乳腺癌和肺癌基因检测项目计划书

1、乳腺癌和肺癌基因检测项目计划书一 项目背景乳腺癌是女性最常见的癌种，占女性恶性肿瘤的 1/3 ，其发病率约为 30/10 万，即 每年 10万女性中有 30 位会患乳腺癌。男性也可患乳腺癌， 但比例很低，男女比例约为 1:100 。 遗传性乳腺癌占全部乳腺癌的 10% 左右， 而在遗传性乳腺癌患者中，有 50% 左右是由于 BRCA1 、BRCA2 基因突变所引起， 30%是由 ATM 、BARD1 、BRIP1 、 CDH1 、CHEK2 、 MSH6 、MRE11A 、MUTYH 、NBN 、NF1 、PALB2 、PTEN 、RAD50 、RAD51C 、STK11 、 TP53 这 1

2、6 个基因突变所致。 BRCA1 、BRCA2 基因主要功能是参与细胞 DNA 修复、蛋白 降解、 调节基因转录、调节细胞周期等， 当它们发生突变后， 细胞不能进行正常的生理活动 而发生恶性增殖，最终导致乳腺癌的发生。BRCA1 、BRCA2 基因突变的携带者一生患乳腺癌的几率可能高于 80% 。因此，对有家族史的个体（也包括男性）进行基因检测有助于乳 腺癌的早发现，早干预，早治疗。肺癌是肺部常见的恶性肿瘤，对人类健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。在男性 肿瘤中， 肺癌发病率和死亡率均占所有恶性肿瘤的第一位， 在女性肿瘤中， 肺癌的发病率和 死亡率屈居乳腺癌占第二位。目前研究已发现有数十个基因

3、与肺癌结肠癌的发生密切相关，而其中部分基因的突变 又与靶向药物治疗的效果密切相关。 如携带 EGFR 基因敏感突变的肺癌患者， 接受吉非替尼 （易瑞沙）治疗疗效显著高于化疗药物，但这类敏感人群在欧美仅约 10% ，在中国也只有 不到 40% 。又如， KRAS 基因是肿瘤生长信号通路中的一个关键基因，如果结肠癌患者是 KRAS 野生型，接受西妥昔单抗治疗后，将近70% 左右的患者会有明显获益，但如果患者携带KRAS耐药突变，则获益情况远不如传统化疗。因此，美国NCCN指南明确指出：患者在接受靶向药物治疗前应进行相关基因的检测， 据此确定是否适合用药。 因此， 对潜在风险人群进行基因检测不仅有助

4、于肺癌结肠癌的早发现早干预，对患者的靶向药物治疗也有重要的指导作用。二市场调查肿瘤的个性化用药基因检测是国家颁布的精准医疗计划重要的组成的部分，市场前景 广阔，在美国这项检查已经纳入医保计划；在中国通过前期一些公司的市场宣传市场接受度高，预计市场规模可以达到百亿的规模。市面上的主流二代测序公司都开展这项目，比较出名的是华大基因，达安基因，贝瑞 和康，诺禾致源，上海伯豪，联川基因等，这些公司基本上采用卖服务的商业模式，自己获 取标本，自己测序和分析。三技术路线1总技术路线预约取样提取DNA2.技术细节目前市场上有多种商业化的乳腺癌和肺癌基因检测试剂盒，比如：1.贝瑞和康公司贝瑞和康的 BRCA1

5、/2、PTEN、TP53基因突变检测试剂盒基于目标捕获技术, 检测人类样本中 BRCA1/2 、PTEN、TP53 这 4 个遗传性妇科肿瘤相关基因的全部外显子区域贝瑞和康 cSMART 肿瘤基因突变检测试剂盒用于非小细胞肺癌基因突变检测 ， 它采用贝瑞和康专利的 cSMART 技术，通过对外周血或肿瘤组织样本中的 DNA 片段进行标记、环化、扩增和高通量测序，并采用独特的生物信息学分析方法， 能够准确、定量地分析样本所携带的多种突变， 检测灵敏度达 3/10000 ，可协助 医生为患者筛选靶向药物。2 联川生物联川生物公司的 VariantPro TM Lung and ColonCance

6、r Panel 试剂盒并结合高通量测序平台，能快速地对肺癌结肠癌 22 个基因的热点和靶向区域进行检测，覆盖肺癌结 肠癌 22 个基因的热点和靶向区域： KRAS, EGFR, BRAF, PIK3CA, AKT1, ERBB2, PTEN, NRAS, STK11, MAP2K1, ALK, DDR2, CTNNB1, MET, TP53, SMAD4, FBXW7, FGFR3, NOTCH1, ERBB4, FGFR1, FGFR2联川生物的 VariantPro TM BRCA1 and BRCA2 Panel 试剂盒并结合高通量测序平台，能快速地对 BRCA1 和 BRCA2 基因全

7、部突变区域进行检测 从前期技术磨合的考虑，可以购买商业化成熟的试剂盒，减少摸索的时间。四 项目周期目前市场上主流的公司项目周期都是 15 天。前期样本准备 1 天文库的构建 5 天上机测序4天数据分析 4天解读报告1天五项目所需的仪器实验仪器主要用途制冰机制冰电冰箱试剂的储存咼速台式离心机试剂的离心Mini式离心机瞬离试剂旋涡式混合振荡器混匀试剂电子分析天平试剂的称量核酸检测仪核酸纯度和浓度的检测PCR仪PCR电泳仪和水平电泳槽琼脂糖凝胶电泳凝胶成像仪核酸琼脂糖凝胶电泳的检测和分析蒸汽式高压湿热消毒器试剂、实验耗材及用具的消毒电热鼓风干燥箱实验用品的干燥恒温水浴锅提供恒温环境电脑用于数据分析第二代测序仪测序六项目成本本次实验所用到的试剂和耗材的价格表如下：以乳腺癌基因检测为例:名称单价规格做一次实验的用量每次实验的价格全血基因组提1500 元天根公司，200次/盒一个反应7.5元取试剂盒采血针1元个1个1元采血费3元次1次3元琼脂糖粉70元索莱宝公司10g/瓶1g7元文库构建试剂盒（12人份）3600 元联川生物1个反应300元1.5mlLEP 管50元1袋/500个10个1元目前市场上乳腺癌 2基因检测的市场报价平均是3000元，我统计了不包括人工费,水电费，房租费，税费，测序费和分析费，做一个