医学数据管理_Epidata【稻香书屋】

1、医学研究数据管理与统计分析Data management & analysis,1,高等课堂,搜集资料,整理与分析资料,调查（研究）项目,分析表（指标,研究目的,回答,统计分析步骤,调查研究步骤,研究设计思路与数据管理分析步骤,解释、呈现结果,2,高等课堂,确定调查和研究的目的是选定研究指标的依据 研究指标又是研究目的的具体体现,一、明确调查和研究的目的,了解参数，用以说明总体。 研究变量间的关系，通过确立统计学联系来 探索病因或验证疗效等。,3,高等课堂,二、确定研究对象和观察单位,研究对象：对象来源总体是什么？ 抽样方法：如何抽样？代表性？ 观察单位：个体？群体,4,高等课堂,三、研究设计

2、类型的选择,根据研究目的选择合适的设计类型： 描述疾病的或健康状况的三间分布 探讨病因 验证预防和控制措施的效果 评价疫苗的效果 新药上市前临床试验,5,高等课堂,6,高等课堂,四、确定研究项目，拟定调查表（问卷,调查和研究项目的确定：分析项目、备选项目 调查表和原始数据记录表的设计,7,高等课堂,根据研究设计类型确定所需样本量计算公式。 相关参数： 一类错误的概率：即检验水准，越小所需样本含量越多，对于相同的检验水准，双侧检验比单侧检验所需的样本含量更大，通常取0.05。 把握度(power) 1-,一般0.8-0.9 单侧检验还是双侧检验，单侧检验所需样本量小，双侧检验所需样本量大,五、样

3、本含量的估计,8,高等课堂,常用样本含量的估计软件：EpiCalc 2000,9,高等课堂,常用软件：EPI INFO,10,高等课堂,常用软件：OPENEPI,11,高等课堂,直接观察法 采访法 包括面访、调查会及信访、电话访问等,六、原始资料的收集,原始资料的收集方式,12,高等课堂,七、调查和研究的质量控制,真实性（效度） 可靠性（信度,偏倚及其如何控制,如何评价,13,高等课堂,录入前的核对 录入计算机，建立数据库（database） Excel、Access、EpiData、STATA、SPSS、SAS软件等 录入后的核对和整理 逻辑检查、核对 排序（sorting） 建立新变量 数

4、据的编码和转换 缺失值的处理,八、 数据资料的整理,14,高等课堂,Dbase, FoxBase，Visual FoxPro，Lotus,数据录入和管理软件,15,高等课堂,用Epidata构建调查表数据库,16,高等课堂,用Epidata录入调查表,17,高等课堂,统计分析常用软件,18,高等课堂,让我们从一个简单的调查开始,研究目的：了解本班同学年龄、性别、身高等信息。 Step1: 建立调查表 文本编辑软件：Word,19,高等课堂,Step 2:调查表数据录入,20,高等课堂,EpiData软件概述,一、EpiData的设计 设计者：丹麦的Jens M、Michael Bruus和英国

5、的Mark Myatt 编程者：丹麦的Michael Bruus 开发思路和原理：基于Epi Info 6.0 二、软件下载和登记注册 下载地址：http:/www.epidata.dk/ download.htm 三、版本信息 EpiData 1.5（2001年2月22日）；EpiData 2.1a（2002年） EpiData 3.02（2004）； EpiData 3.10（NOW） 四、安装和系统要求 可在Windows 95/98/NT/2000/XP/7等操作系统下运行,21,高等课堂,EpiData软件概述,EpiData软件安装如同拷贝程序文档一样简单。例如，它可以从U盘运行，

6、并且占用内存很小（2.5M）。 由于捐助和志愿者的工作，软件免费发布,22,高等课堂,EpiData程序下载与安装,http:/www.epidata.dk,23,高等课堂,EpiData程序下载与安装,数据录入,24,高等课堂,EpiData 软件,EpiData 软件是在吸收 DOS版的Epi Info 6.0 软件优点基础上开发研制的 Windows版软件,25,高等课堂,EpiData 软件,它一方面吸收了Epi Info软件的长处，同时又极具自身特色。 与 视窗版Epi Info软件相比，占用空间小，更加简单易学，且界面友好，可以很方便的对数据进行储存、核对和管理等,26,高等课堂,

7、用EpiData软件进行数据录入和管理，将产生三种基本的文件； 每种文件具有固定的后缀，在数据录入和管理中发挥不同作用。 （1）调查表文件：后缀为.QES。通过建立调查表文件，系统根据特定规则自动定义数据文件的结构，包括变量名、变量类型和长度等，用于数据录入。 （2）数据文件：后缀为.REC。数据文件包含录入的数据信息以及已经定义好的编码，用于数据的统计分析。 （3）核对文件：后缀为.CHK。通过建立核对文件，系统将定义数据录入的有效性规则,EpiData Entry 的文件组成,27,高等课堂,EpiData Entry 的特点,调查表设计便捷 数据核查功能强大且实现简便 与调查表形式一致的

