SciFinder检索介绍PPT课件

1、Chemical Abstract Service化学文摘社,我们专注于：,推动研究、发展与创新 为全球科技与创新领域提供领先的、整合的，全面的信息解决方案 To encourage the increase and diffusion of chemical knowledge for the benefit of industry and education,第1页/共102页,Chemical Abstract Service化学文摘社今天：,全球最大的学协会组织 本部拥有800多博士从事文献编辑工作 为全球超过1200多个学校提供SFS桌面检索平台,第2页/共102页,通过此次培训，您

2、可以掌握,掌握SciFinder中文献检索方法与分析 掌握SciFinder中结构检索的方法与分析 掌握SciFinder中结构的设计和定义 掌握SciFInder中的反应检索与分析 了解SciFinder最新的版本SciFinder Web,第3页/共102页,提纲,SciFinder介绍 SciFinder中的检索方法 SciFinder中的文献检索与分析 SciFinder中的物质检索与分析 SciFinder中的反应检索与分析 SciFinder Web介绍,第4页/共102页,SciFinder介绍,由CAS自主开发研究的. 一站式的信息检索平台，可以检索全球最大的，有关生物化学，化

3、学，化学工程，医药等化学相关学科的信息 从中可以检索来自专利，期刊的文献 . 最大的二次文献数据库. 全球最大的物质数据库。 ,第5页/共102页,期刊,专利,论文,会议报告,溶剂，催化剂，产率等,物质,基因,合成信息,SciFinder介绍,第6页/共102页,SciFinder介绍,第7页/共102页,提纲,SciFinder介绍 SciFinder中的检索方法 SciFinder中的文献检索与分析 SciFinder中的物质检索与分析 SciFinder中的反应检索与分析 SciFinder Web介绍,第8页/共102页,SciFinder中的检索方法,主题,机构名,专利号,作者名,结

4、构，亚结构,俗名,分子式,官能团,相似结构,第9页/共102页,SciFinder中的检索方法,所以， 在SciFinder 中， 只要得到一点信息，就可以获得最为全面的 文献 物质 反应,第10页/共102页,提纲,SciFinder介绍 SciFinder中的检索方法 SciFinder中的文献检索与分析 SciFinder中的物质检索与分析 SciFinder中的反应检索与分析 SciFinder Web介绍,第11页/共102页,第12页/共102页,主题检索举例,第13页/共102页,提出问题 获得有关血清白蛋白制备的纳米颗粒的参考文献,存在问题： 主要用于哪些方面的研究 国际上哪些

5、机构的研究处于领先水平 获得和颗粒大小和形状有关的参考文献,第14页/共102页,我们用Nanoparticle with serum albumin来做初次的检索,“Closely associated with one another”表示在同一个句子当中出现,第15页/共102页,获取文摘,获取全文,分析/限定,我们注意到所列文献中出现了 Nanoparticles 这样的词 那是SciFinder能够自动识别同义词，近义词，缩写，并有截词，断词等功能,第16页/共102页,系统分类工具,第17页/共102页,一共11种分析手段,分析工具提供11种分析方法，包括索引词，作者名，机构名，文

6、献类型，期刊名称，出版年限等。 在这些分析工具中， 索引词（Index Term）：可以帮助我们对文献的内容进行大致的了解 学科分析（CA Section Title）：可以帮助我们对文献进行学科分类,第18页/共102页,一共7种限定手段,限定工具提供7种限定方法，包括主题词，作者名，机构名，文献类型等。 在这些限定工具中， 主题词（Research Topics）：可以让我们用我们关心的主题词再次限定文献 文献类型（Document Type）：可以让我们直接获得我们感兴趣的文献类型,第19页/共102页,分析工具-组织机构名分析,第20页/共102页,分析工具-出版年限分析,第21页/共

7、102页,分析工具-期刊名分析,第22页/共102页,一级目录,二级目录,点击感兴趣的二级分类，在这里可以出现一些索引词条,系统分类工具Categorize,第23页/共102页,查看更加细节的内容,第24页/共102页,第25页/共102页,文献检索小结,SciFinder 文献检索小结,向SciFinder 提一个最为广泛的问题 可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来不断的修正我们 的检索思路 可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来缩小检索的范围 可以通过SciFinder 的Analyze/Refine功能来获取新的知识点和灵感 尝试将

