NCBI序列提交方法

1、NCBI序列提交方法NCBI提交序列有两大类方式，一个是批量提交一个是单个序列提交。下面说的就是单个序列提交方式，这是最新的提交方式，由于NCBI更新很快，也许过段时间又不一样了，主要是按钮位置可能会变。首先要注册一个自己的 NCBI账号：点击此处注册welcome to Ncet1 he Habuul erWH 他 肌hjLrmo阿 I工圧n诉 drd rridlUi Uy冋 iu匕沾 b勺filWcMI *4 屮曲C忖何u；r然后登陆账号:See EOTE 3rd party sign in opfansORSign in directly to NCBIchunhuihuang0 Kep

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9、品史建议认真阅读填写要求等：点击Sig n in to use Ban kltt-ll- Idhrphucnhpw： ir 14U HAfTn 154 irfWW KflHEiBCCl itnflfn 1 poHqirDlE WUITR Mck I用 ttw 闖5纽闻 叩1庇 .-3匸iKTif r CiiMn： nri3tM：MmapntHnL* VOU IHhW aiH quMJkMt HuRme? Idiru- moire nf a Hibmucri sid to cvtinue th tU lubniEsan at a tan* tvr亡i BanMl a Ion siJbirfflm

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12、52 uommiwComplete SubmissionsIDDataSLttmitted RKOfidi Ttuti72rt04216 J&w 301122 i& ifl 匚hatL益 H r”_以下是具体提交过程:.填写基本信息Contat RrTrmcf SrqiercBia -icchiioloffiSdarnresior CatffQon- Sainr MSubmission 1885945Contact InformationFirat HWit|chynriLjeI NamBhpirUnvnCI 日和 ZlTM IinMCfS屯LSthMl al an EL Fool =ngr&

13、enrijCnuziuu5 tit? PrwirweAnrajiiZlFPMUi 04PhQHFaxnilHPit Ar ppvMr an MthSt wSdrm tOSnsurr dm mesaegri ait- r retard.ABmb Errull1.图中1是作者名字，可以添加作者名,First和Last Name，填了就可以，其他可以不填。2.图中2是填是否出版，有三个选项：未出版，正在出版，已经出版。需要注意的是，如果选则未出版， 需要在Title中注明，否则无法提交。3.可以添加作者，然后 Continue即可。quence Au竺IMiddle initialsLa it Nd

14、meII 阳IFirsT Nam*SLittii RemoveI AAAXJ 0Adj more sequence autnors.Reference Information #1Please projitle the Tide ar a relevant pubhcaDon details (voJiume. issue ete ) ot a paperPUBLICATION STATUSiinrxjbiiihpd inpuWshed - In-Press. PRercrence TitleREFERENCE AUTHORS? Specif- Nca AuthcfsAda ATWtn创 Rc

15、tcMC自 兰CaitwuT三这是选择是用生么测序方法后的的序列1. 现在我们用的一次只能测一条序列的都是San ger测序，下面的454等都代表仪器型号,是我们现在说的高通量测序，简单的书不同型号灵敏度不同。2. 这是选择你测序是一个反应还是几个反应，就是你这条序列是一个测序结果就出来了， 还是几个测序结果拼在一起得到的结果，一代测序一个反应最可信的测序范围是 50-750bP，根据实际选择，然后继续。四.填写序列信息:1.选择什么时候公布你的序列信息，你可以选怎立刻,也可以选择在以后的某一时间,如果你选择了时间，那么即使你已经上传序列， 有了序列号，在时间未到的时候你也是找不到的。2.选择

16、你的序列是不是16SrRNA基因是细菌上编码 rRNA相对应的DNA序列,可能有一个专门的库，所以一般选择NO3.选择你的序列类型,1. 我选了 cDNA ,然后选择是什么类型：是线性，我们一般的都是线状的，还是环状一般想线粒体，叶绿体或者各种质粒都是现状的。4.然后填写你上传了多少个序列,黏贴序列，注意序列一定要是 FASTA格式。你也可以选择上传文档，这个自己学。然后继续两次继续。Submission Release DateVUhrt may w r険弼 your qurice rflconl? 画 lEE品lately After Pittessingates Dn jionYYYV?

17、neb-2Diidi16S rRNA submissionsAre q|iiienC&ilii Ihls s浊mlSSifio ONL 153 rfcustiiT；al QlMA dJia? CVesSMOSequence(s) and Definftion Lme(sMolecule lyipe;(DNA to mRNA VTopology：Linear *Gwianik complatanwi;Paruai vNuctmida Saqunce and Dafmition LinssSequences ithjsl be efflered m the FASTA formal Areiher

18、 you aie subrtiitturig 呂 single sequence or multiple set Ltei iibjii jg 初Kti ji u祐d tu u磁lite! edch suence. shuiihJ be mcilddH m the FASTA fariiiJLHava tnirty nc纶crtklB iequtncti d&you inundto itnd to TTlt suDfnls9ion?Pjwte Squnw(a)aCI沪I円J JlCAAjGCrcrcfer7CAGCTAAGCTCTCCZACCAr-GC-IGCAAAGCTG A GlCGTGT