8、可视数据录入界面 数据转换功能强大,28,高等课堂,讲了半天， EpiData究竟长什么样,29,高等课堂,请打开电脑上EpiData主程序,为何我的电脑上没有欢迎使用EpiData,30,高等课堂,EpiData软件的窗口介绍,31,高等课堂,编辑过程工具条,工具栏,数据表预览,粘贴,字段编辑器,编码编辑器,32,高等课堂,调查表文件的建立,数据文件： 原始数据 文件结构（库结构） 字段名 字段类型 字段长度,调查表信息 数据文件,33,高等课堂,建立调查表文件,建立调查表文件是建立数据库、实现数据录入和管理的第一步,34,高等课堂,建立调查表文件有以下几种方法,第一种：在菜单中，点击 “文

9、件”（File）“生成调查表文件QES文件” 第二种：在工作栏的工作流程中，点击“1. 打开文件”（1.Define Data）“建立新QES文件” 第三种：在按钮栏中，点击 ,这时窗口中会在工作区显示一个空白的文档，你可以在此文档中键入调查表内容和框架，编辑完成后，将调查表文件保存，文件的扩展名统一为.QES,35,高等课堂,假定现有一调查表如下，如何建立.QES文件,调查表 姓名：_ 性别：（1）男 （2）女 身高：_._ CM 出生日期：_年_月_日,36,高等课堂,如果按原调查表格式直接建立数据库，结果会怎样,37,高等课堂,必须定义字段名和字段类型,38,高等课堂,调用字段编辑器：

10、第一种方法：直接按CTRL-Q键。 第二种方法：在编辑器工具条上点击字段编辑器图标,手工输入或使用字段编辑器,39,高等课堂,字段类型介绍,数值型字段：#，#.# ；仅接受数字和空格，不输按空格处理，分析时作缺失值处理，以“.”显示。数字位数由“#”个数决定，小数位数由小数点右边的“#”个数确定。最长可达14位，小数点按1个字符计算,40,高等课堂,文本型字段：包括三种。一种是常用的文本（或下划线、或底线）型字段：_；该型字段由连续下划线来定义，长度由下划线字符个数决定，最大值为80，空白字段（字段内容空缺）时，数据管理时将按缺失值处理。另一种为大写文本型字段,41,高等课堂,日期型字段：包括

11、两种。一种为常用日期字段：、，分美式、英式两种，输入时即进行合法性检验；只需输入日期，系统自动插入斜杠。另一种为自动日期型字段：、 ；储存或修改数据时该字段自动输入系统日期，如系统日期正确，也即当天日期,42,高等课堂,自动ID号型字段：；这是一种专用字段，用作记录识别号，文件的第一个记录为1，以后记录自动赋值顺次较前增加1，并自动保证编号的唯一性。输入数据时光标跳过此字段。如需使第一个记录号大于1，则可在“文件”菜单“选择项”中的“高级设置”中设置。 逻辑型字段（即布尔函数型字段）：；只接受Y、N、空格或回车键。后两者作缺失值处理。Y、N字符输入后即转为大写字母,43,高等课堂,我们按照这些

12、要求重新建立数据库，这次应该成功了吧,先预览一下,44,高等课堂,怎么会这样,45,高等课堂,定义字段名（Field Names,以调查表中字段的第一个词命名 （First word in question is field names） 使用 内的内容自动添加字段名（Automatic field names,46,高等课堂,定义字段名（Field Names,文件”（File）“选项”（Option）“生成REC文件”（Create data file） 在“如何生成字段名”（How to generate field names）中选择字段的命名方式,47,高等课堂,更新问题为实际文件名

13、”如果未勾选,48,高等课堂,预览显示的并非真实的字段名,如“姓名”, 真实的字段名是Field1,49,高等课堂,50,高等课堂,按 命名规则修改调查表，然后预览生成REC文件,51,高等课堂,别忘了修改“选项,否则会是这样的,52,高等课堂,制作调查表文件可用EpiData编辑器进行。 也可用Word或其它文本编辑器编写。注意，必须以纯文本格式存盘，文件后缀名必须是“.qes”。 也可在其它文本编辑器编写，再粘贴到EpiData编辑器窗口,如何编写调查表文件,53,高等课堂,编写调查表文件注意事项（一,编写过程中及时保存文件，文件类型为.qes文件。 系统只会根据“特殊符号”来定义一个输入

14、字段（包括类型和长度），并根据符号前的字符给字段命名。建议在编写过程中利用“字段快速清单”插入“特殊符号”，即：选择字段类型，定义好长度后，按“插入”图标，可避免由于“特殊符号”输入错误而不能产生有效的输入字段。 调查表用中文编写时，可用定界符（“”）将字段名定义为英文字符（英文字母或英文字母阿拉伯数字），有利于数据库的管理和其他软件的统计分析。注意：“”必须为半角型，而不能是全角型(“”,54,高等课堂,尽可能把字段定义数值型，有利于统计分析。如糖尿病史“dmhis”可定义为数值型字段，“1”表示“有”，“0”表示“无”。 调查表文件格式尽可能和原调查表一致，有利于直观录入数据。 如果用其他

