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文档简介

1、应用NCBI Map viewer查找一个基因序列,生科1201班 周宇筝 吴家裕 马子良 余腾,基于人类基因组项目获得了序列数据,很多机构开始了对基因组序列的各项数据进行注释(annotation),构建人类基因组整合图谱。其中美国的 UCSC (University of California Santa Cruz) ,NCBI(National Center for Biotechnology Information)和英国的Sanger中心收录的数据最为详尽。,随着生命科学迅猛发展,数据库对于我们科研交流所需要的各项数据是十分重要的。真正有意义的不是数据,而是其背后的生物学含义。也因此

2、,学会使用各种数据库对于科研、学习和交流是至关重要的。 以上提及的几个数据库功能十分强大,本次仅展示在基因图谱中查找基因这一项用途。,基因图谱是指,对生物的基因进行鉴定,以此测定它的染色体上的特定位置,然后用图示的方式把它表示出来。,三大基因组图谱UCSC Genome Browser,NCBI Map Viewer和Ensembl Genome Browser对基因组序列的注释是目前为止最为丰富的。接下来我们将以NCBI Map Viewer(/mapview/)为例对基因IL6进行分析,查看其各项数据。,在Sequence Format(序列输出格式)后面是一个下拉式选择菜单,默认的为FASTA格式,还有一个是GenBank格式。建议大家选择GenBnak格式,因为这个格式提供了很多该基因的信息,而FA

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