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geo数据库使用geo数据库使用geo数据库使用geo introductiongeo数据库使用geo: gsm(样本编号)样本编号), glp(检(检测平台)测平台), gse(基因数据结果)(基因数据结果)geo数据库使用geo数据库使用geo数据库使用geo数据库使用geo数据库使用loading geo datasetgeo数据库使用gse41804_familygeo数据库使用gse41804_series_matrixgeo数据库使用基因表达的分析基因表达的分析确定要分析的基因,列出该基因mrna的ncbi标记号如nm_101523,有的基因有多个转录本,可能有多个mrna标记号。在下载的geo数据库family.soft表中搜索该基因的标记号确定该基因对应的基因芯片号。用该基因芯片号在geo数据库series_matix表中搜索该芯片号对应的所有样本的荧光信号值即基因表达值。分析不同样本中该基因的表达差异。根据样本数据确定该基因的高表达组和低表达组根据样本数据确定该基因的高表达组和低表达组,进行相应的数据分析。进行多个基因的表达相关性分析。geo数据库使用
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