15、文本编辑器编写.qes文件，在运行EpiData后，打开该.qes文件即可编辑。 调查表文件的编写是否符合要求，可通过“数据表预览”来查看,编写调查表文件注意事项（二,55,高等课堂,数据文件的产生和修改,主菜单选择数据导入/导出菜单“根据QES文件生成REC文件” 在工作过程工具条按第二个按钮“生成REC文件” 在编辑器菜单REC文件菜单选择“生成REC文件,56,高等课堂,生成REC文件,57,高等课堂,58,高等课堂,请大家根据EPIDATA建立调查表库data.qes,生成数据库，保存为data.rec,调查表 姓名：_ 性别：（1）男 （2）女 身高：_._ CM 出生日期：_年_月

16、_日,59,高等课堂,现在我们已经有了两个文件： *.QES 调查表文件 *.REC 数据文件 *.REC文件是根据QES文件生成的，用于数据录入,万一我的QES文件丢了怎么办,60,高等课堂,数据文件结构的修改,61,高等课堂,调查表结构重新修改后怎么办,数据库建立后，录入了一部分分数据，发现漏掉了一个字段，于是重新修改调查表，这里可以根据修改后的QES文件更新REC文件,62,高等课堂,我一边QQ聊天，一边录入数据，万一录错了，软件会通知我吗,嗨！有第3种人吗,63,高等课堂,核对文件的建立,核对文件：CHECK文件或 .CHK文件,范围/合法值（Range/Legal） 跳转（Jumps

17、） 必须输入（MustEnter） 重复输入（Repeat,64,高等课堂,65,高等课堂,光标悬停，会提示你命令格式,66,高等课堂,录入错误时，软件会弹出警告,67,高等课堂,试试，如果将1改为20会怎样？改为15会怎样,关键字段的定义,以编号code2为例，这个编号具有唯一性，为避免重复输入，可在CHK文件中定义： code2 KEY UNIQUE 1 MUSTENTER END,68,高等课堂,练习,请大家根据下列调查表内容，利用EPIDATA建立调查表数据库,保存为data1.qes，并生成data1.rec用于录入资料,69,高等课堂,调查表 1.地区号： N J 2.调查表编号：

18、 3. 录入ID号： 4.姓名：_ 5.性别：（1）男 （2）女 6.你吸烟吗？ （1）否跳问7 （2）是 续问6.1 6.1 你多在年龄开始吸烟的？ _ 岁 6.2 平均每天吸烟支数？ _ 支 7.身高：_._ CM 8.血压值(收缩压/舒张压)： _ /_mmHg 9.出生日期：_月_日_年 10. 你是否具有下列症状？如有请在相应症状前打勾。 咳嗽 咳痰 发热 胸痛 呼吸困难 咯血 11.调查表录入日期： _月_日_年,录入时自动编码,70,高等课堂,请大家根据data1.rec数据库，建立CHK文件，保存为data1.chk 要求： （1）地区号自动录入 （2）编号、姓名必须录入 （3

19、）性别只能填1或2 （4）是否吸烟只能填1、2或9 （5）是否吸烟能够实现跳转 （6）平均每天吸烟支数的范围在1-40之间或填99 并请尝试录入35份调查表，存盘,71,高等课堂,记录删除,此处仅是在记录加上删除标记， 彻底删除需至“工具”清理REC文件,点击,72,高等课堂,如果研究对象是（1）男性，而我却录成了（2）女性，软件好象不会弹出警告嘛,73,高等课堂,双录入核对 double entry,为了确保录入质量，可以采用双人录入法进行核对。 首先利用工具-复制REC文件结构，复制已建立好的数据库（包括CHK文件），另存为一新库，但已录入的数据不会被复制,74,高等课堂,双录入核对 do

20、uble entry,如需要，可不复制字符型变量 因为家庭住址、工作单位等很少有人愿意录入两次,75,高等课堂,两次录入的一致性检验,双轨录入完成后可进行一致检验 比较两次录入不同的地方 注意选择两数据库中的匹配字段用于比较,76,高等课堂,77,高等课堂,78,高等课堂,调查表录入两次，比较后发现错误再修改，好象太麻烦！ 有没有边录入边比较的方法,79,高等课堂,双录入实时校验,先点击工具-准备双录入实时校验,80,高等课堂,双录入实时校验,指定第1 次已录入的REC文件 创建1新的REC文件，用于双录入,81,高等课堂,双录入实时校验,应注意录入调查表的顺序,82,高等课堂,显示数据,浏览数据库,83,高等课堂,其它一些常用功能,打印调查表