8、不同的Analyze/Refine功能组合起来用，会有更多的收益 使用Categorize可以让系统来实现自动分类 通过Get Related来获得更多的信息，可以实现从文献到物质，反应，引文的链接,第26页/共102页,提纲,SciFinder介绍 SciFinder中的检索方法 SciFinder中的文献检索与分析 SciFinder中的物质检索与分析 SciFinder中的反应检索与分析 SciFinder Web介绍,第27页/共102页,当我们知道一个物质的名称，CAS注册号，或者商品名，俗名等时。,第28页/共102页,第29页/共102页,第30页/共102页,如果我们知道的是物

9、质的结构或者分子式，可以,第31页/共102页,结构检索举例,第32页/共102页,结构工具,第33页/共102页,结构相关工具,铅笔,元素周期表,可变基团,重复基团工具,结构模版,橡皮,正电子,选择工具,原子锁定工具,碳链工具,常用基团,R基团定义工具,可变位置连接工具,多元环工具,旋转工具,负电子,环锁定工具,索套选择工具,第34页/共102页,精确结构检索,第35页/共102页,得到物质的盐，或者其他的混合物,第36页/共102页,但是有的时候我们需要获得一些通式结构信息,我想找到包含以下通式结构的物质,R1,R2,R3=任意基团,第37页/共102页,亚结构检索,第38页/共102页,

10、得到物质的修饰信息,33246种修饰信息,第39页/共102页,实际上 我们有的时候，更多关注的是结构上面的信息,修饰信息？ 修饰上某一特定原子后该原子的修饰信息？ ,第40页/共102页,第41页/共102页,修正结构,第42页/共102页,对所得结果再次使用真实原子附属性分析,第43页/共102页,有的时候， 我们对我们关心的结构只有一定的了解，不确定的信息太多 我们来看我们所要找的结构：,结构中含有苯环，苯环上含有一个杂环 杂环为5元环，6元环或7元环，且杂原子不能直接接在苯环上 杂环上原子必须是O或者S 苯环上与杂环相邻的位置接个Br 苯环上某2个处于间位的C必须有1个C接卤素，但是接

11、什么卤素不确定 该2个位置之间的C必须接一个基团，该基团可以是H，OH，X,第44页/共102页,得到具备一定条件的结构信息,问题： 存在多少种环结构 X= F，Cl， Br，I 分别有多少种物质 R2=H，OH，X分别有多少物质,R1= O,S R2= H,OH,X,第45页/共102页,第46页/共102页,环骨架分析,第47页/共102页,可变基团分析,第48页/共102页,R基团分析,第49页/共102页,相似结构检索,第50页/共102页,得到相似结构信息,第51页/共102页,SciFinder 的3种结构检索包容关系,精确结构检索：得到的是物质的盐，本身，聚合物，混合物 亚结构检

12、索：画出来的结构必须存在 相似结构检索：给出相似度在60分以上的物质,第52页/共102页,精确结构检索： 获得物质的盐，聚合物，混合物，配合物等，母体结构不能修改，不能修饰 亚结构检索： 所画的结构必须存在，母体结构不能修改，但可以被修饰 相似结构检索： 获得相似度在60分以上的结构，母体结构可以修改，也可以被修饰，用相似度来控制获得的结果,物质检索小结,第53页/共102页,分子式检索举例,第54页/共102页,分子式输入规则 CH写在前面，其他按照字母顺序 对于多组分物质，用“.” 将不同的组分分开 聚合物括号表示，括号外用x表示起始物，用n表示终产物 区分大小写,第55页/共102页,

13、提纲,SciFinder介绍 SciFinder中的检索方法 SciFinder中的文献检索与分析 SciFinder中的物质检索与分析 SciFinder中的反应检索与分析 SciFinder Web介绍,第56页/共102页,SciFinder 中的反应检索和分析,反应查询工具,第57页/共102页,SciFinder 中的反应检索和分析,反应位置标记工具,反应箭头,反应官能团列表,反应原子标记工具,反应角色工具,第58页/共102页,获得特定物质的合成方法,第59页/共102页,第60页/共102页,第61页/共102页,一共10种分析手段,分析工具提供反应中的催化剂（Catalyst）

14、，溶剂（Solvent），反应步数（Number of steps) ，产率( Product Yield) 等的分析,第62页/共102页,一共4种限定手段,限定工具，可以根据进一步的条件去限定反应中出现的物质（Reaction Structure),以及反应类型（Reaction Classification）等,第63页/共102页,第64页/共102页,第65页/共102页,溶剂分析,第66页/共102页,或者，有的时候我们想获得,某些官能团之间变化的反应 某些特定物质类似物的合成路线 结构中包含某些特殊结构要求的反应,拓展思路的反应检索,第67页/共102页,官能团之间的反应,第68