19、 CAC T CCICCCGT TAAGC TTCC CGC GGuGGC GAJAGCAAG二 1 AAgG ALXi T CGUiiCA 1 帖 G GGAAGCiACGAGtj = tiA 1E CiAGAGC bU :&GCOCC GCCGOCGACTTCGCGGC CAAGCACTACACGGACCCCCC *五.填写你上传序列所属物种。然后即使继续。GenBank SubmissionsContact Referents Seiuenzin Technolooy ruclecrtiJe OrganismSubmission # 1885945Fill in missing Orga

20、nism information :rYclj did not nciuJe me name or Lhe oigdnism rroin lAtiicri me sequence 幽出i IsoiaietJ PIOrganisiTl NameI WheatICorilifiLiel|Organ 怡 rjAn tad I Copyright j Oa(;0inier P riyac 島 cc EdibilityJfttior口 CcrtftFfcr J-iiaonro石疗 IrfoEfitisHi JS WctjQ Lisr口看：人血亡Ho 土匸L OCfVlte PItE. 毛如，阳U IJ5

21、A2LB?-=六.选择你要你的序列式原始序列，就是你自己测序的序列，还是为已有序列做注释。 然后继续。Gen Bank SubmissionsCnLact kc；Gfence iJtquening TechTKiogy Nucleotide Urganeir submissionSubmission # 11885945Submission Categoryindicant whether yQUf sequence im an original tubnilssbri or a 巾皿oa电 gnnolitr submim弓tonginaiThird Pany AnnotationDirect

22、 sequenced 巧 submimer.Denvtd Rom alher pTlnarv sequence dataiintacl 匸PT4ihft pi卑cl日iknei | Phtaizv | 曲ccc昭ibilrt”:Lfij 7;r iii m_rZitluJr lnl naiiSKl . L5 1时询出 _iD d jlVediu e :r-n匸逊飢 Ml .JSA L/L耳则七.序列信息1.填写你基因所属细胞器2. 填写你对基因的注释，可以添加选项，根据自己实际情况添加。3. 最下面可以添加你的 PCR引物，然后继续，会让你检查，你检查后继续即可。Gen 穆日 nK Submi

23、ssionsuofratT Mefwenfe ssqueficng Tecnncm MuciMotle OQanHn SdomiMn Category sourctMoailmSubmission 律 1385945Source ModifiersAaurci QrginiJlfl/LacjiHn JnformjuanChMK tfw ccritc jua.ne !c ?B；抚相n iifaup icasteOrgAntlcrLD&vPortsouiT*5*uKSrttotjirter(5i and enter watue习 herePleaM reftf to sm忙电 moan討 ii 5

24、： Tor ducnstiofi aM lamaLAOLirct modifierI BiQ_malerialwheelVflIUtKrnowieiI阳d gfiflttersoiMce rrudinerAny Olliersoufte阳刖讯加问厅列妁？眶迥For ejtarrpie Taxanomlc Classincatiori or Lineage Tor unkrKuvnniecognlzed ofnanisms. You 5twukJ citah nett 业(he lirddi label D nol enlfii JndhiFdual wur our 沁 Binission. c

25、heck Here 口IrAiEini ipj八.信息补充1.2.填加序列信息，可以上传文件，也可以选项填写，建议用选项。 选择你的信息，可以添加，然后继续PiFflfi*? prnviri*? Fdhjre notion foryciijr submission ty uhioasing pne erf Ih* twnO ACM realuies 巧 upload I nvs coluinr 曲 cue (able meAdd retiLures iby compleUrty Input rormaTills method is te&i durable for* a single Teat

26、ure or a. tew TealuneE applied on a single sequence* the same Single feature cr the same tew teaiur&i applied to al 各吉quence, it - features can be ddded across an enllre sequence ar tjy specific intervals wi -untf or nioie qudlHeis cdin be thosen Ic JtJpiy (o each feature. If 4 b not de-Q 詛d H featu

27、re, select 护mime capgory and feurp 1ype wiltiin thN category ttO coding Region I nmESSEDwr RN人10 Repeat region (for sequence repeats, nobiie elements 寸nd saielin) Reguliirorv fealure (promolr. TATA_si3nail, RBS e忙)OtherAddAddtidl |-t?ditiur*b itii bdilmyii wmovJJ NO Tealures ert&rea /elI 匚 ailkn I 亡

28、在上图中选择添加选项，会让你填写模板是正链还是负链，如果是部分序列，是哪一端，产物是指你把序列通过BlastP 比对后的到的序列号(qualifiers)和相似度(Value),然后Accept。跳转后然后继续。Features (Detail)ytddfnp PemlUF?伽e至sen叶 ftZA meswgei ntormaiion stnndT罕*口 =Partial?LJSL3HuciHDdt Inttrvjl Spjns: FnNre Sequence-.Specrfic StHins - ipeciK nucEnte numbers (thn /ciP r4uc4V3lu:FFIGHAtmore QuairfitjrsAct&pj CancelAdd ellehMliCunrenr f朋:山亡空No