选项后，单击“确定”按钮，返回数据分析界面。本教程用于 WH0NET5的数据分析：细菌1. 细菌选择界面在数据分析界面，单击“细菌”按钮，打开细菌选择界面，如图:在该界面中，指明分析中必须包括的细菌。细菌选择界面左半部

10、分为 WHONE细菌列表，自该列表可选择细菌，并将其添加入界面右侧：分析的细菌 列表。2. WHONET田菌列表WHONE田菌列表，单击细菌组,WHONE细菌列表中列出了最常见的细菌。单击全部列表，可浏览完整的 可浏览细菌组。如“所有细菌”或“所有G+菌”。3. 选择细菌或细菌组自WHONE细菌列表中选择要包括分析的细菌，有下述3种途径：在代码框键入3个字母的细菌代码，并按“ Enter ”键；双击列表中的细菌或细菌组；或单击列表中的细菌，然后单击右向箭头。目前，尚不能保存用户自定义的细菌群。4. 将细菌作为一种菌分析系统将对你所选细菌进行单独分析。但某些情况下，可能要将细菌视为一种进行分析。

11、如肠球菌属（ent ）、粪肠球菌（efa ）、屎肠球菌（efm）、坚韧肠球菌（edu）及鸟肠球菌（eav）。单击作为一种菌来分析， 可进行这种分析。这样，进行大部分分析时，将视每一代码为一种细菌，可能时，应用适当的种特异性折点。目前，“菌株行列表和总结表”总结继续将细菌视为不同的菌种进行分析。5. 返回数据分析界面单击“确定”按钮，可返回数据分析界面。本教程用于 WH0NET5的数据分析：菌株1. 分析中包括的菌株默认状态下，WHONE将包括需要分析的细菌的所有分离菌株，除外实验室菌株和除外筛查菌株。实验室菌株定义为下述菌株：标本种类=qc （质量控制）、la （实验室）、ex （外部质控）者

12、；或科别=lab （实验室）者。筛查菌株定义为下述菌株：标本种类=sc （筛查）、mr （筛查 MRSA、vr （筛查VR日、cd （筛选艰难梭菌）但是，你可能要根据其它标准（如日期或抗生素结果）选入或排除菌株。WHONE允许你指明分析要包括的确切菌株。2. 其它选择标准说明在数据分析界面，单击“菌株”按钮，打开菌株选择界面，如图:这一界面包含了当前实验室设置中定义的所有数据字段列表，包括抗生素列表。单击要指明选择标准的数据字段，然后单击“定义标准”按钮，可打开菌株选择定义界面，如图:双击或输入代码并按回车键进行选择DEPARTMENT 专业类别Ed- O been o p niLi色冃一 塑

13、取消©该界面左侧为所选数据字段的所有值列表。你可指明要包括或排除分析的值。例如，只要排除1或2个值时，指明要排除1或2个值，比指明选入大量的值速度更快，单击包括或除外选项。指明要包括或排除分析的值，可选用下述方法：在界面左上端的框中键入项目数值代码，按“ Enter ”键；或双击代码；或单击代码后，单击右向箭头。通过下述方法，可将某一标准清除列表：单击该代码后，单击左向箭头；或双击该代码。单击“确定”按钮，返回菌株选择界面。3. 清除选择标准在菌株选择界面，单击某一数据字段后，单击清除该标准按钮，可清除该数据字段的选择标准。在菌株选择界面，单击清除所有标准按钮，可清除所有选择标准。4

14、. 合并选择标准在菌株选择界面，可指明合并选择标准的方法。例如，假定选择标准为：标本种类=血，病区=4a，则可进行下述合并选项：包括满足全部选择标准的分离菌株。分析时，只包括“标本种类=血”以及"病区=4a”的分离菌株；包括至少满足一项选择标准的分离菌株。分析时，将包括"标本种类=血”或"病区=4a”的所有分离菌株。第一种合并选项通常导致分析时包括的分离菌株数少于第二种选项。单击符合要求的合并选项。5. 包括或排除实验室菌株默认状态下，系统在分析时，将排除实验室菌株(如i节所定义者)。若要将其包括于分析中，则单击"除外实验室菌株框(Exclude lab