15、页/共102页,假如我们只想得到一步反应,第69页/共102页,假如我们规定反应物必须是乙酰氯,第70页/共102页,那么如何获得不是从乙酰氯出发的反应呢？ 让我们先返回初次检索到的683条反应。,第71页/共102页,再按照上面的检索获得从乙酰氯出发的反应，一共16条,第72页/共102页,运用Combine功能将不需要的答案集排除,第73页/共102页,第74页/共102页,第75页/共102页,检索思路回顾,获得1步从酰卤到醛的反应,限定反应物获得反应物是乙酰氯的反应,运用Combine功能将乙酰氯是产物的反应去除,第76页/共102页,COMBINE-组合答案集功能,可以对于任意两个同

16、类型的集合进行AND,OR,NOT的操作,第77页/共102页,*.SFR格式保存-书签格式保存功能,将结果保存成书签，可以使用SFS再次打开，继续进行检索，也可以对同类的书签进行COMBINE操作,第78页/共102页,获得某些物质的类似合成路线,想获得1步合成该物质的反应,第79页/共102页,亚结构反应检索,必须的条件： 羟基接的C必须是CH2 整个C链不允许是某个环结构的部分结构 其余的3个C原子链接什么基团对反应没 有影响,据此，我们修改我们的检索方式,第80页/共102页,亚结构反应检索,用环锁定功能，锁定C链，保证其不成为环结构的一部分,用原子锁定功能，锁定C原子，保证C 原子上

17、两个H不被取代,第81页/共102页,第82页/共102页,对反应位置和原子有特定要求的反应,O原子反应前后必须配对 C=O键必须发生反应 除已有的环外，不能成环,第83页/共102页,用mapping tool键标示O原子反应前后位置,用site marking tool键标示C=O键反应的位置。,用Lock out ring tool键锁定环,对反应作出条件限定,第84页/共102页,第85页/共102页,SciFinder 反应检索小结,多用Analyze/Refine，来获得催化剂，溶剂，产率等信息 如果反应只涉及基团之间的变化，用官能团反应可以获得更多的参考 信息 当无法找到具体反应

18、，或者检索结果并不满意，尝试用亚结构反应查 询，可以获得更多的参考信息,第86页/共102页,提纲,SciFinder介绍 SciFinder中的检索方法 SciFinder中的文献检索与分析 SciFinder中的物质检索与分析 SciFinder中的反应检索与分析 SciFinder Web介绍,第87页/共102页,SciFinder Web介绍,SciFinder Web是通过Web来访问SciFinder数据库的方式 友好的用户界面 更加详尽的文献信息和详尽的物质信息 即时跟踪特定研究领域的全球最新动态 永久的信息分享链接 ,第88页/共102页,SciFinder Web是通过We

19、b来访问SciFinder数据库的方式,第89页/共102页,友好的用户界面,第90页/共102页,更加详尽的文献信息和详尽的物质信息,对于苯这个物质，在哪些文献类型中有过报道,对于苯这个物质，在专利和非专利文献中的情况,第91页/共102页,即时跟踪特定研究领域的全球最新动态,第92页/共102页,永久的信息分享链接,第93页/共102页,请合理使用SciFinder !,千万不要过量下载! 只下载自己要看 的记录（缩小范围） 不要用“迅雷”，“快车”之类的工具下载记录 不使用请关闭客户端程序,一旦发生过量下载，CAS将视情节严重采取不同的限制措施 全IP范围内取消全部下载功能，包括*.SF

20、R 格式的下载 全IP范围内取消部分检索功能 情况严重的，将暂定SciFinder的使用,第94页/共102页,那么，当我们遇到大量记录时，该怎么做？,这些记录真的是我们想要的吗？ 如果真的都想要，我们需要花多少时间把这些记录全部看完？ 所以希望大家能够： 多使用Analyze/Refine工具去分析限定文献 遇到较多记录时，使用*.SFR格式保存,第95页/共102页,SciFinder Scholar的程序安装,SciFinder Scholar 客户端程序： SciFinder Scholar2007.exe 安装过程中，提示： Do you have a disk labeled Custom Site Files? （选择 No） site.prf （site）文件 只需将 site.prf 文件复制粘贴到 X:ScholarCHLR目录下 还可安装 ViewerLite用于查看3D结构,第96页/共102页,运行SciFinder Scholar,第97页/共102页,可能1：（并发用户数限制）,解决方法：请耐心等候 ！,第98页/共102页,可能2：（网络故障）,解决方法：检查网络,