15、oratory isolates )"，清除选择标记。6. 包括或排除筛查菌株默认状态下，系统在分析时，将排除筛查菌株(如i节所定义者)。若要将其包括于分析中，则单击“除外筛查菌株框(Exclude screening isolates)"，清除选择标记。7. 返回数据分析界面在菌株选择界面，单击“确定”按钮，返回数据分析界面。本教程用于 WH0NET5的数据分析：数据库文件1. 分析包括的数据库文件你必须指明分析中要包括的数据库文件。你可分析来自你的或其它实验室的数据。进行这些数据分析时，WHONE将只应用当前实验室设置中定义的数据字段、抗生素及折点。若所选数据库文件信息

16、多于当前实验室设置中定义的信息，系统将忽略那些额外信息。2. 选择数据库文件在数据分析界面，单击“数据文件”按钮，打开选择数据库文件的界面，如图:选用下述方法，自界面左侧的文件列表中选择文件，并将其添加入界面右侧列表中: 口双击文件名；或单击文件名后，单击右向箭头按钮。自界面右侧列表中清除某一文件的方法包括:双击文件名；或单击文件名后，单击左向箭头按钮。3. 对每个文件分开分析当分析多个数据库文件时，WHONE通常合并为单一分析结果打印或显示。若要分开打印或显示每一数据 库文件的分析结果，则单击“每个文件分别分析”框，即可出现选择标记。4. 创建数据库文件列表若常规要分析多个数据库文件，方便的

17、方法是保存这些数据库文件的文件名。例如，作为一个国家网络 的协调人，你可能要定期分析来自许多中心的数据库文件。创建数据库文件列表，允许你在不单独地重 新选择这些数据库文件的情况下，选出所需数据文件。创建数据库文件列表时，首先在选择数据库文件界面输入要进行分析的文件列表。完成列表后，单击“保存列表”按钮，打开“另存为”界面，然后命名包含该列表的文件名。注意，在任一时间，均可检索到 这一文件，因此可获取其包含的数据库文件列表。若数据库文件与 WHONE程序保存于同一文件夹，你将无须指定文件夹名称。但是，若两者保存于不同的 文件夹，则必须指定该文件夹名称。5. 编辑数据库文件列表包含数据库文件列表的

18、文件为ASCII文件，每行显示一数据库文件名。因此，可用任一文字处理或文本编辑程序修改（或创建）列表。但需保证被编辑的文件要保存为ASCII文本格式。创建数据库文件列表的替代方法若要创建大量数据库文件列表，则可应用下述基于DOS命令的方法。假定你的实验室将每周数据保存为一数据库文件，其文件名为W99XXUSA.TST” XX数。若创建名为DATAFILE.LST并包含所有52个文件名的文件。可在 windows系统的“开始”中找到“运行”程序，打 开并输入“ cmd'命令，打开DOS命令界面，在此界面中，键入下述指令：cd d:whonet5datacd指令后面的参数，是数据库文件存放

19、的目录，该指令是进入数据库存放的目录中。再键入下述指令:DATAFILE.LSTodir w99*.tst/b > datafile.lst选项/ b可保证外部信息（如文件大小、修改日期等）不被包括于文件: 如5节中所述，可应用文本编辑程序编辑这一文件。6. 数据库文件列表的使用在选择数据文件界面，单击此文件是一“数据文件列表”框，出现选择标记后，双击数据文件列表名称, 保存于该列表中的数据库文件名即被转换为你的文件列表，进行数据分析。7. 返回数据分析界面完成用于数据分析的文件列表后，单击“确定”按钮，返回数据分析界。本教程用于 WH0NET5的数据分析：输出1. 输出目的地分析结果可

20、输出到屏幕、打印机或文件。若选择将结果显示于屏幕，浏览后，仍可进行打印或保存。这样可使你于打印前有机会检查输出结果。 若决定将结果保存于文件，则有数个文件输出格式供你选择。目前，打印图表前，先必须将其显示于屏幕。2. 指明输出目的地在数据分析界面，单击输出到，向下箭头框，选择结果输出目的地： 屏幕、打印机或输出文件格式。8个字母，继以“.”，继以扩展若选择将结果保存于文件，则必须指明文件名。文件名应较简短，最多 名，最多为3个字母。若选择两种分析报告格式，如行列表及总结，则必须输入两个文件名。3. 将分析结果输出到屏幕进行分析后，若选择将分析结果显示于屏幕，即可看到分析结果界面，如图:V.U ftMIV FTEVIMdEk IJHlBVqtlT蘊雷:a#邛常:is3hi Jmfid! 5Mt NSJI tsatC» E2* kSb-iMum碍eStIOC H典m0*3.4I'DT1krXlc iiJ kfPTiPE rp-.百LvkbMt*口列 J-ryffSfcSI個wpSV丄XiEoncihM1"""SiSTriUbt